實驗用貓SNP位點和微衛(wèi)星標(biāo)記遺傳檢測方法的建立及初步應(yīng)用
發(fā)布時間:2021-06-09 19:01
雖然早在19世紀(jì)末貓就作為實驗用動物用于生物醫(yī)學(xué)研究,制藥業(yè)等研究領(lǐng)域,但關(guān)于檢測實驗用貓遺傳質(zhì)量的研究鮮有報道。建立相應(yīng)的遺傳檢測方法,制定相關(guān)的地方標(biāo)準(zhǔn),對于確保實驗用貓的質(zhì)量和實驗數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性至關(guān)重要。但我國目前尚未出臺檢測實驗用貓遺傳質(zhì)量的國家標(biāo)準(zhǔn),各地方也沒有成熟的實驗用貓遺傳質(zhì)量地方標(biāo)準(zhǔn)。隨著國內(nèi)大專院校,藥品生產(chǎn)企業(yè)以及檢定機(jī)構(gòu)對實驗用貓使用量的增加,建立符合我國目前研究水平和應(yīng)用要求的實驗用貓遺傳質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)和遺傳質(zhì)量檢測方法迫在眉睫。本研究建立了兩種用于實驗用貓的遺傳質(zhì)量檢測方法:第一種是建立實驗用貓STR遺傳質(zhì)量檢測方法。通過檢索GeneBank數(shù)據(jù)庫以及參考相關(guān)文獻(xiàn),備選了74個微衛(wèi)星位點。以瓊脂糖凝膠電泳和STR掃描結(jié)果為依據(jù)逐步篩選擴(kuò)增效果好且多態(tài)性高的微衛(wèi)星位點,共得到41個微衛(wèi)星位點。進(jìn)而考慮到這些位點在染色體的分布情況,在貓的常染色體(除了A1、B1染色體)上適當(dāng)選擇了12個多態(tài)性位點。最終篩選出31個STR位點用于檢測,并初步分析了三種實驗用貓群體(暹羅貓、家貓、虎皮貓)的遺傳結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明,暹羅貓、家貓和虎皮貓的平均雜合度分別為0.6...
【文章來源】:中國食品藥品檢定研究院北京市
【文章頁數(shù)】:105 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
FCA221位點PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳圖譜
篩選時5個SNP位點的HRM分型結(jié)果
在rs784562870的直接測序結(jié)果以及BLAST/BLAT分析比對情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]用45個SNP位點組合對國家嚙齒類實驗動物種子中心3個封閉群小鼠群體的遺傳狀況分析[J]. 李銀銀,王洪,李長龍,郭萌,魏杰,張鈺,黃韌,陳振文,杜小燕. 實驗動物科學(xué). 2018(01)
[2]豚鼠個體及品系間多態(tài)性微衛(wèi)星位點篩選[J]. 衛(wèi)振,洪勝輝,劉迪文. 中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2017(11)
[3]實驗用貓研究現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢探討[J]. 方遠(yuǎn)書,何忠平,裘穎兒. 山東畜牧獸醫(yī). 2017(10)
[4]巴馬小型豬和貴州小型豬封閉群的遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 王思珍,郭闖,郭猛,賀寬軍,曹穎霞,杜小燕,陳振文. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2017(07)
[5]貓實驗動物標(biāo)準(zhǔn)化的研究進(jìn)展及探討[J]. 劉明慧,袁寶,陳健,高巍,胡進(jìn)平,俞先峰,劉殿峰,任文陟. 吉林畜牧獸醫(yī). 2015(02)
[6]非損傷采樣提取DNA技術(shù)在貓科動物調(diào)查中的應(yīng)用[J]. 周許偉,宋景良,王福有,夏文軍,烏力吉,張震寰,鮑偉東. 獸類學(xué)報. 2015(01)
[7]三種血液基因組DNA提取方法的比較研究[J]. 李芳芳,魏杰,王洪,岳秉飛. 實驗動物科學(xué). 2014(05)
[8]房山封閉群小型豬微衛(wèi)星位點的測定[J]. 魏杰,王吉星,王洪,李芳芳,岳秉飛. 中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2013(11)
[9]應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)DNA記對三個封閉群兔遺傳分析[J]. 申幸嬌,岳秉飛. 中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2013(09)
[10]云南紅骨圭山山羊微衛(wèi)星DNA位點遺傳多樣性分析[J]. 樊月圓,余淑青,曹振輝,榮華,廖國周,谷大海,林秋葉,殷紅,徐志強,史憲偉,張曦,高士爭,葛長榮,賈俊靜. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2013(03)
碩士論文
[1]滇西亞種樹鼩微衛(wèi)星篩選及群體多態(tài)性分析[D]. 張媛.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
[2]貓微衛(wèi)星DNA標(biāo)記遺傳檢測方法的建立及對虎皮貓群體遺傳結(jié)構(gòu)的分析[D]. 衣帥.吉林大學(xué) 2013
[3]大鼠SNP遺傳檢測技術(shù)研究[D]. 王淑菁.中國藥品生物制品檢定所 2011
本文編號:3221141
【文章來源】:中國食品藥品檢定研究院北京市
【文章頁數(shù)】:105 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
FCA221位點PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳圖譜
篩選時5個SNP位點的HRM分型結(jié)果
在rs784562870的直接測序結(jié)果以及BLAST/BLAT分析比對情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]用45個SNP位點組合對國家嚙齒類實驗動物種子中心3個封閉群小鼠群體的遺傳狀況分析[J]. 李銀銀,王洪,李長龍,郭萌,魏杰,張鈺,黃韌,陳振文,杜小燕. 實驗動物科學(xué). 2018(01)
[2]豚鼠個體及品系間多態(tài)性微衛(wèi)星位點篩選[J]. 衛(wèi)振,洪勝輝,劉迪文. 中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2017(11)
[3]實驗用貓研究現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢探討[J]. 方遠(yuǎn)書,何忠平,裘穎兒. 山東畜牧獸醫(yī). 2017(10)
[4]巴馬小型豬和貴州小型豬封閉群的遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 王思珍,郭闖,郭猛,賀寬軍,曹穎霞,杜小燕,陳振文. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2017(07)
[5]貓實驗動物標(biāo)準(zhǔn)化的研究進(jìn)展及探討[J]. 劉明慧,袁寶,陳健,高巍,胡進(jìn)平,俞先峰,劉殿峰,任文陟. 吉林畜牧獸醫(yī). 2015(02)
[6]非損傷采樣提取DNA技術(shù)在貓科動物調(diào)查中的應(yīng)用[J]. 周許偉,宋景良,王福有,夏文軍,烏力吉,張震寰,鮑偉東. 獸類學(xué)報. 2015(01)
[7]三種血液基因組DNA提取方法的比較研究[J]. 李芳芳,魏杰,王洪,岳秉飛. 實驗動物科學(xué). 2014(05)
[8]房山封閉群小型豬微衛(wèi)星位點的測定[J]. 魏杰,王吉星,王洪,李芳芳,岳秉飛. 中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2013(11)
[9]應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)DNA記對三個封閉群兔遺傳分析[J]. 申幸嬌,岳秉飛. 中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2013(09)
[10]云南紅骨圭山山羊微衛(wèi)星DNA位點遺傳多樣性分析[J]. 樊月圓,余淑青,曹振輝,榮華,廖國周,谷大海,林秋葉,殷紅,徐志強,史憲偉,張曦,高士爭,葛長榮,賈俊靜. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)). 2013(03)
碩士論文
[1]滇西亞種樹鼩微衛(wèi)星篩選及群體多態(tài)性分析[D]. 張媛.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
[2]貓微衛(wèi)星DNA標(biāo)記遺傳檢測方法的建立及對虎皮貓群體遺傳結(jié)構(gòu)的分析[D]. 衣帥.吉林大學(xué) 2013
[3]大鼠SNP遺傳檢測技術(shù)研究[D]. 王淑菁.中國藥品生物制品檢定所 2011
本文編號:3221141
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