目的阿爾茨海默�。ˋlzheimer‘s disease,AD）是癡呆癥最常見的病因,但其發(fā)病機(jī)制尚不明確。本研究擬通過加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)探究AD發(fā)病相關(guān)的核心靶點(diǎn)。方法 GSE36980數(shù)據(jù)集下載于高通量基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫（Gene Expression Omnibus, GEO）。首先進(jìn)行數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化,質(zhì)控和過濾,以及計(jì)算軟閾值,然后根據(jù)基因表達(dá)的相關(guān)性,聚類劃分為不同的模塊,通過計(jì)算各模塊與臨床特征的相關(guān)系數(shù),確定關(guān)鍵基因模塊。我們通過基因富集分析（Gene Ontology,GO）和通路富集分析（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）探究關(guān)鍵基因模塊中的基因功能。隨后通過STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),并使用Cytoscape軟件MCODE插件進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治龊Y選核心調(diào)控基因,最后使用GEO外部數(shù)據(jù)集GSE1297和GSE28146對(duì)核心基因進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果共表達(dá)基因共聚類27個(gè)模塊,其中6個(gè)模塊與AD發(fā)病顯著相關(guān),以此作為關(guān)鍵模塊用于下游分析。通過基因功能富集分析發(fā)現(xiàn)關(guān)鍵模塊與神經(jīng)遞質(zhì)傳遞（GO:0007268）、三... 

【文章來源】：Chinese Medical Sciences Journal. 2020,35(04)CSCD

【文章頁數(shù)】：12 頁

【文章目錄】：
MATERIALS AND METHODS
    Data source
    WGCNA analysis
    Identification of significant modules of clinical traits
    Intramodular and intermodular analysis
    Network construction
    Protein-protein interaction network construction
    Hub genes validations
    Statistical analyses
RESULTS
    Key modules of Alzheimer’s disease
    Identification of the key modules and the key trait of AD
    Intramodular analyses and intermodular analyses
    Module genes GO and KEGG analysis
    Identification of hub genes
    PPI network analysis
    Hub genes validations
DISCUSSION
Conflict of interests
Supplementary matierials



本文編號(hào)：3519421