本文選題：甾醇氧-�；D移酶 + 基因表達數(shù)量性狀基因座��； 參考：《江蘇醫(yī)藥》2014年02期

【摘要】：目的從全基因組水平研究甾醇氧-�；D移酶1(Soat1)介導的阿爾茲海默病(AD)發(fā)病的分子機制。方法運用基因表達數(shù)量性狀基因座(eQTL)定位方法對Soat1基因的表達變異及表達調控進行研究,采用區(qū)間作圖在全基因組水平定位控制Soat1基因表達變化的eQTL。分析B6小鼠和D2小鼠兩品系間的單核苷酸多態(tài)性對eQTL定位的影響。采用聚類分析篩選BXD重組近交系小鼠海馬組織基因組中受Soat1基因反式調節(jié)的候選基因,通過Pearson相關系數(shù)法構建Soat1基因的表達遺傳調控網(wǎng)絡。結果Soat1基因為順式作用的eQTL,Rab2、Taz、copg、whsc1l1、Atrnl1、1200008A14Rik和Epdr1為該基因的下游候選調控基因。與Soat1基因高度相關的前17個基因構建遺傳相關基因網(wǎng)絡。結論 Soat1基因為順式調控基因;遺傳相關基因網(wǎng)絡中的基因與Soat1基因存在相互作用,直接或間接參與了AD的發(fā)病。
[Abstract]:Objective to study the molecular mechanism of the pathogenesis of Alzheimer's disease (AD) mediated by sterol oxygen-acyltransferase 1 (Soat 1) at the whole genome level. Methods the variation and regulation of Soat1 gene expression were studied by using quantitative trait locus (QTL) mapping method. The eQTLs of Soat1 gene expression were controlled by interval mapping at the whole genome level. The effect of single nucleotide polymorphism (SNP) on eQTL localization in B 6 and D 2 mice was analyzed. The candidate genes transregulated by Soat1 gene were screened by cluster analysis in the hippocampus of BXD recombinant inbred strain mice. The genetic regulatory network of Soat1 gene expression was constructed by Pearson correlation coefficient method. Results the Soat1 gene was identified as the candidate downstream regulatory gene for eQTL- Rab2Tazcopgus whsc1l1, Atrnl1A14Rik and Epdr1 from the cis-acting eQTLX gene. The results showed that Atrnl1A14Rik and Atrnl1A14Rik were the candidate regulatory genes for this gene. The first 17 genes with high correlation with Soat1 gene were used to construct the genetic network. Conclusion the Soat1 gene is a cis-regulatory gene, and the genes in the genetic related gene network interact with the Soat1 gene and participate directly or indirectly in the pathogenesis of AD.
【作者單位】： 南通大學組織學與胚胎學系;
【基金】：國家自然科學基金(81200828) 南通大學自然科學資助項目(03041170) 南通市科技項目(BK2011050)
【分類號】：R749.16

【參考文獻】

相關期刊論文 前2條

1 陳穎;汪旭升;許玲莉;沈勤;王曉冬;陸璐;;基因表達數(shù)量性狀定位的研究進展[J];生命科學;2009年01期

2 趙發(fā)國,王蔭華,陳彪,楊靜芳,馬秋蘭,湯哲,劉宏軍,董秀敏,馮秀麗;乙酰輔酶A:膽固醇乙酰轉移酶基因單核苷酸多態(tài)性與散發(fā)性阿爾茨海默病的相關性研究[J];中國神經(jīng)免疫學和神經(jīng)病學雜志;2005年05期

【共引文獻】

相關期刊論文 前5條

1 范東東;孫銘娟;王梁華;焦炳華;;�；D移酶研究[J];生命的化學;2008年06期

2 李宏;;生物信息學與eQTL作圖:問題和展望[J];生物技術通報;2012年07期

3 黃嘉睿;殷冬梅;沈勤;;eQTL結合ASE分析顯示帕金森病相關基因Lrrk2表達受順式作用調控[J];中國生物化學與分子生物學報;2012年12期

4 宋臻;呂澤平;羅桓;潘尚領;胡才友;楊銘;杜麗麗;彭均華;羅曉秋;周小玲;尹瑞興;劉承武;;廣西紅水河流域壯族長壽家系子女ACAT1 rs1044925基因多態(tài)性與血脂水平的相關性[J];山東醫(yī)藥;2013年20期

5 陳穎;張玉芳;李奕;高銀峰;陳雪;林巍巍;王曉冬;陸璐;;Ptgs2基因在BXD重組近交系小鼠海馬組織中的遺傳基因組學分析[J];江蘇醫(yī)藥;2011年20期

相關博士學位論文 前1條

1 邵勤;一個新的甜瓜葉色黃化突變體研究[D];東北農業(yè)大學;2013年

相關碩士學位論文 前2條

1 陳穎;應用遺傳基因組學手段初步構建阿爾茨海默病相關基因表達調控網(wǎng)絡[D];南通大學;2009年

2 宋臻;長壽家系ACAT1 rs1044925基因多態(tài)性與血脂水平的相關性分析[D];廣西醫(yī)科大學;2013年

【二級參考文獻】

相關期刊論文 前3條

1 王蔭華;阿爾茨海默病的臨床表現(xiàn)與早期識別[J];中國全科醫(yī)學;2001年12期

2 王蔭華;阿爾茨海默病的危險因素[J];中華神經(jīng)科雜志;2003年06期

3 陳曉紅,王蔭華;載脂蛋白E——Alzheimer病的危險因子[J];中國康復理論與實踐;2002年07期

，

本文編號：1793862