抑郁障礙血漿蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)整合分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-16 14:48
抑郁障礙(MDD)是世界上非常普遍的,具有高發(fā)病率,高致殘率和高致死率的精神疾病之一。該疾病的發(fā)病因素復(fù)雜多樣,并且以長(zhǎng)期并顯著的心境低落、思維遲緩、以及言語(yǔ)動(dòng)作減少為主要臨床特征。它的致病機(jī)制目前尚未明確。在本研究中,為了鑒定出抑郁障礙患者血漿中發(fā)生改變的主要蛋白質(zhì),我們整合了蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)和前期的代謝組學(xué)研究來(lái)探索與MDD相關(guān)并且發(fā)生顯著改變的通路。通過(guò)使用同位素標(biāo)記(iTRAQ)和質(zhì)譜串聯(lián)的絕對(duì)與相對(duì)定量的蛋白組學(xué)分析手段,我們鑒定出了抑郁患者與健康對(duì)照人群血漿中表達(dá)水平發(fā)生顯著改變的蛋白質(zhì),并采用IPA(Ingenuity Pathway Analysis)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)蛋白組學(xué)和前期研究得到的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析,探索差異蛋白質(zhì)和代謝物之間可能存在的關(guān)系。最終我們共篩選出了74個(gè)差異表達(dá)蛋白。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示差異蛋白主要富集在脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝功能上,其中包括APOE,APOC4,APOA5和絲氨酸蛋白酶抑制劑SERPINA1。通過(guò)經(jīng)典通路分析,我們發(fā)現(xiàn)有顯著改變的通路與脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn),炎癥反應(yīng)和免疫調(diào)控密切相關(guān)。對(duì)整合的差異蛋白質(zhì)和代謝物的因果網(wǎng)絡(luò)分析指出磷脂代謝過(guò)程的紊亂可能對(duì)中...
【文章來(lái)源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:46 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
抑郁障礙患者鑒定出的血漿差異蛋白質(zhì)()差異蛋白質(zhì)火山圖
3.4 整合分析我們使用IPA進(jìn)行進(jìn)一步分析差異蛋白,經(jīng)典通路分析顯示出排名靠前的5條通路(圖2A)。這些通路與脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn),炎癥反應(yīng)和免疫相關(guān),包括LXR/RXR激活,急性應(yīng)急信號(hào),F(xiàn)XR/RXR激活,內(nèi)涵素介導(dǎo)的內(nèi)源信號(hào)和B細(xì)胞發(fā)育。其中作為排名最高的經(jīng)典通路,LXR/RXR激活通路對(duì)于脂質(zhì)代謝的調(diào)控,炎癥反應(yīng)和膽固醇代謝都具有重要作用。這一發(fā)現(xiàn)也與我們以往的研究結(jié)果相符[20]。因此,我們上傳了以往的基于LC-MS技術(shù)的抑郁障礙患者血漿代謝組學(xué)研究所得的脂質(zhì)代謝物表達(dá)譜數(shù)據(jù)
重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文節(jié)因子來(lái)對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)造成重要影響。已經(jīng)有研究發(fā)現(xiàn)帕金森(PD)疾病的實(shí)驗(yàn)?zāi)P椭,有一些脂質(zhì)呈現(xiàn)出普遍下調(diào)的狀態(tài)。尤其是在神經(jīng)炎癥信號(hào)通路起著重要作用的LPC(16:0)和LPC(18:1),在疾病狀態(tài)下呈現(xiàn)上調(diào)模式[27]。
本文編號(hào):3592873
【文章來(lái)源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市
【文章頁(yè)數(shù)】:46 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
抑郁障礙患者鑒定出的血漿差異蛋白質(zhì)()差異蛋白質(zhì)火山圖
3.4 整合分析我們使用IPA進(jìn)行進(jìn)一步分析差異蛋白,經(jīng)典通路分析顯示出排名靠前的5條通路(圖2A)。這些通路與脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn),炎癥反應(yīng)和免疫相關(guān),包括LXR/RXR激活,急性應(yīng)急信號(hào),F(xiàn)XR/RXR激活,內(nèi)涵素介導(dǎo)的內(nèi)源信號(hào)和B細(xì)胞發(fā)育。其中作為排名最高的經(jīng)典通路,LXR/RXR激活通路對(duì)于脂質(zhì)代謝的調(diào)控,炎癥反應(yīng)和膽固醇代謝都具有重要作用。這一發(fā)現(xiàn)也與我們以往的研究結(jié)果相符[20]。因此,我們上傳了以往的基于LC-MS技術(shù)的抑郁障礙患者血漿代謝組學(xué)研究所得的脂質(zhì)代謝物表達(dá)譜數(shù)據(jù)
重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文節(jié)因子來(lái)對(duì)中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)造成重要影響。已經(jīng)有研究發(fā)現(xiàn)帕金森(PD)疾病的實(shí)驗(yàn)?zāi)P椭,有一些脂質(zhì)呈現(xiàn)出普遍下調(diào)的狀態(tài)。尤其是在神經(jīng)炎癥信號(hào)通路起著重要作用的LPC(16:0)和LPC(18:1),在疾病狀態(tài)下呈現(xiàn)上調(diào)模式[27]。
本文編號(hào):3592873
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