目的人乳頭瘤病毒（HPV）與全球約4.5%的癌癥密切相關(guān),與幾乎所有宮頸癌相關(guān),其中HPV16和HPV18約占70%。方法鑒于E6/E7蛋白是維持HPV陽(yáng)性癌細(xì)胞惡性表型的關(guān)鍵因素,是開(kāi)發(fā)治療性HPV疫苗的潛在靶標(biāo),通過(guò)分子模擬理論預(yù)測(cè)潛在抗原表位可以為疫苗開(kāi)發(fā)提供理論指導(dǎo)。結(jié)果本研究利用在線工具預(yù)測(cè)HPV16、HPV18 E6/E7蛋白的潛在抗原表位,通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬獲得表位與MHC結(jié)合的穩(wěn)定構(gòu)象,結(jié)合自由能計(jì)算結(jié)果顯示表位KLPDLCTEL（-31.02 kcal/mol）、TLQQDIVLHL（-31.33 kcal/mol）、YMLDLQPET（-34.09 kcal/mol）與HLA-A*0201具有潛在結(jié)合能力。結(jié)論通過(guò)分析表位與MHC結(jié)合模式,為表位的改造與HPV治療性疫苗研究提供了理論線索。 

【文章來(lái)源】：免疫學(xué)雜志. 2020,36(08)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

MHC/表位復(fù)合物RMSD圖

在線預(yù)測(cè)的抗原表位中，YMLDLQPET(PDBID:6E1I）和LLMGTLGIV(PDBID:6APN，結(jié)合表位為L(zhǎng)LMGTLGIVGGG）與HLA-A*0201的晶體結(jié)構(gòu)已經(jīng)報(bào)道（研究論文暫未公開(kāi)發(fā)表），本研究則以表位YMLDLQPET為對(duì)照，通過(guò)分子分子動(dòng)力學(xué)模擬獲得抗原表位與MHC結(jié)合的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，表位與HLA-A*0201的結(jié)合自由能顯示，盡管表位TLQDIVLHL在線預(yù)測(cè)的親和力較差，但結(jié)合親和力更強(qiáng)，有利于與HLA-A*0201的結(jié)合。圖3 表位與MHC相互作用

圖2 表位各氨基酸的結(jié)合自由能分解基于分子動(dòng)力學(xué)模擬獲得的MHC/表位復(fù)合物穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，本研究系統(tǒng)分析了表位與MHC結(jié)合的構(gòu)象變化、氫鍵數(shù)量、表位氨基酸的結(jié)合能貢獻(xiàn)，為抗原表位的改造提供了理論依據(jù)。同時(shí)，通過(guò)分析MHC/表位復(fù)合物的空間結(jié)構(gòu)，能夠推測(cè)其與TCR結(jié)合的可能性，為表位篩選提供更多信息。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3331552