中緬邊境地區(qū)惡性瘧原蟲裂殖子表面蛋白2限制性酶切分析
發(fā)布時間:2021-04-06 18:37
目的運用PCR-RFLP技術(shù)對中緬邊境地區(qū)惡性瘧原蟲進(jìn)行MSP-2多態(tài)性分析,鑒定其等位基因類型。方法對采自云南省中緬邊境地區(qū)的勐臘、騰沖和盈江,及緬甸的那威、南卡江、芒東和拉咱7個縣(市)鏡檢為單一感染惡性瘧的全血或濾紙血樣,采用基于18SrRNA基因巢式PCR進(jìn)行瘧原蟲種類鑒定,并對鑒定為惡性瘧或混合感染血樣進(jìn)行PCR-RFLP檢測。結(jié)果鏡檢為惡性瘧的256份血樣,經(jīng)18SrRNA基因巢式PCR鑒定為惡性瘧226份,間日瘧14份,混合感染16份。PCR-RFLP檢測惡性瘧血樣共215份,204份含有MSP-2等位基因,占94.9%。其中41份屬于單一FC27家族,占20.1%;30份屬于單一3D7家族,占14.7%;133份屬于FC27和3D7家族混合感染,占65.2%。其余11份未檢出MSP-2等位基因。FC27、3D7和FC27+3D7等位基因在9~29歲患者或2 500~100 000個瘧原蟲/μl血中檢出率較高,分別為58.6%(102/174)、57.7%(94/163)、55.64%(74/133)和59.2%(103/174)、58.3%(95/163)、60.15%...
【文章來源】:中國病原生物學(xué)雜志. 2020,15(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
惡性瘧患者血樣采集點示意圖
非洲和東南亞瘧疾流行區(qū)惡性瘧原蟲株MSP-2多態(tài)性研究結(jié)果顯示,惡性瘧MSP-2基因的中間變異區(qū)經(jīng)HinfⅠ限制性內(nèi)切酶酶切后在FC27家族中產(chǎn)生115bp和137bp兩條特異的酶切片段,且部分等位基因酶切后除上述兩條酶切片段外還能產(chǎn)生1條162bp以及不同拷貝數(shù)的96bp酶切片段;3D7家族中只能產(chǎn)生70bp和108bp兩條特異的酶切片段[8-10]。因此HinfⅠ酶切分析是RFLP分型技術(shù)中的第一步,基本能夠鑒定樣品中所含的MSP-2等位基因類型,而對一些酶切片段復(fù)雜的樣品可再進(jìn)行AluⅠ和ScrFⅠ等限制性內(nèi)切酶酶切分析[11],從而提高M(jìn)SP-2等位基因分型的準(zhǔn)確性。為確保分型的準(zhǔn)確性,本研究對所有樣品均做HinfⅠ、AluⅠ、ScrFⅠ、DdeⅠ、RsaⅠ和TaqⅠ限制性內(nèi)切酶酶切與分析。2.5 統(tǒng)計學(xué)分析
MSP-2的FC27和3D7等位基因在19~29歲患者中的分布分別占32.76%(57/174)和31.29%(51/163),在9~19歲患者分別占25.68%(45/174)和26.38%(43/163);FC27+3D7等位基因在19~29和9~19歲患者分別占33.08%(44/133)和25.56%(34/133)。各基因型在各采樣點和患者年齡段中的分布如圖4和圖5所示。MSP-2的FC27和3D7等位基因分布按照患者年齡分組,其等位基因分布頻率在中國和緬甸兩個大采樣點之間差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=10.774,P>0.05)和(χ2=9.427,P>0.05)。圖4 中緬邊境地區(qū)惡性瘧原蟲MSP-2的FC27基因型年齡分布
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]境外輸入性惡性瘧原蟲藥物抗性基因多態(tài)性分析[J]. 楊成運,李素華,張雅蘭,周瑞敏,劉穎,錢丹,趙玉玲,許汴利,張紅衛(wèi). 中國病原生物學(xué)雜志. 2018(09)
[2]赤道幾內(nèi)亞比奧科島惡性瘧原蟲MSP-1和MSP-2基因多態(tài)性研究[J]. 陳江濤,李健,潘雪峰,Urbano Monsuy Eyi,Rocio Apicante Matesa,Maximo Miko Ondo Obono,Carlos Sala Ehapo,查廣才,黃廣,黃芝秀,林敏. 中國當(dāng)代醫(yī)藥. 2017(13)
[3]2015年中緬邊境盈江縣瘧疾疫點的調(diào)查與分析[J]. 張蒼林,郭祥瑞,楊銳,楊亞明,楊中華,鄭宇婷,吳超,李仕剛,藺應(yīng)學(xué),余國翠,閆潤仙,段凱霞,周子悠,田鵬,周耀武,周紅寧. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2016(05)
[4]云南省邊境地區(qū)瘧原蟲18S rRNA基因種類鑒定與序列分析[J]. 張蒼林,周紅寧,聶仁華,劉慧,王劍,李春富,楊亞明. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2016(03)
[5]Nest-PCR和PCR-RFLP在惡性瘧原蟲地理株基因分型及多態(tài)性研究中的應(yīng)用[J]. 張青鋒,胡晶瑩,楊月欣,潘衛(wèi)慶. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2008(02)
[6]海南省惡性瘧原蟲MSP1和MSP2等位基因分型研究[J]. 江鋼鋒,宋杰,陳沛泉,王善青. 華南預(yù)防醫(yī)學(xué). 2003(02)
[7]套式PCR用于海南省惡性瘧原蟲裂殖子表面蛋白1和2的分型研究[J]. 宋杰,江鋼鋒,陳沛泉. 熱帶醫(yī)學(xué)雜志. 2002(03)
[8]云南和海南兩省不同地區(qū)惡性瘧原蟲裂殖子表面蛋白2基因型的研究[J]. 諸欣平,周蕾,張新梅,楊靜,楊雅平. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2001(01)
本文編號:3121923
【文章來源】:中國病原生物學(xué)雜志. 2020,15(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
惡性瘧患者血樣采集點示意圖
非洲和東南亞瘧疾流行區(qū)惡性瘧原蟲株MSP-2多態(tài)性研究結(jié)果顯示,惡性瘧MSP-2基因的中間變異區(qū)經(jīng)HinfⅠ限制性內(nèi)切酶酶切后在FC27家族中產(chǎn)生115bp和137bp兩條特異的酶切片段,且部分等位基因酶切后除上述兩條酶切片段外還能產(chǎn)生1條162bp以及不同拷貝數(shù)的96bp酶切片段;3D7家族中只能產(chǎn)生70bp和108bp兩條特異的酶切片段[8-10]。因此HinfⅠ酶切分析是RFLP分型技術(shù)中的第一步,基本能夠鑒定樣品中所含的MSP-2等位基因類型,而對一些酶切片段復(fù)雜的樣品可再進(jìn)行AluⅠ和ScrFⅠ等限制性內(nèi)切酶酶切分析[11],從而提高M(jìn)SP-2等位基因分型的準(zhǔn)確性。為確保分型的準(zhǔn)確性,本研究對所有樣品均做HinfⅠ、AluⅠ、ScrFⅠ、DdeⅠ、RsaⅠ和TaqⅠ限制性內(nèi)切酶酶切與分析。2.5 統(tǒng)計學(xué)分析
MSP-2的FC27和3D7等位基因在19~29歲患者中的分布分別占32.76%(57/174)和31.29%(51/163),在9~19歲患者分別占25.68%(45/174)和26.38%(43/163);FC27+3D7等位基因在19~29和9~19歲患者分別占33.08%(44/133)和25.56%(34/133)。各基因型在各采樣點和患者年齡段中的分布如圖4和圖5所示。MSP-2的FC27和3D7等位基因分布按照患者年齡分組,其等位基因分布頻率在中國和緬甸兩個大采樣點之間差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=10.774,P>0.05)和(χ2=9.427,P>0.05)。圖4 中緬邊境地區(qū)惡性瘧原蟲MSP-2的FC27基因型年齡分布
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]境外輸入性惡性瘧原蟲藥物抗性基因多態(tài)性分析[J]. 楊成運,李素華,張雅蘭,周瑞敏,劉穎,錢丹,趙玉玲,許汴利,張紅衛(wèi). 中國病原生物學(xué)雜志. 2018(09)
[2]赤道幾內(nèi)亞比奧科島惡性瘧原蟲MSP-1和MSP-2基因多態(tài)性研究[J]. 陳江濤,李健,潘雪峰,Urbano Monsuy Eyi,Rocio Apicante Matesa,Maximo Miko Ondo Obono,Carlos Sala Ehapo,查廣才,黃廣,黃芝秀,林敏. 中國當(dāng)代醫(yī)藥. 2017(13)
[3]2015年中緬邊境盈江縣瘧疾疫點的調(diào)查與分析[J]. 張蒼林,郭祥瑞,楊銳,楊亞明,楊中華,鄭宇婷,吳超,李仕剛,藺應(yīng)學(xué),余國翠,閆潤仙,段凱霞,周子悠,田鵬,周耀武,周紅寧. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2016(05)
[4]云南省邊境地區(qū)瘧原蟲18S rRNA基因種類鑒定與序列分析[J]. 張蒼林,周紅寧,聶仁華,劉慧,王劍,李春富,楊亞明. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2016(03)
[5]Nest-PCR和PCR-RFLP在惡性瘧原蟲地理株基因分型及多態(tài)性研究中的應(yīng)用[J]. 張青鋒,胡晶瑩,楊月欣,潘衛(wèi)慶. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2008(02)
[6]海南省惡性瘧原蟲MSP1和MSP2等位基因分型研究[J]. 江鋼鋒,宋杰,陳沛泉,王善青. 華南預(yù)防醫(yī)學(xué). 2003(02)
[7]套式PCR用于海南省惡性瘧原蟲裂殖子表面蛋白1和2的分型研究[J]. 宋杰,江鋼鋒,陳沛泉. 熱帶醫(yī)學(xué)雜志. 2002(03)
[8]云南和海南兩省不同地區(qū)惡性瘧原蟲裂殖子表面蛋白2基因型的研究[J]. 諸欣平,周蕾,張新梅,楊靜,楊雅平. 中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2001(01)
本文編號:3121923
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