基于元分析的結(jié)核分枝桿菌感染巨噬細胞免疫應答關鍵基因的挖掘及驗證
發(fā)布時間:2022-07-19 14:19
研究背景及目的結(jié)核�。═B)是由結(jié)核分枝桿菌(M.tb)感染引起的一種傳染病,是全球十大死因之一,也是單一病原體感染造成死亡的主要原因,甚至超過了艾滋病。巨噬細胞作為免疫系統(tǒng)的基石,是先天性免疫的的重要組成部分,能夠攝取和降解衰老的細胞和微生物等異物,協(xié)調(diào)炎癥過程,成為宿主抵御M.tb的第一道防線。但是細胞分枝桿菌學的最新進展表明,M.tb使用復雜的策略來破壞巨噬細胞功能,以抵御宿主的先天性免疫清除作用,從而實現(xiàn)免疫逃逸。隨著微陣列技術的普及,很多公共平臺上提供了各種與生理和疾病狀況相關的基因表達數(shù)據(jù)。元分析能夠在嚴格的設計基礎上,對同一受試者的多項獨立研究結(jié)果進行系統(tǒng)和定量的綜合分析,極大的提高基因表達數(shù)據(jù)分析的統(tǒng)計學意義及可信度。本研究應用元分析技術對結(jié)核分枝桿菌H37Rv感染THP-1源性巨噬細胞表達譜芯片進行整合分析,高通量篩選巨噬細胞免疫應答關鍵基因,為進一步探索結(jié)核分枝桿菌感染的免疫應答機制提供參考,同時為結(jié)核病特效新藥的研發(fā)奠定基礎。材料及方法通過GEO Datasets數(shù)據(jù)庫搜集獲得結(jié)核分枝桿菌H37Rv感染人急性粒細胞白血病單核細胞THP-1源性巨噬細胞模型的表達譜芯...
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮寫詞表
第一章 緒論
1 結(jié)核病的概述
1.1 結(jié)核病與結(jié)核分枝桿菌
1.2 結(jié)核病的發(fā)病機制
1.3 巨噬細胞在結(jié)核病中的作用
1.4 結(jié)核分枝桿菌對抗巨噬細胞的策略
2 結(jié)核病相關的芯片數(shù)據(jù)研究的主要內(nèi)容
2.1 生物信息學
2.2 基因芯片技術
2.3 基因芯片數(shù)據(jù)分析工具和方法
2.4 基因芯片技術在結(jié)核病領域的應用
第二章 結(jié)核分枝桿菌H37Rv感染THP-1 源性巨噬細胞模型數(shù)據(jù)的收集與分析
1 材料與方法
1.1 基因芯片數(shù)據(jù)檢索
1.2 基因芯片數(shù)據(jù)元分析
1.3 聚類分析
1.4 蛋白互作網(wǎng)絡分析
1.5 通路富集分析
2 數(shù)據(jù)分析結(jié)果
2.1 基因芯片數(shù)據(jù)的提取結(jié)果
2.2 基因芯片數(shù)據(jù)的元分析結(jié)果
2.3 聚類分析
2.4 蛋白互作網(wǎng)絡
2.5 通路富集分析
第三章 結(jié)核分枝桿菌感染THP-1源性巨噬細胞的細胞實驗模型的建立及研究
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
2 實驗結(jié)果
2.1 細胞實驗模型
2.2 總RNA提取與鑒定
2.3 巨噬細胞OASL基因shRNA敲減實驗
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻
附錄
作者簡介
致謝
本文編號:3663570
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮寫詞表
第一章 緒論
1 結(jié)核病的概述
1.1 結(jié)核病與結(jié)核分枝桿菌
1.2 結(jié)核病的發(fā)病機制
1.3 巨噬細胞在結(jié)核病中的作用
1.4 結(jié)核分枝桿菌對抗巨噬細胞的策略
2 結(jié)核病相關的芯片數(shù)據(jù)研究的主要內(nèi)容
2.1 生物信息學
2.2 基因芯片技術
2.3 基因芯片數(shù)據(jù)分析工具和方法
2.4 基因芯片技術在結(jié)核病領域的應用
第二章 結(jié)核分枝桿菌H37Rv感染THP-1 源性巨噬細胞模型數(shù)據(jù)的收集與分析
1 材料與方法
1.1 基因芯片數(shù)據(jù)檢索
1.2 基因芯片數(shù)據(jù)元分析
1.3 聚類分析
1.4 蛋白互作網(wǎng)絡分析
1.5 通路富集分析
2 數(shù)據(jù)分析結(jié)果
2.1 基因芯片數(shù)據(jù)的提取結(jié)果
2.2 基因芯片數(shù)據(jù)的元分析結(jié)果
2.3 聚類分析
2.4 蛋白互作網(wǎng)絡
2.5 通路富集分析
第三章 結(jié)核分枝桿菌感染THP-1源性巨噬細胞的細胞實驗模型的建立及研究
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
2 實驗結(jié)果
2.1 細胞實驗模型
2.2 總RNA提取與鑒定
2.3 巨噬細胞OASL基因shRNA敲減實驗
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻
附錄
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致謝
本文編號:3663570
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