3株人源豬鏈球菌2型湖南株cps2J、gdh、ef基因進化分析
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【摘要】:目的對3株人源豬鏈球菌2型(S.suis 2)湖南株(HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102)cps2J、gdh、ef基因進行序列測定和進化分析,了解其變異和進化狀況,為人感染S.suis疫情的防控提供數(shù)據(jù)。方法設(shè)計S.suis 2 cps2J、gdh、ef基因PCR引物,對HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102株進行PCR擴增和序列測定,測序結(jié)果利用Lasergene和Mega5軟件進行分析。結(jié)果 cps2J、gdh、ef基因包含的完整開放閱讀框(ORF)分別為999bp、1 347bp、2 532bp,分別編碼333、448、843個氨基酸。在線BLAST同源性分析表明,HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102株屬于S.suis 2,3菌株cps2J、gdh、ef基因組序列之間的核苷酸同源性均為100%;進化樹顯示,HNCS201001、HNCS201101、HNCS201102株與國內(nèi)外豬源和人源S.suis 2菌株屬于同一分支,同源性比較顯示3株S.suis 2湖南分離株cps2J、gdh、ef基因與其他國內(nèi)外S.suis株核苷酸序列同源性分別為99.8%~100%、96.4%~100%和99.7%~100%,氨基酸同源性分別為98.5%~100%、98.7%~100%和99.5%~100%。結(jié)論 3株人源S.suis 2湖南株cps2J、gdh、ef基因序列與國內(nèi)外S.suis 2菌株相應(yīng)基因序列同源性高,變異程度小。
【作者單位】: 長沙市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 豬鏈球菌型 cpsJ基因 gdh基因 ef基因 進化分析
【基金】:長沙市科技計劃項目(K0902167-31)~~
【分類號】:R378.1
【正文快照】: 豬鏈球菌2型(Streptococcus suis serotype 2,S.suis 2)是一種致病力強的重要人獸共患病病原體[1],可引起豬和人感染發(fā)病,并可導(dǎo)致死亡。1998年,江蘇省南通市爆發(fā)了豬群S.suis 2疫情,并在國內(nèi)首次報道了人感染S.suis 2病例[2],近年來國內(nèi)已多次發(fā)生人感染S.suis 2疫情[3-7],S.
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