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精神分裂癥患者血漿外泌體蛋白標(biāo)志物的TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)篩選及分析

發(fā)布時(shí)間:2020-08-18 15:09
【摘要】:目的:探討首發(fā)精神分裂癥患者及經(jīng)藥治療精神患者血漿外泌體蛋白的表達(dá)變化,篩選并分析潛在的與精神分裂癥患者的簡(jiǎn)便診斷及藥物療效監(jiān)測(cè)等密切相關(guān)的生物學(xué)標(biāo)志物。方法:采用串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽標(biāo)記技術(shù)(TMT)結(jié)合質(zhì)譜技術(shù)對(duì)15例首發(fā)精神分裂癥患者、42例經(jīng)藥治療精神分裂癥患者、45例健康體檢者的血漿外泌體蛋白質(zhì)進(jìn)行檢測(cè),并進(jìn)行蛋白質(zhì)定量分析,篩選精神分裂癥患者血漿外泌體中表達(dá)水平顯著變化的差異蛋白。利用Max Quant軟件、Uni Prot人類蛋白組SP數(shù)據(jù)庫(kù)和在線工具String對(duì)差異蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析,查閱大量文獻(xiàn),篩選出候選的精神分裂癥相關(guān)生物學(xué)標(biāo)志物。利用平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)(Parallel reaction monitoring,PRM)對(duì)篩選的候選蛋白標(biāo)志物進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:本研究共篩選出差異表達(dá)蛋白116種,首發(fā)精神分裂癥組較健康體檢組上調(diào)蛋白有92種,下調(diào)蛋白6種(P0.01);首發(fā)精神分裂癥組較經(jīng)藥物治療組上調(diào)蛋白有4個(gè),下調(diào)蛋白22個(gè)(P0.01);經(jīng)藥物治療組較健康體檢組上調(diào)蛋白有共11個(gè),下調(diào)蛋白15個(gè)(P0.01)。對(duì)差異蛋白進(jìn)行GO基因注釋分析,發(fā)現(xiàn)其主要參與15種生物學(xué)過程,主要來自16種細(xì)胞組成,主要具有16種分子功能;初步篩選出與精神分裂癥相關(guān)的HP、SAP、ANP、CAM和PSMB7共5個(gè)候選蛋白標(biāo)志物。三組之間的差異蛋白具有明顯統(tǒng)計(jì)學(xué),P0.01。通過PRM方法驗(yàn)證:HP和SAP的定量數(shù)據(jù)與TMT檢測(cè)數(shù)據(jù)基本一致(P0.01),ANP則相反(P0.05)。結(jié)論:首發(fā)精神分裂癥組與經(jīng)藥治療精神分裂癥組、健康體檢者血漿外泌體蛋白質(zhì)表達(dá)譜表現(xiàn)出一定差異,這些差異有可能成為精神分裂癥患者簡(jiǎn)便診斷及藥物療效監(jiān)測(cè)等的臨床輔助性血漿外泌體蛋白標(biāo)志物。
【學(xué)位授予單位】:遵義醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R749.3
【圖文】:

透射電鏡,精神分裂癥患者,藥物治療,SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳


圖 1. 經(jīng)藥物治療的精神分裂癥患者與健康體檢者的 SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳圖譜3.2 外泌體電鏡結(jié)果及 NTA 粒徑分析結(jié)果3.2.1 外泌體的透射電鏡實(shí)驗(yàn)結(jié)果本研究利用透射電鏡觀察到粒徑在 30~150nm 左右、茶托狀或凹陷半球形的外泌體樣結(jié)構(gòu)。

電泳圖,蛋白電泳,初步篩選,電泳圖


表 1. 三組樣品的粒徑分布及其相應(yīng)濃度數(shù)據(jù)樣品 首發(fā)組經(jīng)藥物治療組 健康體檢組平均粒徑(nm) 168.7 140.3159.7粒徑主峰(nm) 106.9 122.1151.0總濃度(1×1010particle ml-1)4.39 5.54 4.96粒徑 30nm -150nm 百分比(%) 45.3 59.540.93.3 血漿外泌體提取的蛋白 SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳初步篩查差異蛋白圖譜及蛋白定量數(shù)據(jù)首發(fā)精神分裂癥患者、經(jīng)藥治療精神分裂癥患者和健康體檢者血漿外泌體蛋白質(zhì) SDS-聚丙烯酰氨凝膠電泳圖譜如圖 3,蛋白電泳區(qū)帶有顯著差異。BCA 蛋白濃度測(cè)定試劑盒對(duì)上述血漿外泌體蛋白進(jìn)行定量,定量結(jié)果如表 2 所示,每組外泌體蛋白質(zhì)總量達(dá) 500ug 左右,符合質(zhì)譜上機(jī)標(biāo)準(zhǔn)。

差異表達(dá),分子,富集,功能


差異表達(dá)蛋白的分子功能富集分析

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2796376

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