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重型腦外傷患者血液LncRNAs動(dòng)態(tài)變化及差異表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2019-08-03 07:18
【摘要】:背景:長鏈非編碼RNA (Long noncoding RNAs, lncRNAs)參與多種生物學(xué)過程,在保持正常細(xì)胞功能(如細(xì)胞增殖、凋亡、周期等)的同時(shí)在生物學(xué)過程中也發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。lncRNA的調(diào)節(jié)異常可導(dǎo)致多種神經(jīng)系統(tǒng)疾病的發(fā)生如(),相關(guān)研究進(jìn)展迅速;然而,lncRNA在創(chuàng)傷性腦損傷(traumatic brain injury, TBI)發(fā)展過程中起到的作用仍不明確。本研究通過LncNRA表達(dá)譜探索TBI患者(血液)中存在的lncRNA對(duì)TBI的病理生理學(xué)機(jī)制是否發(fā)揮作用。 方法:嚴(yán)格篩選格拉斯哥昏迷評(píng)分(GCS)小于8分的重型閉合性顱腦外傷患者,總共12個(gè)樣本的血液組織,9例創(chuàng)傷性腦損傷成年男性患者(分別在24h、48h、72h共3個(gè)時(shí)間點(diǎn)采集靜脈血)3例非創(chuàng)傷性成年男性對(duì)照組,提取總RNA,并進(jìn)行單色基于微陣列基因芯片表達(dá)譜分析。進(jìn)一步作包括基因本體(GO)分析和信號(hào)通路分析在內(nèi)的生物信息學(xué)分析。 結(jié)果:在每個(gè)觀察時(shí)間點(diǎn)都有2倍以上差異表達(dá),表達(dá)上調(diào)的lncRNA有232種,其中有生物學(xué)注釋的較完整注釋的lncRNA有75種;表達(dá)下調(diào)的lncRNA有63種,其中有生物學(xué)注釋的較完整注釋的lncRNA有22種。信號(hào)通路分析表明,lncRNA相關(guān)mRNA轉(zhuǎn)錄本對(duì)應(yīng)有16種信號(hào)通路上調(diào)和10種信號(hào)通路下調(diào)(p0.01)。GO功能分類分析表明,上調(diào)轉(zhuǎn)錄本對(duì)應(yīng)的最高富集的GO靶標(biāo)與補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)相關(guān),下調(diào)轉(zhuǎn)錄本對(duì)應(yīng)的最高富集GO靶標(biāo)與自然殺傷細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒作用相關(guān)。 結(jié)論:1ncRNA在創(chuàng)傷性顱腦損傷研究領(lǐng)域目前尚未有報(bào)道,本課題率先探索了顱腦外傷后循環(huán)外周血血液中是否有l(wèi)ncRNA的參與,動(dòng)態(tài)觀察了其在傷后不同時(shí)間點(diǎn)上的變化趨勢,發(fā)現(xiàn)了存在差異表達(dá)的lncRNA。其中參與上調(diào)的信號(hào)通路有16條,下調(diào)的信號(hào)通路有10條。隨機(jī)選取其中兩條通路進(jìn)一步進(jìn)行分子生物學(xué)功能注釋Pathway分析,發(fā)現(xiàn)有自然殺傷細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒作用、補(bǔ)體及凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)和細(xì)胞凋亡等一些與顱腦損傷過程密切相關(guān)的重要病理生理過程,有助于后續(xù)實(shí)驗(yàn)研究詳細(xì)分析腦外傷后機(jī)體內(nèi)繼發(fā)應(yīng)激反應(yīng)的分子作用機(jī)制及顱腦創(chuàng)傷相關(guān)的診斷治療策略。
【學(xué)位授予單位】:天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R651.15

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2522422

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