發(fā)布時(shí)間：2018-04-23 22:13

  本文選題：甾醇氧-�；D(zhuǎn)移酶 + 基因表達(dá)數(shù)量性狀基因座��； 參考：《江蘇醫(yī)藥》2014年02期

【摘要】：目的從全基因組水平研究甾醇氧-�；D(zhuǎn)移酶1(Soat1)介導(dǎo)的阿爾茲海默病(AD)發(fā)病的分子機(jī)制。方法運(yùn)用基因表達(dá)數(shù)量性狀基因座(eQTL)定位方法對(duì)Soat1基因的表達(dá)變異及表達(dá)調(diào)控進(jìn)行研究,采用區(qū)間作圖在全基因組水平定位控制Soat1基因表達(dá)變化的eQTL。分析B6小鼠和D2小鼠兩品系間的單核苷酸多態(tài)性對(duì)eQTL定位的影響。采用聚類(lèi)分析篩選BXD重組近交系小鼠海馬組織基因組中受Soat1基因反式調(diào)節(jié)的候選基因,通過(guò)Pearson相關(guān)系數(shù)法構(gòu)建Soat1基因的表達(dá)遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果Soat1基因?yàn)轫樖阶饔玫膃QTL,Rab2、Taz、copg、whsc1l1、Atrnl1、1200008A14Rik和Epdr1為該基因的下游候選調(diào)控基因。與Soat1基因高度相關(guān)的前17個(gè)基因構(gòu)建遺傳相關(guān)基因網(wǎng)絡(luò)。結(jié)論 Soat1基因?yàn)轫樖秸{(diào)控基因;遺傳相關(guān)基因網(wǎng)絡(luò)中的基因與Soat1基因存在相互作用,直接或間接參與了AD的發(fā)病。
[Abstract]:Objective to study the molecular mechanism of the pathogenesis of Alzheimer's disease (AD) mediated by sterol oxygen-acyltransferase 1 (Soat 1) at the whole genome level. Methods the variation and regulation of Soat1 gene expression were studied by using quantitative trait locus (QTL) mapping method. The eQTLs of Soat1 gene expression were controlled by interval mapping at the whole genome level. The effect of single nucleotide polymorphism (SNP) on eQTL localization in B 6 and D 2 mice was analyzed. The candidate genes transregulated by Soat1 gene were screened by cluster analysis in the hippocampus of BXD recombinant inbred strain mice. The genetic regulatory network of Soat1 gene expression was constructed by Pearson correlation coefficient method. Results the Soat1 gene was identified as the candidate downstream regulatory gene for eQTL- Rab2Tazcopgus whsc1l1, Atrnl1A14Rik and Epdr1 from the cis-acting eQTLX gene. The results showed that Atrnl1A14Rik and Atrnl1A14Rik were the candidate regulatory genes for this gene. The first 17 genes with high correlation with Soat1 gene were used to construct the genetic network. Conclusion the Soat1 gene is a cis-regulatory gene, and the genes in the genetic related gene network interact with the Soat1 gene and participate directly or indirectly in the pathogenesis of AD.
【作者單位】： 南通大學(xué)組織學(xué)與胚胎學(xué)系;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81200828) 南通大學(xué)自然科學(xué)資助項(xiàng)目(03041170) 南通市科技項(xiàng)目(BK2011050)
【分類(lèi)號(hào)】：R749.16

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1793862