miR-146b靶標(biāo)預(yù)測及功能分析
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更多相關(guān)文章: miR-b miRNA 生物信息學(xué) 人脂肪細(xì)胞
【摘要】:目的通過對(duì)miR-146b進(jìn)行系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析,預(yù)測miR-146b的靶基因及其功能。方法應(yīng)用miRBase獲取并分析miR-146b的序列特征;應(yīng)用TargetScan、PicTar及miRanda預(yù)測miR-146b的靶基因,進(jìn)行功能注釋和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路分析;應(yīng)用PubMed、Google等信息搜索工具綜述miR-146b已有功能研究。結(jié)果 miR-146b在各物種之間具有高度保守性。功能注釋顯示預(yù)測靶基因主要富集于促細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、調(diào)控細(xì)胞分化等生物學(xué)過程。信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路分析顯示預(yù)測靶基因顯著富集于白血病、ErbB信號(hào)通路、促分裂原活化的蛋白激酶通路等。結(jié)論生物信息學(xué)分析提示,miR-146b可能與細(xì)胞分化、代謝密切相關(guān)。
【作者單位】: 南京醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院內(nèi)分泌病科;南京醫(yī)科大學(xué)兒科研究所;南京醫(yī)科大學(xué)附屬南京婦幼保健院;
【關(guān)鍵詞】: miR-b miRNA 生物信息學(xué) 人脂肪細(xì)胞
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81100619) 江蘇省醫(yī)學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(LJ201108) 江蘇省自然科學(xué)基金(BK2011107) 南京市科技發(fā)展計(jì)劃(201104013)
【分類號(hào)】:R346
【正文快照】: 微小RNA(microRNA,miRNA)是近年來在真核生物體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的、一類長度約22nt的內(nèi)源性非編碼單鏈小RNA,能通過與靶標(biāo)mRNA不完全互補(bǔ)配對(duì)、降解靶mRNA或抑制靶mRNA翻譯(轉(zhuǎn)錄后調(diào)控作用)的機(jī)制[1],參與幾乎所有生命活動(dòng)的調(diào)節(jié)和大多數(shù)疾病的發(fā)病過程。最近的研究顯示,miRNAs也參與
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