【摘要】：目的15q11-13區(qū)域是人類基因組中最復(fù)雜的染色體區(qū)域之一,研究發(fā)現(xiàn)15q11-13區(qū)缺失和重復(fù)個(gè)體中存在孤獨(dú)癥樣的臨床表型,而15q11-13區(qū)重復(fù)也是孤獨(dú)癥人群中最常見的拷貝數(shù)變異。UBE3A基因位于15q11-13區(qū),編碼泛素-蛋白連接酶E3A,是孤獨(dú)癥重要的候選基因。本研究在中國漢族孤獨(dú)癥人群中篩查UBE3A基因變異并分析變異與孤獨(dú)癥的相關(guān)性。方法1.通過高分辨率熔解曲線(high resolution melting,HRM)和Sanger測(cè)序法對(duì)192例兒童孤獨(dú)癥患者(病例組)和192例健康對(duì)照(對(duì)照組)進(jìn)行UBE3A基因編碼區(qū)及其鄰近非編碼區(qū)域的突變篩查。2.對(duì)突變篩查發(fā)現(xiàn)的變異通過HRM的方法擴(kuò)大樣本驗(yàn)證,分析變異的分布頻率在孤獨(dú)癥患者和健康對(duì)照組間的差異。結(jié)果1.在UBE3A基因的第4個(gè)編碼區(qū)域(CDS4)發(fā)現(xiàn)一個(gè)已知的單核苷酸置換(TC,rs150331504),為同義突變。在篩查樣本中,病例組有4例、對(duì)照組有1例攜帶該變異;擴(kuò)大樣本后,該變異在病例組和對(duì)照組中的發(fā)生頻率分別為10/384、5/384,兩組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。分析比較攜帶rs150331504不同等位基因所編碼m RNA的最小自由能,結(jié)果顯示rs150331504的等位基因T和等位基因C的最小自由能存在一定差異,說明該變異可能改變了轉(zhuǎn)錄過程中的m RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)。其余編碼區(qū)域未見變異。2.在UBE3A基因第2個(gè)編碼區(qū)域(CDS2)上游288bp處發(fā)現(xiàn)了5個(gè)堿基的插入缺失(AACTC+/-,rs71127053),在篩查樣本中病例組和對(duì)照組的頻率均是16/192(5%)。擴(kuò)大樣本后進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,rs71127053的等位基因和基因型分布頻率在病例組和對(duì)照組間無顯著性差異(P0.05);在不同遺傳模式下,rs71127053的基因型分布頻率在病例組和對(duì)照組間無顯著性差異(P0.05)。結(jié)論在中國漢族人群中,UBE3A基因可能與孤獨(dú)癥不相關(guān)。
[Abstract]:Objective the 15q11-13 region is one of the most complex chromosomal regions in the human genome. 15q11-13 repeat is also the most common copy number variation in autistic population. UBE3A gene is located in 15q11-13 region and encodes Ubiquitin protein ligase E3A, which is an important candidate gene for autism. In this study, the mutation of UBE3A gene was screened in Chinese autistic population and the correlation between mutation and autism was analyzed. Method 1. High resolution fusion curve (high resolution melting,HRM) and Sanger sequencing were used to screen for mutations in the coding region of UBE3A gene and its adjacent noncoding region in 192 autistic children (case group) and 192 healthy controls (control group). 2. The mutations found in mutation screening were expanded by HRM to analyze the differences in the frequency of mutation distribution between autistic patients and healthy controls. Result 1. A known single nucleotide substitution (TC,rs150331504) was found in the fourth coding region (CDS4) of the UBE3A gene. In the screening sample, there were 4 cases in the case group and 1 case in the control group, and the frequency of the mutation in the case group and the control group was 10 / 384 / 5 / 384 after expanding the sample, and there was no significant difference between the two groups. The minimum free energy of m RNA encoded by different alleles of rs150331504 was analyzed and compared. The results showed that the minimum free energy of allele T and allele C of rs150331504 were different to some extent. These results suggest that the variation may alter the secondary structure of m RNA during transcription. The other coding regions were not mutated. 2. Five base insertion deletions (AACTC / -, rs71127053) were found in the 288bp upstream of the second coding region (CDS2) of the UBE3A gene. The frequencies of both the case group and the control group were 16 / 192 (5%). There was no significant difference in allele and genotype distribution of rs71127053 between the case group and the control group (P0.05). There was no significant difference in genotype distribution of rs71127053 between case group and control group under different genetic models (P0.05). Conclusion UBE3A gene may not be associated with autism in Chinese Han population.
【學(xué)位授予單位】：上海交通大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R749.94

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本文編號(hào)：2379994