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EB病毒gp350/220抗原T-B聯(lián)合表位生物信息學預測

發(fā)布時間:2022-02-16 23:37
  為預測EB病毒(EBV)gp350/220抗原T-B聯(lián)合表位,采用在線軟件IEDB和SYFPEITHIT分別預測gp350/220抗原B細胞表位和T細胞表位,尋找該抗原B細胞和T細胞共同的區(qū)域即T-B聯(lián)合表位。gp350/220抗原存在潛在的T-B聯(lián)合表位區(qū)域:28-43、49-55、59-64、69-79、85-91、99-111、119-129、135-144。本文運用生物信息學方法確定了gp350/220分別存在5個T細胞抗原表位﹑6個B細胞表位和3個T-B細胞聯(lián)合表位區(qū)域,為進一步研發(fā)gp350/220高價優(yōu)勢表位疫苗奠定基礎。 

【文章來源】:中南醫(yī)學科學雜志. 2020,48(03)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 EBV gp350/220氨基酸序列
    1.2 gp350/220氨基酸序列跨膜序列的分析
    1.3 gp350/220抗原二級結(jié)構(gòu)預測
    1.4 gp350/220抗原B細胞和T細胞表位預測
    1.5 EBV gp350/220抗原T-B聯(lián)合表位的篩選
2 結(jié) 果
    2.1 查找Gen bank EBV gp350/220抗原的氨基酸序列
    2.2 運用TMHMM Sever2.0對gp350/220的跨膜序列進行分析
    2.3 gp350/220抗原蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預測
    2.4 T細胞表位預測結(jié)果
    2.5 運用DNAman軟件中的多重序列對比T、B細胞表位
3 討 論


【參考文獻】:
期刊論文
[1]攜帶EBV-LMP1Δ基因的DNA疫苗和腺病毒疫苗聯(lián)合免疫效果研究[J]. 尉秀霞,王湛,周玲,杜海軍,葉樹清,曾毅.  中國病毒病雜志. 2012(04)
[2]GPⅡb/Ⅲa抗體的二級結(jié)構(gòu)及T、B細胞表位的預測[J]. 李章球,張梅霞,胡海燕,劉順會,陸志剛.  生物醫(yī)學工程學雜志. 2010(05)
[3]FSHR胞外區(qū)抗原的二級結(jié)構(gòu)預測和B細胞表位預測[J]. 申子剛,閻萍,何畏,陳正瓊,何海洋,張記,楊霞,吳玉章,梁志清,李晉濤.  重慶醫(yī)科大學學報. 2010(09)
[4]EB病毒潛伏膜蛋白2的B細胞表位免疫原性研究[J]. 李文姝,鄭美霞,歐琴,朱珊麗,張麗芳.  中華傳染病雜志. 2010 (10)



本文編號:3628872

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