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銅綠假單胞菌毒性噬菌體φPA-HF17的分離鑒定及生物學特性的分析

發(fā)布時間:2017-04-25 16:19

  本文關(guān)鍵詞:銅綠假單胞菌毒性噬菌體φPA-HF17的分離鑒定及生物學特性的分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是假單胞菌屬的主要成員,為革蘭染色陰性的非發(fā)酵菌,廣泛分布于自然界的土壤和水中,亦可存在于醫(yī)院潮濕的環(huán)境內(nèi)。銅綠假單胞菌是引起醫(yī)院內(nèi)感染主要的致病菌之一。特別是當機體免疫功能下降時,,可引起多種疾病,如呼吸機相關(guān)性肺炎、急性下呼吸道炎癥、囊性纖維化患者的慢性呼吸道炎癥、角膜炎、導(dǎo)尿管置留引起的尿道炎以及皮膚和傷口的感染等。由于銅綠假單胞菌適應(yīng)性極強,常成為醫(yī)院內(nèi)爆發(fā)性感染的元兇。此外,銅綠假單胞菌多重耐藥(multidrug-resistant)菌株的不斷出現(xiàn)和生物膜的形成給臨床治療帶來嚴重困難。噬菌體是能夠感染并殺死細菌的病毒,且存在于土壤、海洋、湖泊甚至動物的腸道內(nèi)。鑒于目前耐藥性細菌的嚴峻形勢,噬菌體療法(Phage Therapy)重新引起一些科學工作者們的興趣和有關(guān)國家及一些國際機構(gòu)的重視。 本研究以27株銅綠假單胞菌臨床分離株為宿主菌,采用傳統(tǒng)的雙層瓊脂噬斑法從生活污水和醫(yī)院污水中初步分離出16株毒性噬菌體,從中選擇4株噬菌體(分別命名為φPA-HF7、φPA-HF12、φPA-HF17和φPA-HF20)進行電鏡觀察。結(jié)果顯示,噬菌體φPA-HF7屬于有尾噬菌體目(Caudovirales Order)、長尾病毒科(Siphoviridae)噬菌體,噬菌體φPA-HF12屬于有尾噬菌體目的肌尾病毒科(Myoviridae)噬菌體,φPA-HF17和φPA-HF20則屬于有尾噬菌體目的足尾病毒科(Podoviridae)噬菌體。通過對噬菌體φPA-HF17生物學特性的研究及基因組的初步分析發(fā)現(xiàn):(1) φPA-HF17的頭部呈立體對稱、直徑約50nm,尾部較短、長約5~10nm;(2) φPA-HF17的基因組為雙鏈DNA,限制性內(nèi)切酶圖譜分析表明,基因組含有Nde I、 Xho I、XbaI、Pst I、Hind III和EcoR I的多個酶切位點,初步推算基因組大小約為38kb;(3) φPA-HF17具有較高的裂解活性,能裂解12株銅綠假單胞菌分離株(裂解率為44.0%);(4)噬菌體φPA-HF17的最佳感染復(fù)數(shù)(Multiplicity of infection, MOI)為0.01;(5)一步生長曲線顯示,φPA-HF17的潛伏期為10分鐘,爆發(fā)期持續(xù)60分鐘,爆發(fā)量為218PFU/cell;(6)吸收試驗表明,當MOI=0.01時,在4分鐘內(nèi)超過90%的φPA-HF17吸附或穿入宿主細胞內(nèi);(7)SDS-PAGE蛋白電泳可觀察到3種主要蛋白和至少8種次要蛋白,其中位于40kDa的主要蛋白帶可能是噬菌體φPA-HF17的衣殼蛋白;(8)穩(wěn)定性試驗發(fā)現(xiàn),噬菌體φPA-HF17在60℃30min和pH4~10的范圍內(nèi)仍具有較高的裂解活性;(9)全基因組測序發(fā)現(xiàn)噬菌體PA-HF17基因組由39208個堿基組成,GC含量達到49.68%,共有46個編碼蛋白質(zhì)的基因,不具備tRNA和rRNA。 根據(jù)上述的研究結(jié)果,得出下列結(jié)論: 1.4株銅綠假單胞菌噬菌體(φPA-HF7、φPA-HF12、φPA-HF17和φPA-HF20)為毒性噬菌體,屬有尾噬菌體目,其中φPA-HF7為長尾病毒科噬菌體,φPA-HF12屬于肌尾病毒科噬菌體,φPA-HF17和φPA-HF20則屬于足尾病毒科噬菌體。 2.φ PA-HF17基因組大小為39208堿基,GC含量百分比為49.6%。 3. φPA-HF17是一種潛伏期短、裂解效率高、裂解譜寬以及在60℃和pH4~10的范圍仍具有裂解活性的噬菌體,可考慮用于耐藥性銅綠假單胞菌感染的噬菌體生物制劑的開發(fā)。
【關(guān)鍵詞】:噬菌體 噬菌體療法 銅綠假單胞菌 細菌耐藥性
【學位授予單位】:吉林大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R378
【目錄】:
  • 中文摘要4-7
  • Abstract7-13
  • 第一章 文獻綜述13-23
  • 1.1 銅綠假單胞菌概述13-14
  • 1.2 噬菌體概述14-16
  • 1.3 噬菌體療法16-23
  • 第二章 銅綠假單胞菌噬菌體的分離鑒定及生物學特性的研究23-51
  • 2.1 材料23-24
  • 2.1.1 宿主菌株23
  • 2.1.2 污水樣本23
  • 2.1.3 主要試劑23-24
  • 2.1.4 主要儀器24
  • 2.2 方法24-34
  • 2.2.1 銅綠假單胞菌 16SrRNA 鑒定24-26
  • 2.2.2 銅綠假單胞菌噬菌體的分離純化及滴度測定26-27
  • 2.2.3 噬菌體透射電子顯微鏡觀察27-28
  • 2.2.4 噬菌體 DNA 提取及限制性內(nèi)切酶分析28-29
  • 2.2.5 裂解率測定29
  • 2.2.6 最佳感染復(fù)數(shù)(MOI)的測定29-30
  • 2.2.7 一步生長曲線的繪制30-31
  • 2.2.8 吸收率測定31
  • 2.2.9 噬菌體蛋白 SDS-PAGE 分析31-33
  • 2.2.10 噬菌體 pH 及溫度穩(wěn)定性測定33-34
  • 2.2.11 噬菌體全基因組測序初步分析34
  • 2.3 結(jié)果34-47
  • 2.3.1 銅綠假單胞菌 16S rRNA 鑒定34-35
  • 2.3.2 銅綠假單胞菌噬菌體的分離純化及滴度測定35-37
  • 2.3.3 噬菌體透射電子顯微鏡觀察37-39
  • 2.3.4 噬菌體核酸提取及限制性內(nèi)切酶分析39-40
  • 2.3.5 裂解率測定40-41
  • 2.3.6 最佳感染復(fù)數(shù)(MOI)的測定41-42
  • 2.3.7 一步生長曲線的繪制42
  • 2.3.8 吸收率測定42-43
  • 2.3.9 噬菌體蛋白 SDS-PAGE 分析43-44
  • 2.3.10 噬菌體 PH 及溫度穩(wěn)定性測定44-46
  • 2.2.11 噬菌體全基因組測序初步分析46-47
  • 2.4 討論47-51
  • 第三章 結(jié)論51-52
  • 參考文獻52-59
  • 作者簡介在校期間獲得的科研成果59-61
  • 致謝61

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條

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  本文關(guān)鍵詞:銅綠假單胞菌毒性噬菌體φPA-HF17的分離鑒定及生物學特性的分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:326628

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