無形體分泌蛋白Ats-1與宿主細胞互作蛋白篩選及其生物信息分析
發(fā)布時間:2021-09-17 14:19
目的篩選與無形體Ats-1互作的THP-1宿主細胞蛋白,為揭示病原體侵襲宿主的致病機理提供科學(xué)數(shù)據(jù)。方法利用分子克隆法構(gòu)建p GBKT7-ats-1誘餌質(zhì)粒并轉(zhuǎn)化酵母Y2HGold,驗證誘餌質(zhì)粒是否有自激活、毒性現(xiàn)象;制備THP-1細胞c DNA并連接到p GADT7-Rec上,轉(zhuǎn)化酵母Y187并鑒定c DNA文庫質(zhì)量;酵母雙雜交篩選與Ats-1互作的宿主細胞靶蛋白,通過GO、String生物信息分析細胞靶蛋白可能的生物學(xué)過程。結(jié)果成功構(gòu)建誘餌質(zhì)粒;cDNA文庫容量4×106克隆,插入片段100~3 000 bp,且無污染,達到建庫質(zhì)控要求;酵母雙雜交結(jié)果顯示,與Ats-1蛋白互作的宿主細胞靶蛋白7個,分別是真核延伸因子1復(fù)合體α1亞基(EEF1A1)、TIMP金屬蛋白酶抑制子1(TIMP1)、鋅指蛋白36,C3H樣2 (ZFP36L2)、半乳糖凝集素1(LGALS1)、前胸腺素α(PTMA)、WBSCR22、吸引素(ATRN)。生物信息分析顯示,與Ats-1互作的宿主靶蛋白主要參與細胞分化增殖、細胞凋亡、自噬、炎癥等生物學(xué)過程。結(jié)論病原誘餌蛋白與宿主細胞靶蛋白互...
【文章來源】:石河子大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,38(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
目的基因ats-1的PCR擴增
Ats-1蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
Ats-1蛋白質(zhì)無形體內(nèi)互作網(wǎng)絡(luò)圖
本文編號:3398901
【文章來源】:石河子大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,38(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
目的基因ats-1的PCR擴增
Ats-1蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
Ats-1蛋白質(zhì)無形體內(nèi)互作網(wǎng)絡(luò)圖
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