廣州市兩株人感染H5N6禽流感病毒全基因組序列特征分析
發(fā)布時間:2024-05-21 02:59
H5N6禽流感是重要的人獸共患病,給公共衛(wèi)生帶來嚴(yán)重威脅。為研究人感染H5N6禽流感病毒的基因特征,本文對廣州市兩株人感染H5N6禽流感病毒進行全基因組序列擴增,應(yīng)用生物信息學(xué)軟件分析分子變異和遺傳進化特征。結(jié)果顯示:兩毒株各基因片段同源性存在差異,血凝素(Hemagglutinin,HA)基因同源性最高為98.3%,PB2基因同源性最低為85.2%。A/Guangzhou/41641/2014(H5N6)病毒的HA、神經(jīng)氨酸酶(Neuraminidase,NA)、聚合酶堿性蛋白2(Polymerase basic protein 2,PB2)基因與貓源毒株A/feline/Guangdong/1/2015(H5N6)親緣關(guān)系較近,推測可能起源于共同祖先。兩株病毒均為禽源高致病性病毒,HA和NA表面蛋白受體結(jié)合位點、裂解位點和耐藥位點未發(fā)生變異。內(nèi)部基因重要位點均有不同程度的變異,其中以41641病毒變異較大,并發(fā)生PB2蛋白E627K突變。兩株病毒均發(fā)生與不同亞型病毒之間的重組現(xiàn)象,41641病毒的內(nèi)部基因分別與H5和H9N2/H7N9發(fā)生重組,其中PB2和PB1基因分別與2013年...
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【部分圖文】:
本文編號:3979509
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圖8NS1基因遺傳進化樹
圖7M1基因遺傳進化樹
圖5PA基因遺傳進化樹
圖6NP基因遺傳進化樹圖7M1基因遺傳進化樹
圖7M1基因遺傳進化樹
圖5PA基因遺傳進化樹圖8NS1基因遺傳進化樹
圖1HA基因遺傳進化樹
進化分析結(jié)果顯示,兩株病毒HA基因分別與A/feline/Guangdong/1/2015(H5N6)和A/chicken/Zhejiang/217/2016(H5N2)等廣東分離株親緣關(guān)系較近,位于Clade2.3.4.4.C分支;兩株病毒NA基因歸屬于H5N6進化分支,位于....
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