發(fā)布時(shí)間：2022-02-20 03:40

　　加權(quán)網(wǎng)絡(luò)共表達(dá)分析（WGCNA）方法在誕生后的十多年間,已被應(yīng)用在疾病分型、發(fā)病機(jī)制、藥物研究、進(jìn)化機(jī)制、基因功能注釋等醫(yī)學(xué)細(xì)分領(lǐng)域并產(chǎn)生研究成果,這顯示出其廣泛的應(yīng)用前景。與此同時(shí),近三十年中網(wǎng)絡(luò)科學(xué)的研究成果也在經(jīng)濟(jì)、通信、控制、生物醫(yī)學(xué)等眾多領(lǐng)域取得應(yīng)用。WGCNA方法正是通過(guò)網(wǎng)絡(luò)科學(xué)中的無(wú)標(biāo)度網(wǎng)絡(luò)揭示了高度相關(guān)基因簇的表達(dá)與臨床指征之間的關(guān)系。然而,現(xiàn)有WGCNA方法存在整定標(biāo)準(zhǔn)不統(tǒng)一,結(jié)果差異性明顯等弊病。究其原因在于現(xiàn)有整數(shù)階框架下的WGCNA整定方法不夠優(yōu)化,其在描述中間過(guò)程和復(fù)雜現(xiàn)象的能力有限。分?jǐn)?shù)階微積分學(xué)作為一個(gè)善于解決反常問(wèn)題的有效工具,已在理、工、農(nóng)、商、醫(yī)等眾多領(lǐng)域獲得成功應(yīng)用,特別是其在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用已成為前沿。本文將Mittag-Leffler函數(shù)引入WGCNA方法的整定,提高了所生成無(wú)標(biāo)度網(wǎng)絡(luò)的自相似性,實(shí)現(xiàn)了影響幽門螺桿菌形成生物膜的核心基因選取。特別是探究了分?jǐn)?shù)階鄰接函數(shù)與幽門螺桿菌耐藥性,細(xì)胞膜之間的擴(kuò)散等微觀狀態(tài)的影響。首先,本文針對(duì)現(xiàn)有WGCNA鄰接函數(shù)無(wú)法有效提高無(wú)標(biāo)度網(wǎng)絡(luò)自相似性的弊端,引入Mittag-Leffler函數(shù)這一分?jǐn)?shù)階廣義... 

【文章來(lái)源】：山東大學(xué)山東省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 研究背景及意義
        1.1.1 分?jǐn)?shù)階微積分學(xué)發(fā)展現(xiàn)狀
        1.1.2 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模型研究現(xiàn)狀
    1.2 主要研究?jī)?nèi)容
    1.3 本文結(jié)構(gòu)安排
第二章 分?jǐn)?shù)階無(wú)標(biāo)度網(wǎng)絡(luò)建模
    2.1 分?jǐn)?shù)階微積分
    2.2 無(wú)標(biāo)度網(wǎng)絡(luò)
    2.3 鄰接函數(shù)
    2.4 本章小結(jié)
第三章 分?jǐn)?shù)階鄰接函數(shù)參數(shù)辨識(shí)及WGCNA優(yōu)化整定方法研究
    3.1 分?jǐn)?shù)階模型的數(shù)字化實(shí)現(xiàn)
    3.2 Gauss-Kronrod積分法
    3.3 分?jǐn)?shù)階鄰接函數(shù)的迭代學(xué)習(xí)辨識(shí)
        3.3.1 迭代學(xué)習(xí)辨識(shí)主要思想
        3.3.2 分?jǐn)?shù)階迭代學(xué)習(xí)辨識(shí)
        3.3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
    3.4 本章小結(jié)
第四章 分?jǐn)?shù)階WGCNA方法的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
    4.1 實(shí)驗(yàn)背景及實(shí)驗(yàn)思路
    4.2 實(shí)驗(yàn)環(huán)境
    4.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及流程
    4.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析
        4.4.1 幽門螺桿菌樣本聚類分析結(jié)果
        4.4.2 模塊劃分與結(jié)果驗(yàn)證
        4.4.3 基因模塊的多維尺度分析
        4.4.4 基因模塊與臨床指征的相關(guān)性分析
        4.4.5 目標(biāo)基因模塊基因簇與臨床指征的相關(guān)性分析
    4.5 本章小結(jié)
第五章 總結(jié)與展望
    5.1 研究總結(jié)
    5.2 研究展望
參考文獻(xiàn)
致謝
碩士期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
碩士期間申請(qǐng)的發(fā)明專利
參加的科研工作
所獲獎(jiǎng)勵(lì)與名譽(yù)
學(xué)位論文評(píng)閱及答辯情況表


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]一類具有變時(shí)滯的Hopfield型神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的全局指數(shù)穩(wěn)定性[J]. 孫建枝,武懷勤,單彩虹.  計(jì)算技術(shù)與自動(dòng)化. 2007(03)



本文編號(hào)：3634241