基于Label-free定量蛋白組學揭示腸道病毒A71型感染致人扁桃體上皮細胞蛋白質(zhì)組的改變
發(fā)布時間:2024-02-01 13:48
腸道病毒A組71型(Enterovirus-A71,EV-A71)感染引起的手足口病給嬰幼兒造成嚴重的疾病負擔,明確EV-A71的致病機制能為有效防控手足口病提供科學依據(jù)。為了研究EV-A71感染與人扁桃體上皮細胞的互作,本研究采用Label-free定量蛋白組學技術(shù)研究EV-A71感染人扁桃體上皮細胞UT-SCC-60B 6h和12h后蛋白質(zhì)組的改變情況,并確定EV-A71感染動力學(EV-A71 6h∶12h)過程中蛋白質(zhì)組的改變情況,并進行差異表達蛋白(Differentially expressed proteins,DEPs)的蛋白互作網(wǎng)絡和基因本體(Gene ontology,GO)分析。EV-A71感染6h時共有27個DEPs(下調(diào)12個DEPs,上調(diào)15個DEPs)發(fā)生顯著改變;EV-A71感染12h時共有62個DEPs(下調(diào)26個DEPs,上調(diào)36個DEPs)發(fā)生顯著改變;EV-A71感染動力學(EV-A71 6h∶12h)過程中共有40個DEPs(下調(diào)21個DEPs,上調(diào)19個DEPs)發(fā)生顯著改變。顯著發(fā)生改變的COX6C、TIMM10、MAP1LC3B、HIST...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1細胞與毒株
2主要試劑和儀器
3蛋白樣品制備及處理
4多肽脫鹽
5nano-UPLC分離、LC-MS/MS檢測和Labelfree定量
6統(tǒng)計學分析
結(jié)果
1EV-A71感染致人扁桃體上皮細胞蛋白質(zhì)組發(fā)生顯著改變
2 EV-A71感染所致DEPs的組間差異特征
3 EV-A71感染所致DEPs的蛋白間互作關系
4 EV-A71感染所致DEPs的GO分析
討論
本文編號:3892221
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材料與方法
1細胞與毒株
2主要試劑和儀器
3蛋白樣品制備及處理
4多肽脫鹽
5nano-UPLC分離、LC-MS/MS檢測和Labelfree定量
6統(tǒng)計學分析
結(jié)果
1EV-A71感染致人扁桃體上皮細胞蛋白質(zhì)組發(fā)生顯著改變
2 EV-A71感染所致DEPs的組間差異特征
3 EV-A71感染所致DEPs的蛋白間互作關系
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