本文關(guān)鍵詞：脂多糖活化巨噬細(xì)胞的數(shù)字基因表達譜分析

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【摘要】：目的研究巨噬細(xì)胞經(jīng)脂多糖(LPS)處理后基因表達譜的變化。方法 LPS 0.01 mg·L-1作用RAW264.7細(xì)胞24 h,應(yīng)用數(shù)字基因表達譜(DGE)技術(shù)篩選差異表達基因,分析差異基因富集的Gene ontology(GO)功能和Kyoto encyclopoedia of genes and genomes(KEGG)信號通路,并通過定量PCR對部分差異表達基因進行驗證。結(jié)果 LPS處理后,共有1959個基因差異表達,其中上調(diào)974個,下調(diào)985個。GO分析顯示,差異表達基因主要發(fā)揮蛋白結(jié)合和催化活性等分子功能,以及調(diào)節(jié)細(xì)胞過程、對環(huán)境刺激的反應(yīng)和免疫系統(tǒng)等生物學(xué)功能。信號通路分析顯示,顯著富集的途徑與炎癥、免疫系統(tǒng)和癌癥等疾病密切相關(guān)。結(jié)論 DGE技術(shù)驗證了LPS介導(dǎo)炎癥反應(yīng)的NF-κB、絲裂原激活蛋白激酶和Jak-STAT 3條主要的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,發(fā)現(xiàn)了細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡和細(xì)胞外識別等新的途徑。
【作者單位】： 寧波大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院;寧波大學(xué)應(yīng)用海洋生物工程重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 脂多糖 巨噬細(xì)胞 數(shù)字基因表達譜 炎癥
【基金】：浙江省醫(yī)藥衛(wèi)生科技計劃項目(2013KYB238) 國家自然科學(xué)基金(81370532) 寧波市自然科學(xué)基金(2013A610220)~~
【分類號】：R392.1
【正文快照】： 脂多糖(lipopolysaccharides,LPS)是革蘭陰性菌的胞壁組成成分,能夠引起多種免疫細(xì)胞,包括單核細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和中性粒細(xì)胞等發(fā)生形態(tài)、功能和胞內(nèi)基因表達的變化,合成并釋放一系列炎癥介質(zhì),參與機體的炎癥級聯(lián)反應(yīng),并導(dǎo)致宿主細(xì)胞因子表達失控,從而引起感染性休克、器官損傷

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