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申克孢子絲菌4Hppd基因結(jié)構(gòu)功能的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-05-12 04:10
  目的:初步預(yù)測(cè)及分析申克孢子絲菌(Sporothrix schenckii,Ss.)對(duì)羥苯基丙酮酸雙加氧酶基因(4Hppd)編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能特征。方法:應(yīng)用生物信息學(xué)在線工具預(yù)測(cè)分析Ss. 4Hppd編碼蛋白的理化性質(zhì)及功能特征。結(jié)果:Ss. 4Hppd基因編碼蛋白含對(duì)羥苯基丙酮酸雙加氧酶保守域,由477個(gè)氨基酸構(gòu)成,理論分子量為52. 0 k D,等電點(diǎn)為5. 98,半衰期較長,該蛋白為非分泌蛋白,定位于線粒體中。其二級(jí)結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲及α-螺旋為主,另外還存在乙二醛酶功能域及豐富的磷酸化位點(diǎn),與其他致病真菌同源蛋白有較高的相似度。結(jié)論:預(yù)測(cè)Ss. 4HppD位于線粒體中,具有乙二醛酶功能域結(jié)構(gòu)功能特點(diǎn)及豐富修飾位點(diǎn),可為其表達(dá)、晶體結(jié)構(gòu)分析及小分子抑制劑開發(fā)提供參考。 

【文章來源】:皮膚性病診療學(xué)雜志. 2020,27(02)

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
1對(duì)象與方法
    1.1對(duì)象
    1.2方法
        1.2.1 Ss.4Hppd基因鑒定
        1.2.2 Ss.4HppD蛋白序列分析
2結(jié)果
    2.1 Ss.4Hppd基因鑒定
    2.2 Ss.4HppD的理化性質(zhì)
    2.3 Ss.4HppD的二級(jí)結(jié)構(gòu)及三級(jí)結(jié)構(gòu)
    2.4 Ss.4HppD的信號(hào)肽、跨膜區(qū)域、亞細(xì)胞定位
    2.5 Ss.4HppD的功能域及修飾位點(diǎn)
    2.6多重比對(duì)
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本文編號(hào):3182703

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