目的新型冠狀病毒疫情在全球傳播,了解其變異進化規(guī)律,為疫情防控提供參考。方法選取公共數據庫中的新型冠狀病毒全基因組序列,采用生物信息學方法,對病毒基因組進行系統發(fā)育和氨基酸突變位點分析。結果系統發(fā)育分析顯示,子簇1和2包含多個國家和地區(qū)的毒株,子簇3以我國東南沿海地區(qū)毒株為主,子簇4為歐洲地區(qū)毒株。發(fā)現新型冠狀病毒存在25個穩(wěn)定突變位點,其中位于orf8∶84、orf3a∶251、orf1ab∶3607、orf1ab∶4714和S∶613與全基因組進化分成的4個分支具有密切聯系。其余突變位點與進化樹進一步分簇相關,具有形成穩(wěn)定克隆的潛力,可能成為新的流行株。結論穩(wěn)定變異有助于新型冠狀病毒傳播過程中的適應性進化,種內變異的發(fā)現有助于了解病毒的演化方向和流行趨勢,為新型冠狀病毒監(jiān)測和溯源提供參考依據。但這些穩(wěn)定變異位點對病毒的傳播和致病能力影響尚未得知,亟需更多分子生物學方面的深入研究。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
2 結果
    2.1全基因組進化
    2.2氨基酸突變位點
3 討論



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