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人類腸道菌群多樣性與產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2020-09-22 12:55
   目的:產(chǎn)前焦慮是孕婦在產(chǎn)前的出現(xiàn)的以焦慮情緒體驗(yàn)為主要特征,表現(xiàn)為對(duì)無(wú)明確客觀對(duì)象的緊張擔(dān)心,伴有心悸、手抖等植物神經(jīng)功能失調(diào)癥狀及運(yùn)動(dòng)性不安等表現(xiàn)的一組與現(xiàn)實(shí)基礎(chǔ)不符合并導(dǎo)致精神痛苦的疾病。產(chǎn)后抑郁是在產(chǎn)后的一段時(shí)間出現(xiàn)的以持久的心境低落,思維遲緩,意志活動(dòng)減退,伴有自卑自責(zé)、無(wú)助無(wú)望,甚至悲觀厭世,可有自殺企圖或行為等表現(xiàn)的一類心境障礙。近年來(lái),我們發(fā)現(xiàn)產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁的發(fā)病不僅與遺傳、神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)及社會(huì)環(huán)境等相關(guān),還與自主神經(jīng)系統(tǒng)、腸道微生物群等相關(guān),但暫時(shí)還沒(méi)有發(fā)現(xiàn)涉及人類的研究能明確的說(shuō)明產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁與腸道微生物之間的關(guān)系,本研究旨在了解產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁的腸道微生物結(jié)構(gòu)情況,及和產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁有明顯相關(guān)性的微生物物種。方法:本研究通過(guò)隨訪在產(chǎn)前采集1次、產(chǎn)后采集3次的被試者糞便樣品,并同時(shí)記錄被試者的人口學(xué)資料,評(píng)定SAS、HAMA、HAMD、EPDS等量表。采集到的樣品在提取DNA后進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增后的DNA序列通過(guò)Illumina高通量測(cè)序方法測(cè)定其堿基序列,提取出有效序列后行OTU聚類,并與現(xiàn)有16s數(shù)據(jù)庫(kù)行比對(duì)得到物種信息,然后進(jìn)行多樣性、物種豐度等后續(xù)分析,以了解產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁患者和健康對(duì)照組的腸道微生物結(jié)構(gòu),同時(shí)使用生物信息分析探索在門、綱、目、科、屬等分類等級(jí)上產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁與健康對(duì)照組有顯著性差異的物種。結(jié)果:研究結(jié)果表明,與健康孕婦相比,產(chǎn)前焦慮的患者Desulfovibrio(0.00138212,p0.05)、Clostridium sensu stricto(0.000491275,p0.05)、Clostridiaceae 1(0.000491275,p0.05)細(xì)菌比例增加。與同時(shí)期健康產(chǎn)婦相比,在產(chǎn)后4周時(shí)產(chǎn)后抑郁組患者Alphaproteobacteria(0.000170309,p0.05)、Oxalobacter(0.000314416,p0.05)細(xì)菌比例增加;產(chǎn)后8周時(shí)產(chǎn)后抑郁組患者Proteobacteria(0.0430095,p0.05)、Klebsiella(0.00120395,p0.05)、Coriobacteriaceae(0.00223366,p0.05)、Coriobacteriales(0.00223366,p0.05)、Rothia(0.000189960,p0.05)、Micrococcaceae(0.000189960,p0.05)、Actinomycetales(0.000235812,p0.05)、Alphaproteobacteria(0.000170309,p0.05)細(xì)菌比例增加;產(chǎn)后12周時(shí)產(chǎn)后抑郁組患者Coprobacter(0.00168999,p0.05)、Alphaproteobacteria(0.000786040,p0.05)、Holdemania(4.58523e-05,p0.05)、Erysipelotrichaceae(0.000379919,p0.05)、Erysipelotrichales(0.000379919,p0.05)、Clostridium XVIII(0.000301315,p0.05)、Erysipelotrichia(0.000379919,p0.05)、Clostridium XI(0.000170309,p0.05)、Peptostreptococcaceae(0.000170309,p0.05)細(xì)菌比例增加。在產(chǎn)后抑郁組患者在癥狀緩解后進(jìn)行前后(產(chǎn)后4、8、12周)對(duì)比,在Oribacterium(5.24027e-05,p0.05)、Peptostreptococcaceae(0.00655688,p0.05)、Aggregatibacter(3.27517e-05,p0.05)細(xì)菌在抑郁情緒緩解的后兩次隨訪中明顯下降,而Actinomycetales(0.000235812,p0.05)、Candidatus Saccharibacteria(0.000235812,p0.05)、Cyanobacteria Chloroplast(0.000170309,p0.05)、Anaerostipes(0.00108080,p0.05)、Negativicutes(0.181490,p0.05)、Acidaminococcaceae(0.115070,p0.05)則在8周抑郁情緒緩解時(shí)增加,而在12周又下降。結(jié)論:產(chǎn)前焦慮與腸道中變形菌門的Desulfovibrio、厚壁菌門的Clostridium sensu stricto細(xì)菌比例增加相關(guān);產(chǎn)后抑郁與變形菌門的Alphaproteobacteria和Oxalobacter細(xì)菌比例增加相關(guān),緩解則與厚壁菌門的Oribacterium和Peptostreptococcaceae、變形菌門的Oxalobacter、Aggregatibacter細(xì)菌比例減少相關(guān)?傊,腸道內(nèi)有害菌增加、有益菌減少可能會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁的出現(xiàn)。
【學(xué)位單位】:西南醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R749
【部分圖文】:

示意圖,引物設(shè)計(jì),示意圖,產(chǎn)物純化


引物設(shè)計(jì)合成示意圖

原理圖,測(cè)序,原理圖,聚類


西 南 醫(yī) 科 大 學(xué) 碩 士 學(xué) 位 論 文21圖 3 測(cè)序原理圖3.2.6 生物信息分析對(duì)原始數(shù)據(jù)(PE reads)進(jìn)行質(zhì)控(QC)之后,用 Usearch 軟件對(duì)數(shù)據(jù)行去嵌合體和聚類操作,其中 OTU (Operational Taxonomic Units)的聚類:在Usearch 平臺(tái)上,將序列完全一樣的 Clean Reads 根據(jù)其豐度大小進(jìn)行排序,將其中的 Singletons 過(guò)濾掉 (Singletons 可能由于測(cè)序錯(cuò)誤造成,故將這部分序列去除,不進(jìn)行后期 OTU 聚類),在相似度 97%的標(biāo)準(zhǔn)聚類,對(duì)聚類后的序列進(jìn)行嵌合體過(guò)濾后,得到用于物種分類的 OTU, 此時(shí)的每個(gè) OTU 可認(rèn)為能代表1 個(gè)物種。將所有 Clean Reads 比對(duì)到 OTU 序列上

分析流程,統(tǒng)計(jì)方法


圖4分析流程圖

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2 李再芳;人類腸道菌群多樣性與產(chǎn)前焦慮、產(chǎn)后抑郁的相關(guān)性研究[D];西南醫(yī)科大學(xué);2018年

3 李姝s

本文編號(hào):2824415


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