公共場所冷卻塔水嗜肺軍團(tuán)菌的基因序列分型研究
發(fā)布時間:2017-08-09 17:01
本文關(guān)鍵詞:公共場所冷卻塔水嗜肺軍團(tuán)菌的基因序列分型研究
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【摘要】:目的為了解溫州市中央空調(diào)冷卻塔水中嗜肺軍團(tuán)菌(Legionella pneumophila,LP)基因特征,采用序列分型方法(sequenced-based typing,SBT)對公共場所中央空調(diào)冷卻塔水中的嗜肺軍團(tuán)菌進(jìn)行分子分型研究。方法選擇嗜肺軍團(tuán)菌的7個管家基因flaA、asd、mip、pilE、mompS、proA和neuA作為目的基因,對溫州市公共場所中央空調(diào)冷卻塔水中分離的31株嗜肺軍團(tuán)菌進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測序。測序結(jié)果上傳歐盟軍團(tuán)菌感染工作組(EWGLI)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對、分型。運(yùn)用DNAsp 5.0、Bionumerics5.1及SplitsTree等軟件對分型結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果 31株嗜肺軍團(tuán)菌中,11株LP1型被分為2種ST型;17株非LP1型被分為8種ST型,其中7種ST型是新發(fā)現(xiàn)的序列型,并新發(fā)現(xiàn)1個等位基因;另3株非LP1型因缺少neuA基因未被數(shù)據(jù)庫確認(rèn)。7個管家基因的核苷酸多態(tài)性(Pi)范圍為0.00995(mip)~0.02311(flaA)。flaA具有最大的核苷酸多態(tài)性(0.02311)。經(jīng)聚類分析得到本地分離的嗜肺軍團(tuán)菌株的遺傳進(jìn)化關(guān)系。結(jié)論溫州市公共場所冷卻塔水中的嗜肺軍團(tuán)菌與國內(nèi)外其他地區(qū)報(bào)道的嗜肺軍團(tuán)菌具有一定的親緣關(guān)系,同時也具有地區(qū)特異性和遺傳多樣性。
【作者單位】: 溫州市疾病預(yù)防控制中心;上海市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】: 嗜肺軍團(tuán)菌 序列分型 聚類分析 管家基因
【基金】:溫州市2010科技計(jì)劃項(xiàng)目(No.Y20100022)~~
【分類號】:R378
【正文快照】: 軍團(tuán)菌屬(Legionella)普遍存在于天然淡水環(huán)境中,是引起軍團(tuán)病的重要病原體。大部分軍團(tuán)菌病由嗜肺軍團(tuán)菌菌種感染引起,其中又以嗜肺軍團(tuán)菌1型為主。在軍團(tuán)菌的檢測方法中,血清學(xué)分型方法是基本的分型方法,但軍團(tuán)菌血清普遍存在一定的交叉反應(yīng),給軍團(tuán)菌的分型帶來一定的影響
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
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【二級參考文獻(xiàn)】
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2 陸建紅;張e,
本文編號:646323
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