基于調(diào)和函數(shù)尋找AD候選基因
發(fā)布時(shí)間:2017-11-07 09:33
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【摘要】:阿爾茨海默。ˋlzheimer disease,AD)是癡呆癥中最常見的一種,它的發(fā)病率在逐年上升存活率卻在逐年下降。然而至今,其復(fù)雜的發(fā)病機(jī)制仍不為人知,并且也沒有找到治療AD的有效措施,但是多次研究證明AD與基因有關(guān),因此目前已有6個(gè)基因被證實(shí)與AD相關(guān),它們是APOE、PSEN1、PSEN2和APP基因等。為找到更多的與AD有關(guān)的基因,從根本上找到治療AD的有效辦法,研究者們開始利用基因芯片獲取基因表達(dá)數(shù)據(jù)用以研究AD。AD病是由多個(gè)基因控制的疾病,要從這些數(shù)據(jù)里提取有用的信息比較困難,為了解決這一問題,,越來越多研究者設(shè)計(jì)不同算法尋找候選基因。目前的算法大多數(shù)只是對不同生病程度下的數(shù)據(jù)進(jìn)行差異化對比,從而找出可能與AD病相關(guān)的基因,但是這些方法的缺點(diǎn)是數(shù)據(jù)挖掘不完善。為了克服這個(gè)問題,本文根據(jù)AD病可能與基因表達(dá)水平過度失衡有關(guān)的思想,利用正態(tài)分布函數(shù)和以基因與基因之間的歐式距離為自變量構(gòu)造出反映基因相關(guān)性的調(diào)和函數(shù),從而計(jì)算出各基因與周圍基因的相關(guān)性表達(dá)值。這樣就能避免直接把基因表達(dá)數(shù)據(jù)直接進(jìn)行對比,數(shù)據(jù)挖掘更完善。通過這一算法分析基因相關(guān)性數(shù)據(jù)表達(dá)值,對比在四種不同情況下基因相關(guān)性表達(dá)值變化情況。尋找出相關(guān)性變化最劇烈的基因作為識(shí)別出來的候選基因。文章最后識(shí)別出68個(gè)相關(guān)性變化最劇烈的基因基因。由于這些基因相關(guān)性表達(dá)值變化過于劇烈,因此這一部分基因很有可能與AD有直接或間接的關(guān)系。其中APOE是其中的一個(gè),這個(gè)基因已經(jīng)被證實(shí)是AD病基因;cnr1基因在其他有關(guān)文章中提到該基因與AD病有關(guān)。
【學(xué)位授予單位】:四川師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R749.16
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條
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本文編號(hào):1151855
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