目的研究一株新型鼠類星狀病毒的基因組特點和進化關系。方法采集221只山東省鼠類腸道內容物,采用高通量測序方法進行病毒組研究。結果發(fā)現(xiàn)一株新型星狀病毒,并獲得該病毒接近全長基因組,命名為RoAstV/CHN/S3。RoAstV/CHN/S3具有典型的星狀病毒基因組結構,相似性分析表明與嚙齒類動物星狀病毒和豬星狀病毒4型關系最為相近。ORF2的氨基酸遺傳距離結果顯示,RoAstV/CHN/S3與嚙齒類動物和豬星狀病毒4型的遺傳距離為0.557～0.655,哺乳星狀病毒屬內種之間的遺傳距離為0.338～0.783,推斷其可能為新種。根據(jù)ORF1a、ORF1b和ORF2的系統(tǒng)發(fā)育樹結果,RoAstV/CHN/S3與嚙齒類動物星狀病毒、豬星狀病毒4型聚為一簇,表明這些嚙齒類動物星狀病毒和豬星狀病毒4型具有共同祖先,也提示潛在的祖先跨種傳播。對221只鼠類的腸道內容物篩查結果顯示,4只鼠類為陽性,陽性率為1.8%,其中3只為褐家鼠,1只為黑線姬鼠,均來自山東省濟寧市。結論新型星狀病毒RoAstV/CHN/S3的發(fā)現(xiàn)豐富了星狀病毒的多樣性,為新發(fā)突發(fā)傳染病的防控提供了重要的數(shù)據(jù)信息。 

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