本文關(guān)鍵詞：湖北腸道病毒EV71型流行株VP1基因以及蛋白結(jié)構(gòu)特征分析

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【摘要】：目的全面研究和了解2011年湖北省腸道病毒71型的VP1基因及蛋白結(jié)構(gòu)特征,分析EV71型病毒在湖北省的基因型別,探討該型病毒在全省的地理分布特征。方法對(duì)2011年湖北省8個(gè)區(qū)市的20株EV71流行株進(jìn)行VP1區(qū)全長(zhǎng)基因序列測(cè)定,并對(duì)核苷酸序列進(jìn)行同源性比較及系統(tǒng)進(jìn)化分析,并對(duì)VP1蛋白序列的親水性、柔韌性等二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。結(jié)果 2011年湖北省EV71型流行株的基因亞型為C4a亞型,其VP1區(qū)核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性較高,分別為96.5%~98.7%和98.3%~100%。VP1蛋白特征分析發(fā)現(xiàn)該區(qū)主要免疫表位均沒有發(fā)生變異且存在較多親水性區(qū)域。二級(jí)結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為主,其次為β片層。蛋白質(zhì)同源建模未發(fā)現(xiàn)不同毒株間VP1蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)差別。結(jié)論 2011年湖北省EV71型流行株與我國(guó)其它地區(qū)的毒株有較高同源性,且存在一定的地理區(qū)域聚集性特征和遺傳多樣性特點(diǎn)。同時(shí)綜合多種方法預(yù)測(cè)EV71VP1的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu),為進(jìn)一步研究開發(fā)相關(guān)藥品和防治EV71感染提供理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 湖北省疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 腸道病毒型 VP區(qū) 基因特征
【分類號(hào)】：R373
【正文快照】： 腸道病毒71(Enterovirus 71,EV71)為小RNA病毒科(Picornaradae)腸道病毒屬(Enterovirus)人類腸道病毒A型(human enterovirus A species)成員[1]。EV7l感染可引起多種臨床癥狀,除手足口病 外,還能引起發(fā)熱性疾病、皰疹性咽峽炎、無菌性腦膜炎、腦干腦炎和脊髓灰質(zhì)炎樣的麻痹等

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