發(fā)布時(shí)間：2020-08-31 21:28

　　 復(fù)雜疾病是指由基因組中多個(gè)基因,往往還伴有環(huán)境因素以及其它未知因素的影響共同作用而導(dǎo)致的一類疾病的總和。常見的復(fù)雜疾病有:精神分裂癥、糖尿病視網(wǎng)膜病變、老年黃斑變性、心血管疾病等。由于目前對這類疾病的發(fā)病機(jī)制缺乏了解,因而也日益成為廣大科研工作者日益關(guān)注的焦點(diǎn)。本論文的主要工作是采用連鎖不平衡的分析方法對中國漢族人群精神分裂癥和糖尿病視網(wǎng)膜病變這兩種復(fù)雜疾病與各自易感基因之間的相關(guān)性進(jìn)行了研究。 精神分裂癥(MIM 181500)是最嚴(yán)重精神疾病之一,在世界范圍發(fā)病率為1%左右。來自雙生子,家系,寄養(yǎng)子的研究結(jié)果表明,精神分裂癥是一種復(fù)雜遺傳疾病,具有很強(qiáng)的遺傳性。 來自西班牙巴斯克地區(qū)隔離人群的精神分裂癥病例-對照分析顯示,ADRA1A啟動(dòng)子區(qū)遺傳多態(tài)性位點(diǎn)與精神分裂癥存在顯著關(guān)聯(lián)。ADRA1A定位于8p21,正好位于精神分裂癥連鎖候選區(qū)域。在該區(qū)域已報(bào)導(dǎo)了許多與精神分裂癥相關(guān)的候選基因如DRP-2, PPP3CC, NRG1以及FZD-3等。我們選擇了5個(gè)位點(diǎn),其中包括在西班牙巴斯克地區(qū)隔離人群中報(bào)導(dǎo)的兩個(gè)陽性位點(diǎn):-563G/A與-9625G/A,在總共960份病例對照組樣品中采用測序的手段進(jìn)行了連鎖不平衡分析。在基因分型與單倍型分析中結(jié)果均為陰性,因此認(rèn)為ADRA1A啟動(dòng)子區(qū)與中國漢族人群精神分裂癥不相關(guān)。 來自精神分裂癥患者尸腦的研究報(bào)告顯示,少突觸細(xì)胞/髓鞘形成相關(guān)的基因表達(dá)水平在患者腦部較正常對照有明顯降低。OLIG2是一個(gè)能夠調(diào)控下游許多與少突觸細(xì)胞/髓鞘發(fā)生相關(guān)的基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子,且OLIG2的表達(dá)水平在精神分裂癥患者體內(nèi)也明顯下降,因此,OLIG2極有可能是精神分裂癥的致病基因。我們共選擇了3個(gè)SNP位點(diǎn)在共617份病例對照組樣品中結(jié)合連接酶檢測反應(yīng)與測序的手段對該基因與精神分裂癥之間是否存在關(guān)聯(lián)進(jìn)行了連鎖不平衡分析。在研究結(jié)果中我們發(fā)現(xiàn),rs762178等位基因頻率與基因型分布在病例組和正常對照組中均有明顯差異(p0.05),由rs762178與rs1059004組成的單倍型A-T與疾病關(guān)聯(lián)呈陽性。我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果說明OLIG2是中國漢族人群中精神分裂癥的易感基因,也支持了精神分裂癥的神經(jīng)發(fā)育假說。 QKI (quaking homolog, KH domain RNA binding)在基因組上定位于染色體6q26 6q27之間,是RNA信號轉(zhuǎn)導(dǎo)與激活蛋白(STAR)家族成員之一。它在小鼠中的功能主要是控制少突觸細(xì)胞的分化與成熟,在對精神分裂癥患者尸腦的檢驗(yàn)研究中發(fā)現(xiàn),QKI的表達(dá)較正常對照呈顯著下調(diào)。因此我們假設(shè)QKI是精神分裂癥的潛在候選基因。我們共選取了7個(gè)SNP位點(diǎn)在576份病例對照組樣品中進(jìn)行了連鎖不平衡分析。在基因型與單倍型分析中檢測結(jié)果均為陰性,因此我們認(rèn)為QKI與中國漢族人群精神分裂癥發(fā)病不相關(guān)。 糖尿病視網(wǎng)膜病變(DR)是糖尿病的并發(fā)癥之一,嚴(yán)重影響人類健康和生活質(zhì)量。DR的發(fā)生和發(fā)展除與糖尿病的病程、血糖控制的情況有關(guān)外,還受一定的遺傳因素影響,很多基因的多態(tài)性導(dǎo)致了疾病的個(gè)體差異。 TNF-α是一種多功能促炎細(xì)胞因子,在DR的發(fā)病機(jī)制中有重要作用。DR患者血漿中的TNF-α水平較正常對照均明顯增加,并與DR嚴(yán)重性正相關(guān)。我們以TNF-α為研究對象,在其啟動(dòng)子區(qū)選取了3個(gè)SNP位點(diǎn)在288份病例對照組樣本中進(jìn)行連鎖不平衡分析,結(jié)果中未發(fā)現(xiàn)所選取SNP位點(diǎn)與DR之間存在相關(guān)性,說明TNF-α啟動(dòng)子區(qū)在中國漢族人群中不是DR的疾病易感區(qū)域。 附章內(nèi)容是關(guān)于AMLR即等位基因特異性連接酶檢測反應(yīng)技術(shù)開發(fā)的研究工作,該項(xiàng)技術(shù)主要基于多重PCR的方法對特定位點(diǎn)同時(shí)擴(kuò)增,以擴(kuò)增產(chǎn)物為模板使對應(yīng)特定等位基因型的引物探針在連接酶的作用下連接,然后通過檢測連接所得到產(chǎn)物片段的長度同時(shí)對多個(gè)不同SNP位點(diǎn)分型的目的。我們相信這種方法將在基因分型領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用。
【學(xué)位單位】：上海交通大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位年份】：2009
【中圖分類】：R749.3;R587.1;R774.1
【部分圖文】：

圖 1-2 D’和 r2與物理距離的關(guān)系Figure 1-2 Relationship between D’& r2value and the physical distance of alleles1.2.2.2 連鎖不平衡分析的不足連鎖不平衡分析是目前復(fù)雜疾病遺傳研究最重要的工具之一，但同連鎖分析一樣連鎖不平衡分析也遇到在不同研究中難以重復(fù)的情況[28]。這其中有樣本容量，人群層化遺傳多態(tài)性的選擇等實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)上的問題，有統(tǒng)計(jì)、分型錯(cuò)誤等操作方面的問題，也有復(fù)雜疾病在不同人群間遺傳異質(zhì)性的影響。目前這一問題還沒有有效的解決方案。對于連鎖不平衡分析，遺傳多態(tài)性之間的 LD 是一把雙刃劍，一方面 LD 幫助研究者通過較少的遺傳標(biāo)記對致病位點(diǎn)定位，另一方面，LD 對于尋找“真正的”治病位點(diǎn)也是一種阻礙，很多情況下，人們很難區(qū)分參與疾病風(fēng)險(xiǎn)的致病位點(diǎn)和僅僅與之處于緊密LD 的多態(tài)性。

為復(fù)雜疾病的遺傳分析提供強(qiáng)有力的工具[30]（圖 1-3）。隨著基因分型技術(shù)的展，出現(xiàn)了 Genome-Wide Human SNPArray 6.0 （Affymatrix）、Illumina 等可以對大SNP 進(jìn)行分型的技術(shù)，使全基因組關(guān)聯(lián)分析成為了可能。然而，如何針對全基因組關(guān)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析則是一大挑戰(zhàn)，由于需要對以十萬計(jì)的位點(diǎn)進(jìn)行分析，期間自然出大量的獨(dú)立檢驗(yàn)，因而會(huì)產(chǎn)生大量的假陽性結(jié)果。如果采用保守的 Bonferroni 校正的話那對在使用一百萬 SNP 進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析的研究而言，一個(gè)低頻等位基因型頻為 15%，比值比（Odds Ratio）為 1.25 的位點(diǎn)，需要 6000 個(gè)病例和 6000 個(gè)對照才能供 0.8 的檢測效力[30]。這就需要總計(jì) 120 億次基因分型，幾乎沒有現(xiàn)實(shí)的可行性。因此如何在保證足夠檢測效力的情況下防止假陽性產(chǎn)生，是進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析不得不對的問題，也是目前一些統(tǒng)計(jì)學(xué)家努力的方向。

他們真正的興趣所在不僅僅是今后的風(fēng)險(xiǎn)評估，還包括長期的臨床應(yīng)用——通過計(jì)治療方法和藥物，最終戰(zhàn)勝疾病。許多新確定的基因都是不包括在“候選基因”目錄內(nèi)的，而是在基因組的擴(kuò)展區(qū)域或者基因之間的調(diào)控區(qū)域，這些發(fā)現(xiàn)都有望為研究人指明新的方向，并且利用這些基因作為新的標(biāo)靶，進(jìn)行藥物開發(fā)。毫無疑問，科學(xué)家要在不久的將來找出更多的易感基因，并弄清楚它們之間的相互作用。許多科學(xué)家認(rèn)加快這一過程的最好方法就是將來自各個(gè)基因分型實(shí)驗(yàn)室的新鮮數(shù)據(jù)進(jìn)行共享，甚至在進(jìn)行相關(guān)的基因研究之前。如果沒有足夠的合作共享數(shù)據(jù)，許多與疾病相關(guān)的基因異很可能無法得到揭示。美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）的一些項(xiàng)目負(fù)責(zé)人和英國 WellcoTrust 病例控制協(xié)會(huì)已經(jīng)打算在今年晚些時(shí)候?yàn)槠渌芯咳藛T提供 SNP 數(shù)據(jù)等信息。了鼓勵(lì)數(shù)據(jù)共享，NIH 還打算在幾個(gè)月后起草新的數(shù)據(jù)發(fā)布政策，要求所有得到全基組關(guān)聯(lián)研究資助的美國項(xiàng)目負(fù)責(zé)人將研究數(shù)據(jù)在一個(gè)中心數(shù)據(jù)庫集中存儲(chǔ)。該提案將時(shí)限制相關(guān)專利權(quán)申請，在保證項(xiàng)目小組首先發(fā)表成果的前提下，要求他們盡快提交驗(yàn)數(shù)據(jù)[36-38]。

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 邱曉萍;黃敬澤;;銀杏達(dá)莫注射液治療早期糖尿病腎病臨床觀察[J];海峽藥學(xué);2006年04期

2 蔡進(jìn)偉;季林影;劉小花;;3種藥物治療精神分裂癥的成本-效果分析[J];海峽藥學(xué);2008年06期

3 林宇星;馮淑玲;;正確把握口服降糖藥服用“時(shí)間窗”[J];海峽藥學(xué);2009年08期

4 曹麗;王麗娜;張敬一;孫紀(jì)新;朱俊卿;;河北省國家疾病監(jiān)測點(diǎn)糖尿病病死率及減壽分析[J];河北醫(yī)藥;2009年02期

5 王永會(huì);張永強(qiáng);朱彥輝;張雁;劉蘭瑞;;保定市肺結(jié)核患者合并糖尿病的流行病學(xué)分析[J];河北醫(yī)藥;2009年13期

6 郭瑞蘭;孟予城;陳學(xué)敏;;廊坊市市直干部糖尿病流行現(xiàn)狀及影響因素分析[J];河北醫(yī)藥;2009年18期

7 馮愛萍,石云,李志芬,周忠泉,劉玲玲,趙金風(fēng),李修奎,盧洪濤,李濱,劉召義,李梅,陳巖;Ⅱ型糖尿病患者尿微量白蛋白排出與下肢血管病變的關(guān)系[J];河北醫(yī)學(xué);2005年10期

8 白雪林;張霞;杜慧;;北新涇社區(qū)居民糖尿病患病情況分析[J];河北醫(yī)學(xué);2006年09期

9 張亮;顧平榮;夏明軍;;阿立哌唑與氯氮平治療精神分裂癥時(shí)心臟安全性的比較[J];黑龍江醫(yī)藥;2008年05期

10 郝唯蔚;徐世俠;胡婷婷;;年齡與代謝綜合征的關(guān)系及防治對策[J];海軍總醫(yī)院學(xué)報(bào);2007年03期

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 韓瑋;移植胰島細(xì)胞和骨髓單個(gè)核細(xì)胞治療糖尿病實(shí)驗(yàn)研究[D];新疆醫(yī)科大學(xué);2010年

2 荊陽;麻杏芎葶合劑對哮喘大鼠氣道神經(jīng)—免疫炎癥影響的實(shí)驗(yàn)研究[D];成都中醫(yī)藥大學(xué);2010年

3 王明松;對氧磷酶基因多態(tài)性與冠心病的關(guān)聯(lián)分析及薈萃分析[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2011年

4 任杰;風(fēng)險(xiǎn)評分篩查2型糖尿病的效果評價(jià)及糖化血紅蛋白診斷糖尿病的切點(diǎn)研究[D];山東大學(xué);2011年

5 李春深;抵擋湯對STZ誘導(dǎo)糖尿病大鼠視網(wǎng)膜病變影響的實(shí)驗(yàn)研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2011年

6 李俊燕;常見精神疾病共享遺傳風(fēng)險(xiǎn)研究[D];上海交通大學(xué);2011年

7 劉JIE;精神疾病相關(guān)基因的連鎖不平衡分析及應(yīng)用模式動(dòng)物研究Chd7基因功能[D];上海交通大學(xué);2011年

8 田朝偉;中國漢族人群冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病與基因多態(tài)性的關(guān)聯(lián)研究[D];廣州醫(yī)學(xué)院;2011年

9 羅俊;武漢市糖尿病流行趨勢及其預(yù)測的研究[D];華中科技大學(xué);2010年

10 邵光;西洛司特干預(yù)慢性阻塞性肺疾病的系統(tǒng)評價(jià)[D];南方醫(yī)科大學(xué);2011年

本文編號：2809341