HPV16/18E6/E7蛋白抗原表位理論預(yù)測(cè)與分子模擬研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-09 06:24
目的人乳頭瘤病毒(HPV)與全球約4.5%的癌癥密切相關(guān),與幾乎所有宮頸癌相關(guān),其中HPV16和HPV18約占70%。方法鑒于E6/E7蛋白是維持HPV陽(yáng)性癌細(xì)胞惡性表型的關(guān)鍵因素,是開(kāi)發(fā)治療性HPV疫苗的潛在靶標(biāo),通過(guò)分子模擬理論預(yù)測(cè)潛在抗原表位可以為疫苗開(kāi)發(fā)提供理論指導(dǎo)。結(jié)果本研究利用在線工具預(yù)測(cè)HPV16、HPV18 E6/E7蛋白的潛在抗原表位,通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬獲得表位與MHC結(jié)合的穩(wěn)定構(gòu)象,結(jié)合自由能計(jì)算結(jié)果顯示表位KLPDLCTEL(-31.02 kcal/mol)、TLQQDIVLHL(-31.33 kcal/mol)、YMLDLQPET(-34.09 kcal/mol)與HLA-A*0201具有潛在結(jié)合能力。結(jié)論通過(guò)分析表位與MHC結(jié)合模式,為表位的改造與HPV治療性疫苗研究提供了理論線索。
【文章來(lái)源】:免疫學(xué)雜志. 2020,36(08)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
MHC/表位復(fù)合物RMSD圖
在線預(yù)測(cè)的抗原表位中,YMLDLQPET(PDBID:6E1I)和LLMGTLGIV(PDBID:6APN,結(jié)合表位為L(zhǎng)LMGTLGIVGGG)與HLA-A*0201的晶體結(jié)構(gòu)已經(jīng)報(bào)道(研究論文暫未公開(kāi)發(fā)表),本研究則以表位YMLDLQPET為對(duì)照,通過(guò)分子分子動(dòng)力學(xué)模擬獲得抗原表位與MHC結(jié)合的穩(wěn)定結(jié)構(gòu),表位與HLA-A*0201的結(jié)合自由能顯示,盡管表位TLQDIVLHL在線預(yù)測(cè)的親和力較差,但結(jié)合親和力更強(qiáng),有利于與HLA-A*0201的結(jié)合。圖3 表位與MHC相互作用
圖2 表位各氨基酸的結(jié)合自由能分解基于分子動(dòng)力學(xué)模擬獲得的MHC/表位復(fù)合物穩(wěn)定結(jié)構(gòu),本研究系統(tǒng)分析了表位與MHC結(jié)合的構(gòu)象變化、氫鍵數(shù)量、表位氨基酸的結(jié)合能貢獻(xiàn),為抗原表位的改造提供了理論依據(jù)。同時(shí),通過(guò)分析MHC/表位復(fù)合物的空間結(jié)構(gòu),能夠推測(cè)其與TCR結(jié)合的可能性,為表位篩選提供更多信息。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HPV 18型E6蛋白抗原表位預(yù)測(cè)與分析[J]. 蘇琳,張祥,李泳榆,劉思靜,蔣明娟,汪川. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2018(07)
[2]HPV逃避宮頸癌宿主免疫應(yīng)答的機(jī)制[J]. 唐雋,郝飛. 免疫學(xué)雜志. 2011(07)
[3]HPV18E7抗原HLA-A2限制性CTL表位的初步篩選[J]. 張乾,鄭飛云,徐云升,歐榮英,余劍琴. 溫州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2007(02)
[4]HPV16E7抗原HLA-A2限制性CTL表位預(yù)測(cè)及其合成[J]. 徐云升,郝飛,吳玉章,林治華,賈正才,郝進(jìn). 免疫學(xué)雜志. 2003(02)
本文編號(hào):3331552
【文章來(lái)源】:免疫學(xué)雜志. 2020,36(08)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
MHC/表位復(fù)合物RMSD圖
在線預(yù)測(cè)的抗原表位中,YMLDLQPET(PDBID:6E1I)和LLMGTLGIV(PDBID:6APN,結(jié)合表位為L(zhǎng)LMGTLGIVGGG)與HLA-A*0201的晶體結(jié)構(gòu)已經(jīng)報(bào)道(研究論文暫未公開(kāi)發(fā)表),本研究則以表位YMLDLQPET為對(duì)照,通過(guò)分子分子動(dòng)力學(xué)模擬獲得抗原表位與MHC結(jié)合的穩(wěn)定結(jié)構(gòu),表位與HLA-A*0201的結(jié)合自由能顯示,盡管表位TLQDIVLHL在線預(yù)測(cè)的親和力較差,但結(jié)合親和力更強(qiáng),有利于與HLA-A*0201的結(jié)合。圖3 表位與MHC相互作用
圖2 表位各氨基酸的結(jié)合自由能分解基于分子動(dòng)力學(xué)模擬獲得的MHC/表位復(fù)合物穩(wěn)定結(jié)構(gòu),本研究系統(tǒng)分析了表位與MHC結(jié)合的構(gòu)象變化、氫鍵數(shù)量、表位氨基酸的結(jié)合能貢獻(xiàn),為抗原表位的改造提供了理論依據(jù)。同時(shí),通過(guò)分析MHC/表位復(fù)合物的空間結(jié)構(gòu),能夠推測(cè)其與TCR結(jié)合的可能性,為表位篩選提供更多信息。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HPV 18型E6蛋白抗原表位預(yù)測(cè)與分析[J]. 蘇琳,張祥,李泳榆,劉思靜,蔣明娟,汪川. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2018(07)
[2]HPV逃避宮頸癌宿主免疫應(yīng)答的機(jī)制[J]. 唐雋,郝飛. 免疫學(xué)雜志. 2011(07)
[3]HPV18E7抗原HLA-A2限制性CTL表位的初步篩選[J]. 張乾,鄭飛云,徐云升,歐榮英,余劍琴. 溫州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2007(02)
[4]HPV16E7抗原HLA-A2限制性CTL表位預(yù)測(cè)及其合成[J]. 徐云升,郝飛,吳玉章,林治華,賈正才,郝進(jìn). 免疫學(xué)雜志. 2003(02)
本文編號(hào):3331552
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/jichuyixue/3331552.html
最近更新
教材專著