阿爾茨海默病候選基因的連鎖不平衡分析
【學(xué)位授予單位】:中國科學(xué)院研究生院(上海生命科學(xué)研究院)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2006
【分類號】:R749.16
【圖文】:
圖 1-1:復(fù)雜疾病病因的簡化模型(文獻(xiàn) 4)2. 連鎖和連鎖不平衡遺傳疾病研究最常用的兩種方法是基于家系的連鎖分析(linkage analy和基于群體的連鎖不平衡分析(linkage disequilibrium analysis),又叫等位關(guān)聯(lián)分析(allelic association analysis)。連鎖分析主要用于簡單疾病的基因定位。連鎖分析檢測家系內(nèi)某個遺態(tài)性標(biāo)記和疾病表型之間的共分離(co-segregation)情況,從而決定該標(biāo)致病基因之間是否處于物理連鎖,最終找到該致病基因在染色體上的大致位連鎖現(xiàn)象是 1911 年摩爾根在果蠅實驗中首次發(fā)現(xiàn)的(文獻(xiàn) 5),而最早的,仍然被廣泛證明的,通過連鎖作圖尋找致病基因的例子是 1989 年對囊腫性化疾病的研究(文獻(xiàn) 6,7)。在過去的十年里,大約有 1300 多個引起人類
2. 產(chǎn)生和破壞連鎖不平衡的因素從上面的介紹我們知道,隨著時間的推移,基因組中的連鎖不平衡程度能夠被重組所消減。但是基因組中最初始的連鎖不平衡狀態(tài)是如何產(chǎn)生的呢?原因有很多,包括隨機(jī)遺傳漂變(random genetic drift),奠基者效應(yīng)(foundereffect),突變(mutation),選擇(selection),基因轉(zhuǎn)換(gene conversion),群體混合(population admixture)和層化(stratification)等。除了在理想的但卻不現(xiàn)實的假設(shè)下,我們很難建立精確的數(shù)學(xué)模型來解釋這些過程。另外精確地計算出這些過程在實際群體中是如何相互作用的也是非常困難的。盡管如此,對這些過程有個直觀地了解能夠幫助我們更好的理解連鎖不平衡在基因作圖中的優(yōu)勢和缺陷。圖 1-2 概括地描述了產(chǎn)生和破壞連鎖不平衡的一些因素(其中 D表示致病的等位基因,+表示遺傳標(biāo)記)。
第一章 引 言mDx(0)+(1-m)DY(0)+m(1-m)δAδB(δA= PA(X)-PA(Y), δB= PB(X)-PB(Y))(文獻(xiàn)17,18)。假設(shè)A,B兩位點(diǎn)間重組率為r,X和Y兩群體起初都是連鎖平衡的,則經(jīng)過t世代后:DZ(t)= (1-r)tm(1-m) δAδB。圖 1-3 更直觀地描述了群體結(jié)構(gòu)對 LD 的影響。該圖中,等位基因 A 在群體 2 中的頻率遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于群體 1 中的,而混合后的病例中,群體 2 的比例高于群體 1,則混合后等位基因和基因型的頻率在病例對照中有顯著差異,呈現(xiàn)出假的關(guān)聯(lián)信號。
【相似文獻(xiàn)】
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9 郭U
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