本文關(guān)鍵詞： 精神分裂癥 亞甲基四氫葉酸還原酶 關(guān)聯(lián)分析 單核苷酸多態(tài)性　出處：《濟南大學(xué)》2012年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：精神分裂癥（Schizophrenia，MIM181500）是一種重型精神疾病，以思維、情感、行為障礙，精神活動與環(huán)境相互不協(xié)調(diào)為主要特征。在一般人群中患病率約為5.31‰，在世界范圍內(nèi)終生患病率約為6.55‰[1]，該病至今病因未明。在精神分裂癥的發(fā)病過程中，生物、心理、社會因素共同起作用。家系調(diào)查、雙生子以及寄養(yǎng)子研究結(jié)果均顯示遺傳因素起著重要作用[2-4]。精神分裂癥遺傳機制復(fù)雜，多個微效基因協(xié)同作用與罕見變異都有可能影響其發(fā)病。近20年來，眾多遺傳連鎖和關(guān)聯(lián)分析研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多與其病因關(guān)聯(lián)的染色體區(qū)域和候選基因。 亞甲基四氫葉酸還原酶基因（methylenetetrahydrofolate reductase，MTHFR）于1994年被克隆，并定位于染色體1p36.3。MTHFR是甲硫氨酸（Met）循環(huán)的關(guān)鍵酶，可催化5,10-亞甲基四氫葉酸還原為5-甲基四氫葉酸，后者是葉酸在血漿和組織中存在的主要形式，參與同型半胱氨酸轉(zhuǎn)化為S-腺苷甲硫氨酸的過程，這個過程是通過同型半胱氨酸接受5-甲基四氫葉酸的甲基基團而生成甲硫氨酸，甲硫氨酸在腺苷轉(zhuǎn)移酶的作用下轉(zhuǎn)變成S-腺苷甲硫氨酸，而S-腺苷甲硫氨酸可作為甲基供體，在機體代謝的DNA甲基化和核酸合成過程中起重要作用。 目的 通過全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome Wide Association Study GWAS）查找精神分裂癥的遺傳關(guān)聯(lián)位點及易感基因。 方法 階段一：全基因組關(guān)聯(lián)分析 病例組選擇了山東省精神分裂癥患者(以下簡稱患者)981例，對照組的為同一地區(qū)的1000例正常對照者（以下簡稱對照者），取自山東省血液中心獻血者。所有患者均符合國際精神分裂癥診斷標(biāo)準(zhǔn)（ICD－10）,其中男性489例,女性492例，男女之比為0.99：1，年齡范圍12-79歲，平均年齡（33.80±11.98）歲，平均發(fā)病年齡（26.04±9.72）歲，患者間均無血緣關(guān)系。同一地區(qū)對照者中男性569例,女性431例，男女之比為1.32：1，年齡范圍17-55歲，平均年齡(23.08±5.67)歲。在人類基因組間隔10cM（厘摩）遺傳距離選擇了400個微衛(wèi)星遺傳位點標(biāo)記，用DNA混合池（DNA-pooling）的方法對981例精神分裂癥患者與1000例正常對照者的DNA樣本分別進行混合后進行了全基因組掃描與基因分型，經(jīng)卡方檢驗進行了統(tǒng)計分析，對比各遺傳位點患者組與對照組等位基因頻率的差異。 階段二：MTHFR基因相關(guān)位點snp分型（HRM）與分析 對上述病例組與對照組的研究對象選取6個SNP位點(rs1801131， rs1801133，rs12121543、rs10779765、rs17037425和rs9651118)，通過高分辨率溶解曲線（HighResolution Melting，HRM）的方法進行SNP基因分型。之后，經(jīng)卡方檢驗進行了統(tǒng)計分析，對比各遺傳位點患者組與對照組等位基因頻率的差異。 結(jié)果 1.用DNA混合池的方法對山東省981例精神分裂癥患者和1000例正常對照者進行了400個微衛(wèi)星遺傳標(biāo)記組成的全基因組掃描，經(jīng)過多次重復(fù)試驗，最終獲得了其中399個遺傳位點的基因分型結(jié)果，發(fā)現(xiàn)1號染色體上的D1S450位點（1p36.22）與精神分裂癥呈現(xiàn)關(guān)聯(lián)，P＜0.0001，此位點與MTHFR基因（1p36.3）位置相距約2,5cM(厘摩)。 2.在用HRM的方法對所選取的6個SNP位點進行基因分型的過程中，遇到了很多意想不到的問題，實驗結(jié)果很不穩(wěn)定，，重復(fù)性不好，未能達到預(yù)期的實驗結(jié)果。 結(jié)論 1號染色體是人類23對染色體中最長的一對，共由247249719個堿基（bp）組成，發(fā)現(xiàn)有2834個基因。而與精神分裂癥相關(guān)聯(lián)或連鎖的遺傳位點在這一染色體的發(fā)現(xiàn)相對比較集中，在長臂和短臂均有報道。我們所發(fā)現(xiàn)的與精神分裂癥呈現(xiàn)顯著關(guān)聯(lián)的D1S450位點位于短臂的1p36.22區(qū)域（chr1：9508006-9508378）。在此結(jié)果為的基礎(chǔ)上，結(jié)合之前國內(nèi)外的一些研究報道，在這一位點附近選取了MTHFR基因作為第二階段研究的候選基因，令人遺憾的是實驗不順利，基因分型并沒有得到理想的結(jié)果。 作為最典型的復(fù)雜遺傳病之一，精神分裂癥一直是遺傳學(xué)研究的熱點。此病由于存在著遺傳異質(zhì)性（genetic heterogeneity）與臨床異質(zhì)性（clinical geneticheterogeneity），多個微效基因協(xié)同參與致病的特點使得篩選出具有統(tǒng)計學(xué)顯著性的單個易感基因變的非常困難。在GWAS廣泛應(yīng)用以前，多數(shù)研究都是通過候選基因來做關(guān)聯(lián)分析。目前為止，大約800個基因被檢測，但至今沒有一個基因被完全確認(rèn)是直接導(dǎo)致精神分裂癥發(fā)病的致病基因。GWAS的方法在人類的單基因疾病和復(fù)雜疾病易感基因篩查方面得到了很好的應(yīng)用，其原理是借助于分子遺傳標(biāo)記進行關(guān)聯(lián)分析。在全基因組范圍內(nèi)選擇密度不等的一套遺傳標(biāo)記進行基因分型，比較病例組和對照組之間在每個遺傳位點等位基因頻率、基因型頻率以及單倍體頻率的差異，通過統(tǒng)計分析每個位點與疾病性狀之間是否存在顯著性的差異，確定關(guān)聯(lián)性存在與否。對篩選出的最具關(guān)聯(lián)性的遺傳位點要進行多次重復(fù)驗證，最終確定其與目標(biāo)性狀之間的關(guān)聯(lián)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：濟南大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號】：R749.3;R3416

【參考文獻】

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1 沈漁惃;張維熙;李淑然;陳昌惠;羅開林;;1993年中國7地區(qū)精神疾病、精神衛(wèi)生服務(wù)和精神與智力殘疾流行病學(xué)調(diào)查[J];醫(yī)學(xué)研究通訊;2000年06期

本文編號：1480290