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無形體分泌蛋白Ats-1與宿主細胞互作蛋白篩選及其生物信息分析

發(fā)布時間:2021-09-17 14:19
  目的篩選與無形體Ats-1互作的THP-1宿主細胞蛋白,為揭示病原體侵襲宿主的致病機理提供科學數(shù)據(jù)。方法利用分子克隆法構建p GBKT7-ats-1誘餌質粒并轉化酵母Y2HGold,驗證誘餌質粒是否有自激活、毒性現(xiàn)象;制備THP-1細胞c DNA并連接到p GADT7-Rec上,轉化酵母Y187并鑒定c DNA文庫質量;酵母雙雜交篩選與Ats-1互作的宿主細胞靶蛋白,通過GO、String生物信息分析細胞靶蛋白可能的生物學過程。結果成功構建誘餌質粒;cDNA文庫容量4×106克隆,插入片段100~3 000 bp,且無污染,達到建庫質控要求;酵母雙雜交結果顯示,與Ats-1蛋白互作的宿主細胞靶蛋白7個,分別是真核延伸因子1復合體α1亞基(EEF1A1)、TIMP金屬蛋白酶抑制子1(TIMP1)、鋅指蛋白36,C3H樣2 (ZFP36L2)、半乳糖凝集素1(LGALS1)、前胸腺素α(PTMA)、WBSCR22、吸引素(ATRN)。生物信息分析顯示,與Ats-1互作的宿主靶蛋白主要參與細胞分化增殖、細胞凋亡、自噬、炎癥等生物學過程。結論病原誘餌蛋白與宿主細胞靶蛋白互... 

【文章來源】:石河子大學學報(自然科學版). 2020,38(02)北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

無形體分泌蛋白Ats-1與宿主細胞互作蛋白篩選及其生物信息分析


目的基因ats-1的PCR擴增

網絡圖,三級結構,蛋白質,網絡圖


Ats-1蛋白質三級結構預測

網絡圖,蛋白質,網絡圖,三級結構


Ats-1蛋白質無形體內互作網絡圖


本文編號:3398901

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