發(fā)布時(shí)間：2022-12-23 22:12

　　為探究新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）關(guān)鍵受體ACE2基因的啟動(dòng)子、CpG島、轉(zhuǎn)錄因子以及SNP位點(diǎn),從GeneBank數(shù)據(jù)庫獲取人ACE2基因組序列和其在染色體的定位信息,并且利用多種生物信息學(xué)工具對其上游5′端的啟動(dòng)子、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)、CpG島、SNP等進(jìn)行預(yù)測和分析。結(jié)果表明,人ACE2基因5′調(diào)控區(qū)2 100 bp區(qū)域含啟動(dòng)子序列;Promoter 2.0和NNPP數(shù)據(jù)庫推測其區(qū)間分別存在1個(gè)、2個(gè)啟動(dòng)子;AliBaba 2.1和PROMO數(shù)據(jù)庫預(yù)測到其啟動(dòng)子保守區(qū)域共同的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)為24個(gè);當(dāng)設(shè)置Relative profile score threshold為95%,JASPAR網(wǎng)站預(yù)測到7個(gè)潛在的轉(zhuǎn)錄因子EOMES的結(jié)合位點(diǎn);此外,EMBOSS,MethPrimer及CpG finder均預(yù)測存在1個(gè)CpG島,而且位于282～558 bp,大小為277 bp;SNP function prediction還發(fā)現(xiàn)了7個(gè)SNP位點(diǎn)。本研究將為SARS-CoV-2的疫苗研制和新藥開發(fā)提供新的思路。 

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 人類ACE2基因的序列信息來源
    1.2 重要的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站
    1.3 方法
        1.3.1 人ACE2基因序列的獲取
        1.3.2 人ACE2基因啟動(dòng)子區(qū)域序列的獲取
        1.3.3 人ACE2基因啟動(dòng)子序列的分析
        1.3.4 人ACE2基因轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的分析
        1.3.5 人ACE2基因啟動(dòng)子CpG島分析
        1.3.6 人ACE2啟動(dòng)子區(qū)SNP篩選及其潛在功能預(yù)測
2 結(jié)果與分析
    2.1 人ACE2基因特征以及染色體定位
    2.2 人ACE2基因的啟動(dòng)子預(yù)測
    2.3 人ACE2基因5′調(diào)控區(qū)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分析
    2.4 人ACE2基因啟動(dòng)子區(qū)域甲基化CpG島預(yù)測
    2.5 人ACE2基因啟動(dòng)子區(qū)SNP預(yù)測和分析
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本文編號(hào)：3725509