本文關(guān)鍵詞：腸道病毒71型景德鎮(zhèn)分離株全基因組序列分析，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的分析2011年景德鎮(zhèn)地區(qū)重癥手足口病患兒標本腸道病毒71型(EV71)分離株2011JDZ35全基因組序列特征。方法采集重癥手足口病患兒咽拭子標本,進行病毒分離和逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)擴增分離病毒的全基因組序列,并進行全基因組核苷酸序列測定,參考EV71 A、B、C各基因型的參考毒株和國內(nèi)外分離毒株進行同源性分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。結(jié)果 2011JDZ35株的基因組長度為7406 bp,其中包括5'端非編碼區(qū)(5'UTR)長742 bp,病毒基因組編碼區(qū)(ORF)全長6582 bp及3'端非編碼區(qū)(3'UTR)長82 bp。ORF編碼含2193個氨基酸殘基的多聚蛋白。2011JDZ35株基因組的結(jié)構(gòu)與FY08-C30-P14、EV71/Ningbo.CHN/065/2010、HZ08/Hang-zhou/2008十分接近,整個基因組的核苷酸同源性分別為97.3%,97.3%,97.7%;氨基酸同源性為99.1%,99.2%,99.2%。均屬于C4亞型,而與Cox.A16國際標準株G10(U05876)及EV71國際標準株BrCr(U22521)差異較大,核苷酸同源性分別僅為77.5%,80.0%;氨基酸同源性為89.8%,94.8%。結(jié)論 EV71型病毒2011JDZ35株全基因組的組成和結(jié)構(gòu)符合腸道病毒特征,與其他EV71型病毒具有相同的基因組結(jié)構(gòu),2011JDZ35株與中國大陸浙江寧波株親緣關(guān)系最近,與阜陽株和杭州株等中國大陸內(nèi)陸地區(qū)分離株較近,而與馬來西亞、我國臺灣、廈門分離株的差異較為明顯,與國際標準株則有較大差異;2011JDZ35株與浙江寧波株具有共同的進化途徑,推斷2011JDZ35株與浙江寧波株可能共同來源于2008年中國大陸地區(qū)流行的EV71病毒株同一種系。
【作者單位】： 江西省景德鎮(zhèn)市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 腸道病毒型 基因型 手足口病 序列分析 基因組
【分類號】：R373
【正文快照】： 腸道病毒71型(enterovirus 71,EV71)屬小RNA病毒科,是引起兒童手足口病的主要病原[1]。手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)是一種能通過空氣飛沫、唾液或糞便傳播的疾病,主要感染5歲以下兒童,可造成散發(fā)式局部流行。自2008年以來,江西省全境出現(xiàn)了大量的手足口病例并伴

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