目的采用生物信息學方法分析miR-30d-5p在注意缺陷多動障礙(ADHD)發(fā)病機制中的作用。方法通過TargetScan7.2、miRDB和miRTarBase數據庫預測miR-30d-5p的靶基因,利用Cytoscape 3.7.1軟件中的ClueGO插件對靶基因進行GO和KEGG富集分析,同時通過Cytoscape 3.7.1軟件中的STRING插件構建靶蛋白互作(PPI)網絡并篩選出核心基因,通過與ADHD gene數據庫中已驗證的ADHD相關基因對比,分析miR-30d-5p在ADHD中的作用和意義。結果 GO富集顯示miR-30d-5p靶基因定位到核質、細胞內細胞器、軸突、細胞膜等細胞結構,并在神經系統(tǒng)中廣泛參與到神經元發(fā)育、分化、神經元發(fā)生的調節(jié)、神經元投射發(fā)育、順式調控區(qū)結合及順式調控區(qū)序列特異性DNA結合等生物過程。KEGG富集顯示miR-30d-5p靶基因顯著富集在FoxO信號通路、軸突導向、海馬長時程增強和神經營養(yǎng)信號通路。NOTCH1、KRAS、SIRT1、MAPK8、SOCS3、NEDD4、SKP2、BDNF、NEDD4L、SOCS1為miR-30d-5p預測...

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【文章目錄】：
1 對象與方法
    1.1 對象
    1.2 方法
        1.2.1 miR-30-5p靶基因的預測
        1.2.2 miR-30d-5p靶基因的生物信息學分析
        1.2.3 miR-30d-5p靶基因中關鍵基因的蛋白互作網絡構建
        1.2.4 miR-30d-5p靶基因與ADHD的聯(lián)系
        1.2.5 圖像繪制
2 結果
    2.1 miR-30-5p靶基因的預測
    2.2 miR-30d-5p靶基因的GO功能和KEGG信號通路富集分析
    2.3 靶基因中關鍵基因的PPI網絡構建
    2.4 miR-30d-5p靶基因與ADHD的聯(lián)系
3 討論



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