柯薩奇病毒A組6型TaqMan一步法實時熒光定量PCR方法的建立
發(fā)布時間:2021-10-07 21:15
目的建立一種靈敏、特異的一步法實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(RT-qPCR),用于快速、準(zhǔn)確地檢測柯薩奇病毒A組6型(CV-A6)。方法利用MEGA7.0軟件比對GenBank數(shù)據(jù)庫中15條CV-A6VP1序列,選擇高保守區(qū)域設(shè)計特異性引物和探針;以體外轉(zhuǎn)錄獲得的RNA為標(biāo)準(zhǔn)品,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,建立檢測CVA6病毒的RT-qPCR方法;對該方法的靈敏度、特異度、重復(fù)性進行評估;并利用該方法對CV-A6病毒感染后的乳鼠組織進行病毒載量的檢測。結(jié)果該方法在102~1011 copy/μL模板范圍內(nèi)出現(xiàn)良好的擴增曲線,檢測極限約為102 copy/μL,標(biāo)準(zhǔn)曲線中R2系數(shù)為0.999,擴增效率為109.6%;且該方法對腸道病毒71型(EVA71)、柯薩奇病毒A組16型(CV-A16)和柯薩奇病毒A組10型(CV-A10)均無交叉反應(yīng);另外,該方法在組間重復(fù)試驗中,變異系數(shù)(CV)值小于2.0%。結(jié)論本實驗建立的方法具有較強的靈敏度、特異度和重復(fù)性,可用于CV-A6病毒的日常檢測、實驗室診斷和定量分析。
【文章來源】:國際檢驗醫(yī)學(xué)雜志. 2020,41(11)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
不同稀釋度的擴增曲線
利用該方法檢測EV-A71、CV-A16、CV-A6和CV-A10病毒核酸時,僅有CV-A6出現(xiàn)陽性擴增曲線,其余病毒及NTC檢測結(jié)果均為陰性,見圖2。2.5 乳鼠組織病毒載量檢測結(jié)果
用該方法檢測YN-A13毒株感染1日齡BALB/c乳鼠后各組織中CV-A6的載量。其中,各樣本均出現(xiàn)良好的擴增曲線見圖3A。Ct值在18.98~34.46,根據(jù)各樣本達到熒光閾值對應(yīng)的Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線的公式可精確計算出各組織中CV-A6病毒的載量,見圖3B。3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]禽流感病毒實時熒光定量RT-PCR檢測方法的建立[J]. 王楷宬,王素春,朱琳,仲煥香,黃保續(xù). 中國動物檢疫. 2019(04)
[2]以主要流行EV71 VP1基因高度保守區(qū)為靶點的TaqMan熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 胡曉星,彭杰,馮悅,劉麗,張阿梅,夏雪山. 生命科學(xué)研究. 2016(03)
[3]柯薩奇病毒A6 TaqMan探針實時熒光逆轉(zhuǎn)錄PCR檢測方法的建立[J]. 李洋,張相萍,翟明強,黃學(xué)勇,李懿. 中國病原生物學(xué)雜志. 2015(11)
[4]柯薩奇病毒A組16型TaqMan一步法熒光定量RT-PCR快速檢測方法的建立[J]. 蔡麗娟,陳瑤,杜紅延,陳驪嘉,李明. 廣東醫(yī)學(xué). 2012(05)
[5]柯薩奇病毒B3的TaqMan實時熒光定量RT-PCR檢測方法的建立[J]. 代海麗,高鐵磊,朱琳,曹威,欒穎,靳占峰. 中國衛(wèi)生檢驗雜志. 2012(01)
本文編號:3422783
【文章來源】:國際檢驗醫(yī)學(xué)雜志. 2020,41(11)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
不同稀釋度的擴增曲線
利用該方法檢測EV-A71、CV-A16、CV-A6和CV-A10病毒核酸時,僅有CV-A6出現(xiàn)陽性擴增曲線,其余病毒及NTC檢測結(jié)果均為陰性,見圖2。2.5 乳鼠組織病毒載量檢測結(jié)果
用該方法檢測YN-A13毒株感染1日齡BALB/c乳鼠后各組織中CV-A6的載量。其中,各樣本均出現(xiàn)良好的擴增曲線見圖3A。Ct值在18.98~34.46,根據(jù)各樣本達到熒光閾值對應(yīng)的Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線的公式可精確計算出各組織中CV-A6病毒的載量,見圖3B。3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]禽流感病毒實時熒光定量RT-PCR檢測方法的建立[J]. 王楷宬,王素春,朱琳,仲煥香,黃保續(xù). 中國動物檢疫. 2019(04)
[2]以主要流行EV71 VP1基因高度保守區(qū)為靶點的TaqMan熒光定量PCR檢測方法的建立[J]. 胡曉星,彭杰,馮悅,劉麗,張阿梅,夏雪山. 生命科學(xué)研究. 2016(03)
[3]柯薩奇病毒A6 TaqMan探針實時熒光逆轉(zhuǎn)錄PCR檢測方法的建立[J]. 李洋,張相萍,翟明強,黃學(xué)勇,李懿. 中國病原生物學(xué)雜志. 2015(11)
[4]柯薩奇病毒A組16型TaqMan一步法熒光定量RT-PCR快速檢測方法的建立[J]. 蔡麗娟,陳瑤,杜紅延,陳驪嘉,李明. 廣東醫(yī)學(xué). 2012(05)
[5]柯薩奇病毒B3的TaqMan實時熒光定量RT-PCR檢測方法的建立[J]. 代海麗,高鐵磊,朱琳,曹威,欒穎,靳占峰. 中國衛(wèi)生檢驗雜志. 2012(01)
本文編號:3422783
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