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circHomer1在甲基苯丙胺誘導神經(jīng)元損傷中的作用及其機制

發(fā)布時間:2021-09-22 02:24
  背景:甲基苯丙胺(methamphetamine,METH)是一類常見的精神興奮性藥物,長期濫用會導致神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)生嚴重且不可避免的損傷性改變。大量研究表明,METH可誘導神經(jīng)細胞毒性損傷,包括凋亡、自噬等。但其誘導神經(jīng)元損傷的準確機制仍不明確。近年研究發(fā)現(xiàn),環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)參與神經(jīng)系統(tǒng)疾病的調(diào)控。然而,目前circRNA在METH致神經(jīng)毒性的病理過程中的作用及機制研究還相對薄弱。目的:檢測METH誘導原代腦皮層神經(jīng)元損傷中的circRNA表達譜變化;篩選潛在的參與調(diào)控METH神經(jīng)毒性過程的circRNA,預測差異表達circRNA的生物學功能;探究位于其下游的基因變化,及它們與成癮行為之間的聯(lián)系。方法:(1)METH損傷原代腦皮層神經(jīng)元后的circRNA表達譜分析結(jié)果:培養(yǎng)新生鼠腦皮層神經(jīng)元并使用合適濃度的METH進行處理并提取樣本;應用高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)檢測METH處理后的circRNA表達譜變化;對差異表達的circRNA關(guān)聯(lián)的基因進行GO分析及KEGG分析,并構(gòu)建聚類分析及火山圖分析尋找差異表達的circRNA;利用qRT-PCR對候選的c... 

【文章來源】:山東大學山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:70 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

circHomer1在甲基苯丙胺誘導神經(jīng)元損傷中的作用及其機制


圖1?METH誘導原代腦皮層神經(jīng)元損傷

長度分布,高通量,測序,綠色


?(nt)??c????…?.?-10?1??£?Ankrd11??v?31?^??|?Whscl??:-一,十必…?Rap9efe??I?LinSA??I?Homerl????戀?C1?C2?C3?T1?T2?T3??D?2.5-??r?a?—?一關(guān)??li2,0'?^?^?I?_?Control??ililil?il?ihl?ii?ft?h?y??V.?V?I?I?I?I?I?I?I?I?I?I??。,V%,?/??圖2高通量轉(zhuǎn)錄組測序明確METH處理后差異表達的circRNA。(A)我們根據(jù)測序所??得的circRNA的差異倍數(shù)(FC)及P值制作了火山圖,以P值小于0.05及FC21.5倍為??篩選界限,紅色表示上調(diào)的circRNA,綠色表示下調(diào)的circRNA。(B)我們對測序所??得circRNA的長度分布進行統(tǒng)計,橫坐標以50nt為長度間隔。(C)左側(cè)所示為測序所??有circRNA的熱圖,我們篩選了?8個circRNA如(C)右側(cè)所示,紅色表示上調(diào),綠色??表示下調(diào)。C表示對照組,T表示加藥處理組。(D)我們對篩選的circRNA及預測的??2個6?:1^八進行卩10^01檢測,結(jié)果以2-^?形式展現(xiàn)。***:表示/><0.001;****表??31??

序列,環(huán)狀,穩(wěn)定性,號外


response?to?cocaine?)之間存在聯(lián)系。??circHomerl的parent基因Homerl位于小鼠第十三號染色體上。Homerl共含12??個外顯子,其中第3,4,5,6號外顯子組成/circHomerl,且由第3號外顯子??頭與第6號外顯子尾反向剪接形成circHomerl的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。我們根據(jù)該反向剪??接位點(back-splice?junction)設計qRT-PCR特異性引物,并對擴增產(chǎn)物進行測??序發(fā)現(xiàn)其包含該位點序列,證實circHomerl的環(huán)狀結(jié)構(gòu)(圖4A)。并且,我們??通過RNase?R核酸外切酶消化實驗,發(fā)現(xiàn)circHomerl能夠耐受RNase?R消化作??用,而線性HomerlmRNA則易被消化(圖4B),進一步提TKcircHomerl穩(wěn)定??的環(huán)狀結(jié)構(gòu)特征。隨后,我們針對circHomerl的特異位點設計了熒光探針進行??FISH定位實驗。我們利用共聚焦顯微鏡觀察到circHomerl的紅色熒光主要分布??于胞質(zhì)中(圖4C)。??A?Chr13(qC3)?…一wim-一_irrr?r???■?_ir—?—?ti?■■?0???■?Mock????????'?I?—-1?_?RNase?R??E*〇n1???E?ni2?■■*■■§?■■一"W"???"?E*〇"11?Exoi.12?J?T?丨’…|??ir.?■??.^;?i?ill?I??Oi?f?i?n?f?It?i?i?^?li?i?i?i?i?H?i?f??/??c??circHomerl?DAPI?Merge??DID??圖4?circHomerl的環(huán)狀結(jié)構(gòu)及穩(wěn)定性。(A

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Circular HDAC9/microRNA-138/Sirtuin-1 Pathway Mediates Synaptic and Amyloid Precursor Protein Processing Deficits in Alzheimer’s Disease[J]. Yanjun Lu,Lu Tan,Xiong Wang.  Neuroscience Bulletin. 2019(05)
[2]中腦邊緣獎賞系統(tǒng)參與阿片類藥物成癮的環(huán)路機制[J]. 孫國林,張詠梅.  中國藥理學通報. 2019(05)
[3]甲基苯丙胺的急性和慢性作用機理的研究進展[J]. 衛(wèi)星辰,周小爽,徐嘉珂,白潔.  生命科學. 2014(09)



本文編號:3402947

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