基于生物信息學(xué)分析miR-30d-5p在注意缺陷多動(dòng)障礙發(fā)病機(jī)制中的作用
發(fā)布時(shí)間:2023-03-20 04:27
目的采用生物信息學(xué)方法分析miR-30d-5p在注意缺陷多動(dòng)障礙(ADHD)發(fā)病機(jī)制中的作用。方法通過(guò)TargetScan7.2、miRDB和miRTarBase數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)miR-30d-5p的靶基因,利用Cytoscape 3.7.1軟件中的ClueGO插件對(duì)靶基因進(jìn)行GO和KEGG富集分析,同時(shí)通過(guò)Cytoscape 3.7.1軟件中的STRING插件構(gòu)建靶蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)并篩選出核心基因,通過(guò)與ADHD gene數(shù)據(jù)庫(kù)中已驗(yàn)證的ADHD相關(guān)基因?qū)Ρ?分析miR-30d-5p在ADHD中的作用和意義。結(jié)果 GO富集顯示miR-30d-5p靶基因定位到核質(zhì)、細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞器、軸突、細(xì)胞膜等細(xì)胞結(jié)構(gòu),并在神經(jīng)系統(tǒng)中廣泛參與到神經(jīng)元發(fā)育、分化、神經(jīng)元發(fā)生的調(diào)節(jié)、神經(jīng)元投射發(fā)育、順式調(diào)控區(qū)結(jié)合及順式調(diào)控區(qū)序列特異性DNA結(jié)合等生物過(guò)程。KEGG富集顯示miR-30d-5p靶基因顯著富集在FoxO信號(hào)通路、軸突導(dǎo)向、海馬長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)和神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)信號(hào)通路。NOTCH1、KRAS、SIRT1、MAPK8、SOCS3、NEDD4、SKP2、BDNF、NEDD4L、SOCS1為miR-30d-5p預(yù)測(cè)...
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【文章目錄】:
1 對(duì)象與方法
1.1 對(duì)象
1.2 方法
1.2.1 miR-30-5p靶基因的預(yù)測(cè)
1.2.2 miR-30d-5p靶基因的生物信息學(xué)分析
1.2.3 miR-30d-5p靶基因中關(guān)鍵基因的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
1.2.4 miR-30d-5p靶基因與ADHD的聯(lián)系
1.2.5 圖像繪制
2 結(jié)果
2.1 miR-30-5p靶基因的預(yù)測(cè)
2.2 miR-30d-5p靶基因的GO功能和KEGG信號(hào)通路富集分析
2.3 靶基因中關(guān)鍵基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.4 miR-30d-5p靶基因與ADHD的聯(lián)系
3 討論
本文編號(hào):3766684
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【文章目錄】:
1 對(duì)象與方法
1.1 對(duì)象
1.2 方法
1.2.1 miR-30-5p靶基因的預(yù)測(cè)
1.2.2 miR-30d-5p靶基因的生物信息學(xué)分析
1.2.3 miR-30d-5p靶基因中關(guān)鍵基因的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
1.2.4 miR-30d-5p靶基因與ADHD的聯(lián)系
1.2.5 圖像繪制
2 結(jié)果
2.1 miR-30-5p靶基因的預(yù)測(cè)
2.2 miR-30d-5p靶基因的GO功能和KEGG信號(hào)通路富集分析
2.3 靶基因中關(guān)鍵基因的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
2.4 miR-30d-5p靶基因與ADHD的聯(lián)系
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本文編號(hào):3766684
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