細粒棘球絳蟲多價EgA31-EgG1Y162抗原序列優(yōu)化分析
發(fā)布時間:2021-09-23 20:48
目的:將優(yōu)化的EgA31-EgG1Y162抗原基因構(gòu)建于pET30a上,誘導蛋白表達,SDS-PAGE鑒定蛋白表達效果,用生物信息學軟件分析優(yōu)化的EgA31-EgG1Y162抗原序列,為構(gòu)建高效的疫苗奠定理論基礎(chǔ)。方法:運用ProtParam,DNAstar,E.coli Codon Usage Analyzer等多種生物信息學軟件分析優(yōu)化后EgA31-EgG1Y162蛋白的理化性質(zhì),比較其優(yōu)化前后序列的異同點及抗原表位分布情況等。結(jié)果:EgA31-EgG1Y162蛋白屬于不穩(wěn)定性蛋白且親水性蛋白,通過網(wǎng)上在線軟件分析,優(yōu)化序列的密碼子中不含利用率低的密碼子。表位預(yù)測分析確定6個T細胞表位的氨基酸區(qū)域1~15、86~97、177~193、359~388、305~319、344~358和7個B細胞表位為102~112、172~204、318~334、343~353、394~409、415~431、443~458。結(jié)論:多價EgA31-EgG1y162融合抗原蛋白的優(yōu)化序列中不含利用率低的密碼子,且T和B細胞表位未受影響,為重組蛋白體外的有效表達奠定實驗基礎(chǔ),對包蟲病的多價表位疫苗研究具有...
【文章來源】:中國免疫學雜志. 2020,36(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
蛋白誘導表達 SDS-PAGE 結(jié)果
SOMPA 分析蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)
DNAstar分析EgA31-EgG1Y162蛋白二級結(jié)構(gòu)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]生物信息分析細粒棘球絳蟲EgA31蛋白T細胞及B細胞的優(yōu)勢抗原表位[J]. 趙驍,張峰波,王紅英,閆芳,安夢婷,李玉嬌,龐楠楠,丁劍冰. 中國組織工程研究. 2019(07)
[2]包蟲病免疫及疫苗的研究進展[J]. 丁劍冰,李玉嬌,張峰波. 新疆醫(yī)科大學學報. 2019(01)
[3]細粒棘球蚴感染者中Tim-3+CD4+CD25+Treg細胞及相關(guān)因子的表達[J]. 趙慧,王亮,張峰波,朱玥潔,龐楠楠,安夢婷,李斌,馬秀敏,丁劍冰. 免疫學雜志. 2018(06)
[4]擬密碼子適應(yīng)指數(shù)方法的設(shè)計及應(yīng)用[J]. 馬沖,祖穎,朱平. 生命科學研究. 2018(02)
[5]IL-21/BCL-6/Blimp-1在囊性包蟲病中的表達特點研究[J]. 耿新惠,張峰波,姜敏,趙慧,安夢婷,龐楠楠,王紅英,丁劍冰. 中國免疫學雜志. 2018(03)
[6]Liver cystic echinococcosis and human host immune and autoimmune follow-up:A review[J]. Nikica M Grubor,Katica D Jovanova-Nesic,Yehuda Shoenfeld. World Journal of Hepatology. 2017(30)
[7]細粒棘球絳蟲myophilin的抗原表位預(yù)測[J]. 何順偉,魏曉星. 中國病原生物學雜志. 2017(01)
[8]細粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4抗原表位的特性分析[J]. 安夢婷,吾拉木·馬木提,馬海梅,張峰波,王紅英,趙慧,丁劍冰. 新疆醫(yī)科大學學報. 2016(12)
[9]Tim-3/Galectin-9與Th1/Th2相關(guān)因子在人細粒棘球蚴感染中的表達研究[J]. 趙慧,張峰波,龐楠楠,朱玥潔,向陽,吳夢茹,辛燕,馬秀敏,丁劍冰. 新疆醫(yī)科大學學報. 2016(03)
[10]弓形蟲多價疫苗研究近況[J]. 杜海娟,田春林. 中國人獸共患病學報. 2013(06)
本文編號:3406383
【文章來源】:中國免疫學雜志. 2020,36(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
蛋白誘導表達 SDS-PAGE 結(jié)果
SOMPA 分析蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)
DNAstar分析EgA31-EgG1Y162蛋白二級結(jié)構(gòu)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]生物信息分析細粒棘球絳蟲EgA31蛋白T細胞及B細胞的優(yōu)勢抗原表位[J]. 趙驍,張峰波,王紅英,閆芳,安夢婷,李玉嬌,龐楠楠,丁劍冰. 中國組織工程研究. 2019(07)
[2]包蟲病免疫及疫苗的研究進展[J]. 丁劍冰,李玉嬌,張峰波. 新疆醫(yī)科大學學報. 2019(01)
[3]細粒棘球蚴感染者中Tim-3+CD4+CD25+Treg細胞及相關(guān)因子的表達[J]. 趙慧,王亮,張峰波,朱玥潔,龐楠楠,安夢婷,李斌,馬秀敏,丁劍冰. 免疫學雜志. 2018(06)
[4]擬密碼子適應(yīng)指數(shù)方法的設(shè)計及應(yīng)用[J]. 馬沖,祖穎,朱平. 生命科學研究. 2018(02)
[5]IL-21/BCL-6/Blimp-1在囊性包蟲病中的表達特點研究[J]. 耿新惠,張峰波,姜敏,趙慧,安夢婷,龐楠楠,王紅英,丁劍冰. 中國免疫學雜志. 2018(03)
[6]Liver cystic echinococcosis and human host immune and autoimmune follow-up:A review[J]. Nikica M Grubor,Katica D Jovanova-Nesic,Yehuda Shoenfeld. World Journal of Hepatology. 2017(30)
[7]細粒棘球絳蟲myophilin的抗原表位預(yù)測[J]. 何順偉,魏曉星. 中國病原生物學雜志. 2017(01)
[8]細粒棘球蚴AgB1、AgB2、AgB4抗原表位的特性分析[J]. 安夢婷,吾拉木·馬木提,馬海梅,張峰波,王紅英,趙慧,丁劍冰. 新疆醫(yī)科大學學報. 2016(12)
[9]Tim-3/Galectin-9與Th1/Th2相關(guān)因子在人細粒棘球蚴感染中的表達研究[J]. 趙慧,張峰波,龐楠楠,朱玥潔,向陽,吳夢茹,辛燕,馬秀敏,丁劍冰. 新疆醫(yī)科大學學報. 2016(03)
[10]弓形蟲多價疫苗研究近況[J]. 杜海娟,田春林. 中國人獸共患病學報. 2013(06)
本文編號:3406383
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