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Wnt信號通路相關基因多態(tài)性及基因間交互作用與漢族兒童孤獨癥的關聯研究

發(fā)布時間:2017-06-28 06:23

  本文關鍵詞:Wnt信號通路相關基因多態(tài)性及基因間交互作用與漢族兒童孤獨癥的關聯研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:背景 孤獨癥是一種神經發(fā)育障礙性疾病,Wnt信號通路與神經發(fā)育和突觸形成密切相關,且該通路上的多個基因被證實與孤獨癥相關。因此,我們推測,Wnt信號通路異?赡茉诠陋毎Y的發(fā)病機制中具有一定作用。 目的 1.探討Wnt信號通路相關基因(Wnt2、APC、DISC1、En2基因)的多態(tài)性與漢族兒童孤獨癥易感性的關聯; 2.探討Wnt信號通路相關基因間的交互作用與漢族兒童孤獨癥的關聯。 方法 1.采用Illumina HumanHap CNV370-Duo芯片對278個孤獨障礙核心家系(患者及其父母)、157例孤獨障礙患者和97名正常對照進行全基因組SNP分型,另外338名正常對照的相應數據來源于中南大學醫(yī)學遺傳學國家重點實驗室遺傳資源庫,從中選取Wnt信號通路4個基因(Wnt2、APC、DISC1、En2基因)76個SNPs的分型數據,進行數據篩選,采用Haploview4.2軟件對每個基因進行單位點的病例-對照關聯分析和以核心家系為基礎的傳遞不平衡檢驗,并分別構建單體型,進行單體型的病例-對照關聯分析和傳遞不平衡檢驗。 2.利用多因子降維分析方法對孤獨癥患者Wnt信號通路相關基因間的交互作用進行分析,剔除不符合Hardy-Weiberg平衡和最小等位基因頻率0.05的位點,以及基因分型缺失率1%的個體,共有870例研究對象的65個SNP位點進入本部分的分析。具有最大交叉驗證一致性、最大檢驗準確度且置換檢驗結果具有顯著性的組合,將被選擇作為基因間交互作用的最佳模型。 結果 1.Wnt2基因: (1)病例-對照關聯分析:6個SNPs(rs887574、rs2896218、rs4727847、s10487362、 rs6947329、rs2239956)進入分析,6個位點的等位基因頻率及單體型頻率在孤獨癥組和對照組之間的分布差異均無統(tǒng)計學意義(P0.05); (2)傳遞不平衡檢驗:5個SNPs (rs2896218、rs4727847、rs10487362、rs6947329、 rs2239956)進入分析,5個位點及單體型均未檢到不平衡傳遞(P0.05)。 2.APC基因: (1)病例-對照關聯分析:4個SNPs (rs2431512、rs454886、rs2546110、rs411356)進入分析,4個位點的等位基因頻率在孤獨癥組和對照組之間的分布差異無統(tǒng)計學意義(P0.05), rs2431512-rs454886-rs2546110-rs411356構建的單體型AAGA頻率在兩組間的分布差異具有顯著性(χ2=4.182,P=0.041); (2)傳遞不平衡檢驗:4個SNPs (rs2431512、rs454886、rs2546110、rs411356)進入分析,4個位點及單體型均未不平衡傳遞(P0.05)。 3. DISC1基因: (1)病例-對照關聯分析:54個SNPs進入分析,5個位點(rs4658939, rs2793093, rs10495309, rs11122362, rs1073179)的等位基因頻率,以及4個單體型(rs4658939-rs2793093-rs10495309構建的單體型GGG和AAG,rs9432040-rs2356606-rs11122362構建的單體型GAA, rs9431714-rs1073179構建的單體型GG)頻率在孤獨癥組和對照組間的分布差異有統(tǒng)計學意義(χ2值分別為4.704、4.915、5.568、4.043、5.183、5.315、4.467、4.043、5.183,P值分別為0.030、0.027、0.018、0.044、0.023、0.021、0.035、0.044、0.023): (2)傳遞不平衡檢驗:56個SNPs進入分析,rs4658945位點的等位基因A和rs11122362位點的等位基因G,以及4個單體型(rs10495310-rs4658945構建的單體型AG, rs9432040-rs2356606-rs11122362構建的單體型GAA, rs9431714-rs1073179構建的單體型GA, rs821613-rs821639-rs16856189構建的單體型GAG)優(yōu)先傳遞,存在顯著性差異(χ2值分別為4.445、5.400、3.973、5.126、5.041、4.184,P值分別為0.035、0.020、0.046、0.024、0.025、0.041)。 4.En2基因: (1)病例-關聯分析:1個SNP (rs1861958)進入分析,rs1861958的等位基因頻率在孤獨癥組和對照組之間的分布差異無統(tǒng)計學意義(P0.05); (2)傳遞不平衡檢驗:1個SNP (rs1861958)進入分析,rs1861958未檢出不平衡傳遞(P0.05)。 5.MDR分析結果顯示APC基因的rs2431512位點和DISC1基因的rs2793102位點組成的兩位點組合是Wnt信號通路基因的最佳交互作用模型,具有最大的交叉驗證一致性(4/10)和檢驗準確度(0.4846)。 結論 1. DISCI基因rs11122362位點及rs9432040-rs2356606-rs11122362構建的單體型GAA與孤獨癥存在關聯,支持DISCI基因與中國漢族兒童孤獨癥的易感性相關;不支持Wnt2、APC、En2基因單核苷酸多態(tài)性與漢族兒童孤獨癥存在關聯。 2.APC基因和DISCI基因可能在漢族兒童孤獨癥的發(fā)病中存在交互作用。
【關鍵詞】:孤獨癥 Wnt信號通路 基因 多態(tài)性 關聯分析 基因間交互作用
【學位授予單位】:新鄉(xiāng)醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R749.94
【目錄】:
  • 摘要5-8
  • Abstract8-12
  • 前言12-18
  • 1.孤獨癥簡介12
  • 2.孤獨癥與Wnt信號通路12-16
  • 3.本研究實驗流程16-18
  • 第一部分 Wnt信號通路相關基因多態(tài)性與漢族兒童孤獨癥的關聯分析18-52
  • 1. 材料與方法18-26
  • 2. 結果26-47
  • 3. 討論47-52
  • 第二部分 Wnt信號通路相關基因間的交互作用與漢族兒童孤獨癥的關聯研究52-58
  • 1. 材料與方法52-55
  • 2. 結果55
  • 3. 討論55-58
  • 小結58-59
  • 參考文獻59-63
  • 綜述:孤獨癥遺傳學研究進展63-72
  • 參考文獻68-72
  • 附錄72-73
  • 攻讀學位期間發(fā)表文章情況73-74
  • 致謝74-75
  • 個人簡歷75-76
  • 附件76

【參考文獻】

中國期刊全文數據庫 前2條

1 郭榮;天津市5000名0~6歲兒童中兒童孤獨癥的流行病學調查[J];中國臨床康復;2004年06期

2 劉靖;楊曉玲;賈美香;曲成毅;施繼良;劉鋼;王曉華;邵翠霞;;2004年北京市2-6歲兒童廣泛性發(fā)育障礙的現況調查[J];中國心理衛(wèi)生雜志;2007年05期


  本文關鍵詞:Wnt信號通路相關基因多態(tài)性及基因間交互作用與漢族兒童孤獨癥的關聯研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:492858

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