目的探討我國大陸新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S)的分子特征,為特效藥物和疫苗的研發(fā)提供參考依據(jù)。方法從全球共享禽流感數(shù)據(jù)庫(GISAID)和GenBank數(shù)據(jù)庫收集2019年12月至2020年3月27日我國大陸255株新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)的S蛋白基因序列,利用MEGA6.0軟件分析S蛋白氨基酸序列的分子變異特征。結(jié)果 255株SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸序列處于系統(tǒng)進化樹的同一分支,同源性為96.8%～100%;bat-coronavirus-RaTG13病毒的S蛋白序列與255株SARS-CoV-2的氨基酸同源性為86.6%～93.4%。S蛋白6個關(guān)鍵位點和受體結(jié)合域(RBD)的3個關(guān)鍵位點均未發(fā)生變異,但4株病毒S蛋白的RBD域發(fā)生個別氨基酸突變。結(jié)論中國大陸SARS-CoV-2 S蛋白的氨基酸序列同源性較高,但仍需密切監(jiān)測其分子特征。

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圖1新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)S蛋白氨基酸種系進化樹

中國大陸SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸系統(tǒng)進化樹分析顯示:從GISAID和GenBank數(shù)據(jù)庫收集的255株SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸序列相互間差異較小,處于同一分支,其同源性為96.8%～100%。其中,hCoV-19/Shanghai/SH0104/2020/EP....

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