黏細菌活性代謝產(chǎn)物的互動篩選
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【摘要】:【目的】研究互動篩選在黏細菌活性代謝產(chǎn)物篩選中的效果,以期為有效地獲得高效、低毒的黏細菌活性產(chǎn)物提供支持。【方法】在構(gòu)建互動篩選抗真菌模型的基礎(chǔ)上,對分離自陜西秦巴山區(qū)的黏細菌代謝產(chǎn)物進行互動篩選和非互動篩選,比較代謝產(chǎn)物初篩、復(fù)篩后的陽性率,并對篩選結(jié)果進行驗證,最后對篩選的黏細菌陽性菌株的16SrDNA序列進行比對和同源性分析!窘Y(jié)果】利用互動篩選模型經(jīng)初篩和復(fù)篩分別獲得陽性產(chǎn)物25和19個,陽性率分別為2.23%和1.69%;而非互動篩選模型經(jīng)初篩和復(fù)篩獲得的陽性產(chǎn)物分別為20和4個,陽性率分別為1.78%和0.36%。互動篩選試驗的重現(xiàn)性為100%,而非互動篩選試驗的重觀性為50%。對互動篩選出的19個代謝產(chǎn)物的15株黏細菌來源菌株進行鑒定發(fā)現(xiàn),菌株83的16SrDNA序列與親緣關(guān)系最近的Myxococcus virescens strain DSM 494的同源性僅為96%,可能為新菌種!窘Y(jié)論】互動篩選方法能夠有效提高黏細菌活性產(chǎn)物篩選的陽性率,且重現(xiàn)性好。本研究所分離菌株83可能為1種新菌種,有望從中發(fā)現(xiàn)新的活性產(chǎn)物。
【作者單位】: 陜西省微生物研究所分子生物學(xué)研究中心;陜西省人民醫(yī)院普外一科;
【關(guān)鍵詞】: 互動篩選 黏細菌 代謝產(chǎn)物 抗真菌活性 互動藥物
【基金】:陜西省科技廳科技統(tǒng)籌創(chuàng)新工程計劃(一)項目(2012KTCL02-07) 陜西省科技廳社會發(fā)展攻關(guān)項目(2011K12-03-09) 陜西省科學(xué)院青年基金項目(2011K-24)
【分類號】:R371
【正文快照】: 黏細菌(Myxobacteria)是一類能在固體培養(yǎng)基上進行滑行運動的革蘭氏陰性桿菌,具有復(fù)雜多細胞行為和特殊的生活史[1],廣泛存在于微生物和有機物較豐富的地方[2]。與其他革蘭氏陰性細菌相比,黏細菌具有獨特的信號傳遞系統(tǒng)和形態(tài)發(fā)生過程,能夠形成子實體[3],并在進化過程中形成了
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本文編號:499885
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