為了解在2012～2014年從中國不同城市分離到的食源性空腸彎曲菌的遺傳多樣性特征,本研究采用多序列位點分型(multilocus sequencing typing, MLST)的方法對分離到的33株食源性空腸彎曲菌進行分子分型。研究中,對33株菌株的管家基因使用7對不同的引物進行PCR擴增,并對擴增的產(chǎn)物使用凝膠電泳鑒定后進行測序。將測序結(jié)果同Pub MLST中Campylobacter數(shù)據(jù)庫進行比對,以獲得對應(yīng)菌株ST型,并提交新的ST型數(shù)據(jù)。利用其MLST數(shù)據(jù)構(gòu)建進化樹和最小生成樹。結(jié)果顯示33株食源性空腸彎曲菌可以分為27個ST型,其中有14種為新的ST型,可形成11種克隆復(fù)合體,優(yōu)勢克隆復(fù)合體為CC22和CC45,部分菌株的CC型也曾在臨床上發(fā)現(xiàn)。共存在91種核苷酸多態(tài)性位點,部分等位基因之間存在重組。這表明在2012-2014年間分離得到的菌株具有豐富的遺傳多樣性,并且有潛在致病風險。

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【部分圖文】：

圖1空腸彎曲菌等位基因重組分裂分解圖

為了解管家基因的重組情況，使用SplitsTreev4.0分別對7個管家基因的序列處理，并利用Splitdecomposition構(gòu)建重組分解分析圖，進行Phi-test計算，其結(jié)果如表2和圖1所示。從表2中Phi-test可知，基因aspA、tkt和uncA沒有發(fā)生....

圖2MLST分型構(gòu)建的最小生成樹

為進一步了解食源性空腸彎曲菌分離株的種群結(jié)構(gòu)，利用BioNumerics7.6對33株菌的MLST數(shù)據(jù)構(gòu)建最小生成樹（圖2）。從圖2a可知，所有的菌株可大致分為5簇：第一簇包含有6株菌，6個ST型，除ST3930不能形成克隆復(fù)合體外，其他菌株均為CC45；第二簇包括3株菌，3....

圖3MLST序列分型構(gòu)建進化樹

MLST分型是一種較為成熟且穩(wěn)定的分型方式，被廣泛的應(yīng)用于食源性致病菌的溯源和流行性分析。Weinberger等[18]對2003-2012年間自以色列分離的臨床分離株和獸醫(yī)分離株進行MLST分型，并結(jié)合人口統(tǒng)計元數(shù)據(jù)，調(diào)查空腸彎曲菌的分子流行病學特征發(fā)現(xiàn)，空腸彎曲菌分離株多樣性....

本文編號：3911057