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抑郁癥患者糞便腸道微生物的宏蛋白質(zhì)組學(xué)研究

發(fā)布時間:2020-11-22 02:45
   重癥抑郁(MDD)是一種高度流行且使人衰弱的精神疾病,其發(fā)病機制與腸道菌群失調(diào)有關(guān)。但是目前,很少有研究使用宏蛋白質(zhì)組學(xué)方法檢測MDD患者糞便微生物菌群的特征。因此,本研究進行了基于同位素標記的相對和絕對定量聯(lián)合串聯(lián)質(zhì)譜的比較宏蛋白質(zhì)組學(xué)分析,以探討MDD患者的腸道微生物的菌群特征。10名健康對照(18-56歲,5名女性,5名男性)和10名抑郁癥患者(24-65歲,5名男性,5名女性)被納入到本實驗中,質(zhì)譜鑒定到279個差異細菌蛋白(P0.05),然后這些差異細菌蛋白被用于系統(tǒng)進化分析。分析結(jié)果表明,在細菌門類的水平上,觀察到四個門類具有統(tǒng)計學(xué)差異,他們分別是變形桿菌門,厚壁菌門,放線菌門和擬桿菌門(各自為P0.05)。在細菌科類的水平上,16個細菌科類具有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。此外,279個差異細菌蛋白的蛋白相鄰類的聚簇(COGs)分析和京都基因和基因組百科全書(KEGG)通路分析表明,差異細菌蛋白的功能和代謝通路紊亂,主要涉及糖代謝和氨基酸代謝。以上結(jié)果表明,MDD患者的糞便微生物的菌群特征顯著改變,表現(xiàn)為腸道菌群的組成與功能發(fā)生紊亂。我們的研究結(jié)果,提供了一個新奇的洞察腸道微生物菌群和抑郁癥之間關(guān)系的橋梁。
【學(xué)位單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R749.4
【部分圖文】:

系統(tǒng)進化分析,細菌,擬桿菌,種屬


個細菌門類,但鑒定到的細菌肽段主要集中在四個門類種屬中,他們是擬桿菌門,??厚壁菌門,放線菌門以及變形菌門。其中,擬桿菌門是最為富集的種屬,占到了??匹配肽段的57.45%。詳細的分析結(jié)果,在圖1中展示。??Actinobacteria???189?(3.75%)??A??z?--^Bacteroidetes/Chlorobi?eroup?3060?(57.45%)??Chlamydiae/Verrucomicrobia?group????Bacteria?E**Cyanobacteria????Fibrobactf.res/Acidobacteria?group????5031?(94.46%)?§??\?/?Firmicute^??1267?(23.78%)???^??Microgenomates?^????Peregrin?ibacteria??Plarictom^^s—???Proteobacteria???49?(0.92%)??TenericutBs-^??圖1.總細菌肽段的系統(tǒng)進化分析??Figure?1.?Phylogenetic?analysis?of?q

系統(tǒng)進化分析,細菌,擬桿菌


將差異的細菌肽段進行系統(tǒng)進化分析。結(jié)果表明,差異的細菌肽段??都富集到前述的四個主要的種屬中(擬桿菌門,厚壁菌門,放線菌們以及變形菌??門)。詳細的分析結(jié)果,在圖2中展示。??Acti?聰j^^eria_?(103,?10%)??48%?)??Organism?[Bacteria??(1032)?\?(9#v?^??Finnicut^^^^?(326,33%??ProteobacfBfi。蓿?C8f0.8%)??圖2.差異細菌肽段的系統(tǒng)進化分析??Figure?2.?Phylogenetic?analysis?of?differentially?expressed?bacterial?peptides??2.3.3下調(diào)細菌肽段的系統(tǒng)進化分析??將下調(diào)的細菌肽段(455個)進行系統(tǒng)進化分析。如圖3所示,下調(diào)的細菌肽??段富集到擬桿菌門,厚壁菌門,放線菌門。其中擬桿菌門所占比重最大,達到了??86%〇??^fe^teroidetes/Chlorobi?group??Organism?(476)?[Bacteria?^??V?(455)?(40,8.8%)??'?ProteoBa5rerta-??(6^.3%)??圖3.下調(diào)細菌肽段的系統(tǒng)進化分析??

系統(tǒng)進化分析,細菌,擬桿菌


Figure?2.?Phylogenetic?analysis?of?differentially?expressed?bacterial?peptides??2.3.3下調(diào)細菌肽段的系統(tǒng)進化分析??將下調(diào)的細菌肽段(455個)進行系統(tǒng)進化分析。如圖3所示,下調(diào)的細菌肽??段富集到擬桿菌門,厚壁菌門,放線菌門。其中擬桿菌門所占比重最大,達到了??86%〇??^fe^teroidetes/Chlorobi?group??Organism?(476)?[Bacteria?^??V?(455)?(40,8.8%)??'?ProteoBa5rerta-??(6^.3%)??圖3.下調(diào)細菌肽段的系統(tǒng)進化分析??Figure?3.?Phylogenetic?analysis?of?down-regulated?bacterial?peptides??14??
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本文編號:2893982

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