MMP-9、DNMTs、MeCP2基因多態(tài)性及基因間交互作用與精神分裂癥關(guān)系的研究
發(fā)布時間:2020-07-19 04:41
【摘要】:目的 (1)研究MMP-9、DNMT1、DNMT3A、DNMT3B基因多態(tài)性與精神分裂癥的關(guān)聯(lián)性; (2)按照性別分組后,研究X染色體上MeCP2基因多態(tài)性與女性精神分裂癥的關(guān)聯(lián)性: (3)研究DNMT1、DNMT3A、DNMT3B基因間交互作用與精神分裂癥 的關(guān)聯(lián)性。 方法 (1)采用PCR-RFLP方法對符合DSM-Ⅳ診斷標(biāo)準(zhǔn)的精神分裂癥患者298例及對照組298例MMP-9基因rs3918242位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,等位基因頻率和基因型頻率采用χ2檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)分析,比較病例組和對照組之間的差異。 (2)采用基于質(zhì)譜微陣列技術(shù)的基因多態(tài)性分析法對符合DSM-Ⅳ診斷標(biāo)準(zhǔn)的487例精神分裂癥患者和496例正常對照組中DNMT1、 DNMT3A、DNMT3B上的6個SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,用χ2檢驗(yàn)比較上述6個位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率的組間差異。使用在線軟件SNPstats對DNMT3A進(jìn)行連鎖不平衡和單體型分析,置換檢驗(yàn)對結(jié)果進(jìn)行校正。 (3)按照性別對487例患者和496例正常對照進(jìn)行男女分組,采用基于質(zhì)譜微陣列技術(shù)的基因多態(tài)性分析法對女性MeCP2上的5個SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,采用χ2檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)分析,比較病例組和對照組之間基因型頻率的差異;使用在線軟件SNPstats對MeCP2基因進(jìn)行連鎖不平衡和單體型分析,置換檢驗(yàn)對結(jié)果進(jìn)行校正。 (4)多因子降維分析(MDR)用于研究精神分裂癥患者DNMT1、 DNMT3A、DNMT3B基因間的交互作用,選擇交叉驗(yàn)證一致性最高、檢驗(yàn)準(zhǔn)確度最大統(tǒng)計(jì)結(jié)果最有顯著性差異的組合作為最佳模型。 結(jié)果 (1)MMP-9基因rs3918242位點(diǎn)SZ組與對照組相比C/C、(C/T+T/T)基因型頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.036),SZ組與對照組相比C、T等位基因頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.046)。 (2) DNMT1基因rs2228612位點(diǎn)G/A基因型在對照組比例為42.9%,而在病例組比例為36.2%,統(tǒng)計(jì)分析基因型頻率差異有顯著意義(P=0.031)。 (3)DNMT3A基因rs11887120基因型T/T在患者組和對照組中的分布頻率統(tǒng)計(jì)分析中具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.045);男性人群單體型GTTC分布頻率在病例組為0.3037,對照組分布為0.2558,P值為0.0058,兩組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 (4)MeCP2基因rs1616369位點(diǎn)G/A基因型分布頻率在女性患者組和對照組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.031);rs3027933位點(diǎn)G/C基因型分布頻率在患者組和對照組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.034);rs2239464在位點(diǎn)Donimant模型中A/A基因型分布頻率在患者組和對照組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.024);位點(diǎn)rs17435基因型T/A分布頻率在兩組之間對比有差異性,P值為0.027,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;位點(diǎn)rs1734792基因型C/A分布頻率在兩組之間有顯著性差異,P值為0.0083;在Donimant模型中,A/A基因型分布頻率在兩組之間有顯著性差異,P值為0.0035。女性人群的單體型GCCA分布頻率在病例組為0.1581,在對照組為0.2389,P值為0.025,兩組之間差異有顯著性。 (5)MDR分析顯示,六個位點(diǎn)基因型組合(rs6119954-rs11887120-rs13420827-rs6511685-rs2228612-rs1550117)是精神分裂癥DNMTs相關(guān)基因間交互作用的最佳模型,其檢驗(yàn)準(zhǔn)確度為0.4822,交叉驗(yàn)證一致性為10/10,P0.0001。 結(jié)論: (1)MMP-9基因C(-1562)T多態(tài)位點(diǎn)跟精神分裂癥發(fā)病相關(guān),MMP-9基因可能是精神分裂癥的易感基因之一。 (2)DNMT1基因rs2228612位點(diǎn)多態(tài)性跟精神分裂癥發(fā)病相關(guān),DNMT1基因可能是精神分裂癥的易感基因之一。 (3)DNMT3A基因上的rs11887120位點(diǎn)T/T基因型可能跟精神分裂癥發(fā)病相關(guān),男性單體型GTTC分布頻率在病例組較高,可能是精神分裂癥的易感因素。 (4)女性MeCP2基因上的rs1616369G/A基因型、rs3027933G/C基因型、rs1734792C/A基因型、rs2239464A/A基因型、rs17435位點(diǎn)T/A基因型可能跟精神分裂發(fā)病有相關(guān)性,MeCP2基因可能是女性精神分裂癥易感基因,女性人群的單體型GCCA分布頻率在病例組較低(P=0.025),該單體型可能是精神分裂癥的保護(hù)因素。 (5)經(jīng)過基因交互作用研究發(fā)現(xiàn),DNMT1、DNMT3A、DNMT3B三基因之間的交互作用跟精神分裂癥發(fā)病相關(guān),它們之間的交互作用可能會增加精神分裂癥的易感性。
【學(xué)位授予單位】:中南大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號】:R749.3
本文編號:2761924
【學(xué)位授予單位】:中南大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號】:R749.3
【共引文獻(xiàn)】
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3 彭春林;女性系統(tǒng)性紅斑狼瘡若干基因的相關(guān)性研究[D];復(fù)旦大學(xué);2010年
本文編號:2761924
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