本文選題：多巴胺 + 多巴胺受體��； 參考：《物理化學學報》2017年05期

【摘要】：本文基于多巴胺與其第三受體復合蛋白(D_3R)結(jié)構,采用分子動力學技術Gromacs 4.5程序中的傘形樣本方法,研究多巴胺在多巴胺第三受體蛋白結(jié)構中的運動軌跡及其過程中自由能變化,探討多巴胺在其分子通道上傳輸運動機制動力學。分子模擬表明,處在發(fā)揮神經(jīng)遞質(zhì)作用部位的多巴胺,通過D_3R結(jié)構中的功能分子通道沿著y+軸朝細胞外方向傳輸運動的自由能變化數(shù)值為134.6 kJ?mol~(-1),沿著y-軸朝細胞內(nèi)傳輸運動的自由能變化為211.5 kJ?mol~(-1)。在D_3R結(jié)構中,多巴胺沿著x+、x-、z+、z-軸朝細胞雙層膜方向傳輸運動的自由能變化分別為65.8、245.0、551.4、172.8 kJ?mol~(-1),數(shù)值說明DOP更容易沿著x+軸方向從TM5(第五跨膜螺旋)與TM6(第六跨膜螺旋)縫隙之間離開D_3R內(nèi)部結(jié)構。處在細胞間隙空間的自由多巴胺,在等溫等壓條件下沿著逆y+軸方向通過多巴胺第三受體內(nèi)功能分子通道,到達發(fā)揮神經(jīng)遞質(zhì)作用的部位是一個自發(fā)過程,因為在該軌跡上多巴胺分子與受體相互作用是一個負自由能變化(-134.6 kJ?mol~(-1))。所以,多巴胺與多巴胺受體很容易相互結(jié)合,發(fā)揮神經(jīng)遞質(zhì)作用。發(fā)揮了神經(jīng)遞質(zhì)功能作用的多巴胺分子,沿著x+軸方向的保護分子通道從TM5與TM6縫隙之間離開D_3R內(nèi)部結(jié)構,避免過度發(fā)揮多巴胺神經(jīng)遞質(zhì)功能作用。根據(jù)多巴胺功能和保護分子通道觀點,我們提出帕金森病新病理和精神分裂癥新病理。論文還探討多巴胺分子通道理論及其新病理應用于治療控制這兩種病癥及其相關藥物研究開發(fā)。
[Abstract]:Based on the structure of dopamine and its third receptor complex protein (D3R), the free energy changes of dopamine in the structure of dopamine third receptor protein were studied by using the umbrella sample method of Gromacs 4.5 program.To investigate the kinetics of dopamine transport on its molecular channels.Molecular simulations show that dopamine, which acts as a neurotransmitter,The free energy of transport along the y axis to the extracellular direction of the functional molecule channel in the D3R structure varies from 134.6 kJ / mol ~ (-1) to 211.5 kJ / mol ~ (-1) ~ 1 ~ (-1), and to 211.5 kJ / mol ~ (-1) / L ~ (-1) ~ (-1) ~ (-1) ~ 211.5 kJ / mol ~ (-1) ~ (-1) ~ (-1) ~ (-1).In the Dash3R structure,Free dopamine in intercellular space, under isothermal isobaric conditions, passing through the third functional molecular channel of dopamine through the third acceptor of dopamine in the direction of the inverse y axis, is a spontaneous process to the site where the neurotransmitter is acting.Because the dopamine molecule interacts with the receptor on this trajectory is a negative free energy variation of -134.6 kJ mol ~ (-1).Therefore, dopamine and dopamine receptors can easily bind to each other and act as neurotransmitters.The dopamine molecules which play the role of neurotransmitters, the protective molecular channels along the x-axis leave the internal structure of D3R from the gap between TM5 and TM6, so as to avoid over-exerting the function of dopamine neurotransmitters.According to dopamine function and protective molecular channel, we propose new pathology of Parkinson's disease and new pathology of schizophrenia.This paper also discusses the application of dopamine molecular channel theory and its new pathology in the treatment and control of these two diseases and the development of related drugs.
【作者單位】： 云南大學化學科學與工程?藥學學院自然資源藥物化學教育部重點實驗室;
【基金】：國家自然科學基金(21163024,21563032)資助項目~~
【分類號】：O643.1;R749.3

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本文編號：1739726