Wnt信號(hào)通路相關(guān)基因多態(tài)性及基因間交互作用與漢族兒童孤獨(dú)癥的關(guān)聯(lián)研究
發(fā)布時(shí)間:2017-06-28 06:23
本文關(guān)鍵詞:Wnt信號(hào)通路相關(guān)基因多態(tài)性及基因間交互作用與漢族兒童孤獨(dú)癥的關(guān)聯(lián)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:背景 孤獨(dú)癥是一種神經(jīng)發(fā)育障礙性疾病,Wnt信號(hào)通路與神經(jīng)發(fā)育和突觸形成密切相關(guān),且該通路上的多個(gè)基因被證實(shí)與孤獨(dú)癥相關(guān)。因此,我們推測(cè),Wnt信號(hào)通路異?赡茉诠陋(dú)癥的發(fā)病機(jī)制中具有一定作用。 目的 1.探討Wnt信號(hào)通路相關(guān)基因(Wnt2、APC、DISC1、En2基因)的多態(tài)性與漢族兒童孤獨(dú)癥易感性的關(guān)聯(lián); 2.探討Wnt信號(hào)通路相關(guān)基因間的交互作用與漢族兒童孤獨(dú)癥的關(guān)聯(lián)。 方法 1.采用Illumina HumanHap CNV370-Duo芯片對(duì)278個(gè)孤獨(dú)障礙核心家系(患者及其父母)、157例孤獨(dú)障礙患者和97名正常對(duì)照進(jìn)行全基因組SNP分型,另外338名正常對(duì)照的相應(yīng)數(shù)據(jù)來源于中南大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室遺傳資源庫,從中選取Wnt信號(hào)通路4個(gè)基因(Wnt2、APC、DISC1、En2基因)76個(gè)SNPs的分型數(shù)據(jù),進(jìn)行數(shù)據(jù)篩選,采用Haploview4.2軟件對(duì)每個(gè)基因進(jìn)行單位點(diǎn)的病例-對(duì)照關(guān)聯(lián)分析和以核心家系為基礎(chǔ)的傳遞不平衡檢驗(yàn),并分別構(gòu)建單體型,進(jìn)行單體型的病例-對(duì)照關(guān)聯(lián)分析和傳遞不平衡檢驗(yàn)。 2.利用多因子降維分析方法對(duì)孤獨(dú)癥患者Wnt信號(hào)通路相關(guān)基因間的交互作用進(jìn)行分析,剔除不符合Hardy-Weiberg平衡和最小等位基因頻率0.05的位點(diǎn),以及基因分型缺失率1%的個(gè)體,共有870例研究對(duì)象的65個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)入本部分的分析。具有最大交叉驗(yàn)證一致性、最大檢驗(yàn)準(zhǔn)確度且置換檢驗(yàn)結(jié)果具有顯著性的組合,將被選擇作為基因間交互作用的最佳模型。 結(jié)果 1.Wnt2基因: (1)病例-對(duì)照關(guān)聯(lián)分析:6個(gè)SNPs(rs887574、rs2896218、rs4727847、s10487362、 rs6947329、rs2239956)進(jìn)入分析,6個(gè)位點(diǎn)的等位基因頻率及單體型頻率在孤獨(dú)癥組和對(duì)照組之間的分布差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05); (2)傳遞不平衡檢驗(yàn):5個(gè)SNPs (rs2896218、rs4727847、rs10487362、rs6947329、 rs2239956)進(jìn)入分析,5個(gè)位點(diǎn)及單體型均未檢到不平衡傳遞(P0.05)。 2.APC基因: (1)病例-對(duì)照關(guān)聯(lián)分析:4個(gè)SNPs (rs2431512、rs454886、rs2546110、rs411356)進(jìn)入分析,4個(gè)位點(diǎn)的等位基因頻率在孤獨(dú)癥組和對(duì)照組之間的分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05), rs2431512-rs454886-rs2546110-rs411356構(gòu)建的單體型AAGA頻率在兩組間的分布差異具有顯著性(χ2=4.182,P=0.041); (2)傳遞不平衡檢驗(yàn):4個(gè)SNPs (rs2431512、rs454886、rs2546110、rs411356)進(jìn)入分析,4個(gè)位點(diǎn)及單體型均未不平衡傳遞(P0.05)。 3. DISC1基因: (1)病例-對(duì)照關(guān)聯(lián)分析:54個(gè)SNPs進(jìn)入分析,5個(gè)位點(diǎn)(rs4658939, rs2793093, rs10495309, rs11122362, rs1073179)的等位基因頻率,以及4個(gè)單體型(rs4658939-rs2793093-rs10495309構(gòu)建的單體型GGG和AAG,rs9432040-rs2356606-rs11122362構(gòu)建的單體型GAA, rs9431714-rs1073179構(gòu)建的單體型GG)頻率在孤獨(dú)癥組和對(duì)照組間的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2值分別為4.704、4.915、5.568、4.043、5.183、5.315、4.467、4.043、5.183,P值分別為0.030、0.027、0.018、0.044、0.023、0.021、0.035、0.044、0.023): (2)傳遞不平衡檢驗(yàn):56個(gè)SNPs進(jìn)入分析,rs4658945位點(diǎn)的等位基因A和rs11122362位點(diǎn)的等位基因G,以及4個(gè)單體型(rs10495310-rs4658945構(gòu)建的單體型AG, rs9432040-rs2356606-rs11122362構(gòu)建的單體型GAA, rs9431714-rs1073179構(gòu)建的單體型GA, rs821613-rs821639-rs16856189構(gòu)建的單體型GAG)優(yōu)先傳遞,存在顯著性差異(χ2值分別為4.445、5.400、3.973、5.126、5.041、4.184,P值分別為0.035、0.020、0.046、0.024、0.025、0.041)。 4.En2基因: (1)病例-關(guān)聯(lián)分析:1個(gè)SNP (rs1861958)進(jìn)入分析,rs1861958的等位基因頻率在孤獨(dú)癥組和對(duì)照組之間的分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05); (2)傳遞不平衡檢驗(yàn):1個(gè)SNP (rs1861958)進(jìn)入分析,rs1861958未檢出不平衡傳遞(P0.05)。 5.MDR分析結(jié)果顯示APC基因的rs2431512位點(diǎn)和DISC1基因的rs2793102位點(diǎn)組成的兩位點(diǎn)組合是Wnt信號(hào)通路基因的最佳交互作用模型,具有最大的交叉驗(yàn)證一致性(4/10)和檢驗(yàn)準(zhǔn)確度(0.4846)。 結(jié)論 1. DISCI基因rs11122362位點(diǎn)及rs9432040-rs2356606-rs11122362構(gòu)建的單體型GAA與孤獨(dú)癥存在關(guān)聯(lián),支持DISCI基因與中國漢族兒童孤獨(dú)癥的易感性相關(guān);不支持Wnt2、APC、En2基因單核苷酸多態(tài)性與漢族兒童孤獨(dú)癥存在關(guān)聯(lián)。 2.APC基因和DISCI基因可能在漢族兒童孤獨(dú)癥的發(fā)病中存在交互作用。
【關(guān)鍵詞】:孤獨(dú)癥 Wnt信號(hào)通路 基因 多態(tài)性 關(guān)聯(lián)分析 基因間交互作用
【學(xué)位授予單位】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R749.94
【目錄】:
- 摘要5-8
- Abstract8-12
- 前言12-18
- 1.孤獨(dú)癥簡(jiǎn)介12
- 2.孤獨(dú)癥與Wnt信號(hào)通路12-16
- 3.本研究實(shí)驗(yàn)流程16-18
- 第一部分 Wnt信號(hào)通路相關(guān)基因多態(tài)性與漢族兒童孤獨(dú)癥的關(guān)聯(lián)分析18-52
- 1. 材料與方法18-26
- 2. 結(jié)果26-47
- 3. 討論47-52
- 第二部分 Wnt信號(hào)通路相關(guān)基因間的交互作用與漢族兒童孤獨(dú)癥的關(guān)聯(lián)研究52-58
- 1. 材料與方法52-55
- 2. 結(jié)果55
- 3. 討論55-58
- 小結(jié)58-59
- 參考文獻(xiàn)59-63
- 綜述:孤獨(dú)癥遺傳學(xué)研究進(jìn)展63-72
- 參考文獻(xiàn)68-72
- 附錄72-73
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表文章情況73-74
- 致謝74-75
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷75-76
- 附件76
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 郭榮;天津市5000名0~6歲兒童中兒童孤獨(dú)癥的流行病學(xué)調(diào)查[J];中國臨床康復(fù);2004年06期
2 劉靖;楊曉玲;賈美香;曲成毅;施繼良;劉鋼;王曉華;邵翠霞;;2004年北京市2-6歲兒童廣泛性發(fā)育障礙的現(xiàn)況調(diào)查[J];中國心理衛(wèi)生雜志;2007年05期
本文關(guān)鍵詞:Wnt信號(hào)通路相關(guān)基因多態(tài)性及基因間交互作用與漢族兒童孤獨(dú)癥的關(guān)聯(lián)研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):492858
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