基于元分析的結(jié)核分枝桿菌感染巨噬細(xì)胞免疫應(yīng)答關(guān)鍵基因的挖掘及驗(yàn)證
發(fā)布時(shí)間:2022-07-19 14:19
研究背景及目的結(jié)核。═B)是由結(jié)核分枝桿菌(M.tb)感染引起的一種傳染病,是全球十大死因之一,也是單一病原體感染造成死亡的主要原因,甚至超過(guò)了艾滋病。巨噬細(xì)胞作為免疫系統(tǒng)的基石,是先天性免疫的的重要組成部分,能夠攝取和降解衰老的細(xì)胞和微生物等異物,協(xié)調(diào)炎癥過(guò)程,成為宿主抵御M.tb的第一道防線。但是細(xì)胞分枝桿菌學(xué)的最新進(jìn)展表明,M.tb使用復(fù)雜的策略來(lái)破壞巨噬細(xì)胞功能,以抵御宿主的先天性免疫清除作用,從而實(shí)現(xiàn)免疫逃逸。隨著微陣列技術(shù)的普及,很多公共平臺(tái)上提供了各種與生理和疾病狀況相關(guān)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。元分析能夠在嚴(yán)格的設(shè)計(jì)基礎(chǔ)上,對(duì)同一受試者的多項(xiàng)獨(dú)立研究結(jié)果進(jìn)行系統(tǒng)和定量的綜合分析,極大的提高基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義及可信度。本研究應(yīng)用元分析技術(shù)對(duì)結(jié)核分枝桿菌H37Rv感染THP-1源性巨噬細(xì)胞表達(dá)譜芯片進(jìn)行整合分析,高通量篩選巨噬細(xì)胞免疫應(yīng)答關(guān)鍵基因,為進(jìn)一步探索結(jié)核分枝桿菌感染的免疫應(yīng)答機(jī)制提供參考,同時(shí)為結(jié)核病特效新藥的研發(fā)奠定基礎(chǔ)。材料及方法通過(guò)GEO Datasets數(shù)據(jù)庫(kù)搜集獲得結(jié)核分枝桿菌H37Rv感染人急性粒細(xì)胞白血病單核細(xì)胞THP-1源性巨噬細(xì)胞模型的表達(dá)譜芯...
【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮寫詞表
第一章 緒論
1 結(jié)核病的概述
1.1 結(jié)核病與結(jié)核分枝桿菌
1.2 結(jié)核病的發(fā)病機(jī)制
1.3 巨噬細(xì)胞在結(jié)核病中的作用
1.4 結(jié)核分枝桿菌對(duì)抗巨噬細(xì)胞的策略
2 結(jié)核病相關(guān)的芯片數(shù)據(jù)研究的主要內(nèi)容
2.1 生物信息學(xué)
2.2 基因芯片技術(shù)
2.3 基因芯片數(shù)據(jù)分析工具和方法
2.4 基因芯片技術(shù)在結(jié)核病領(lǐng)域的應(yīng)用
第二章 結(jié)核分枝桿菌H37Rv感染THP-1 源性巨噬細(xì)胞模型數(shù)據(jù)的收集與分析
1 材料與方法
1.1 基因芯片數(shù)據(jù)檢索
1.2 基因芯片數(shù)據(jù)元分析
1.3 聚類分析
1.4 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
1.5 通路富集分析
2 數(shù)據(jù)分析結(jié)果
2.1 基因芯片數(shù)據(jù)的提取結(jié)果
2.2 基因芯片數(shù)據(jù)的元分析結(jié)果
2.3 聚類分析
2.4 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
2.5 通路富集分析
第三章 結(jié)核分枝桿菌感染THP-1源性巨噬細(xì)胞的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)?zāi)P偷慕⒓把芯?br> 1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)?zāi)P?br> 2.2 總RNA提取與鑒定
2.3 巨噬細(xì)胞OASL基因shRNA敲減實(shí)驗(yàn)
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡(jiǎn)介
致謝
本文編號(hào):3663570
【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮寫詞表
第一章 緒論
1 結(jié)核病的概述
1.1 結(jié)核病與結(jié)核分枝桿菌
1.2 結(jié)核病的發(fā)病機(jī)制
1.3 巨噬細(xì)胞在結(jié)核病中的作用
1.4 結(jié)核分枝桿菌對(duì)抗巨噬細(xì)胞的策略
2 結(jié)核病相關(guān)的芯片數(shù)據(jù)研究的主要內(nèi)容
2.1 生物信息學(xué)
2.2 基因芯片技術(shù)
2.3 基因芯片數(shù)據(jù)分析工具和方法
2.4 基因芯片技術(shù)在結(jié)核病領(lǐng)域的應(yīng)用
第二章 結(jié)核分枝桿菌H37Rv感染THP-1 源性巨噬細(xì)胞模型數(shù)據(jù)的收集與分析
1 材料與方法
1.1 基因芯片數(shù)據(jù)檢索
1.2 基因芯片數(shù)據(jù)元分析
1.3 聚類分析
1.4 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
1.5 通路富集分析
2 數(shù)據(jù)分析結(jié)果
2.1 基因芯片數(shù)據(jù)的提取結(jié)果
2.2 基因芯片數(shù)據(jù)的元分析結(jié)果
2.3 聚類分析
2.4 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
2.5 通路富集分析
第三章 結(jié)核分枝桿菌感染THP-1源性巨噬細(xì)胞的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)?zāi)P偷慕⒓把芯?br> 1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)?zāi)P?br> 2.2 總RNA提取與鑒定
2.3 巨噬細(xì)胞OASL基因shRNA敲減實(shí)驗(yàn)
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
作者簡(jiǎn)介
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本文編號(hào):3663570
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