本論文選用于2018年1月至2018年4月采自徐州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科患者體內(nèi)的大腸埃希菌菌株作為研究樣本。提取對(duì)碳青霉烯類藥物耐藥的大腸埃希菌和對(duì)碳青霉烯類藥物敏感的大腸埃希菌中的多肽和代謝物,每組實(shí)驗(yàn)設(shè)置3個(gè)生物學(xué)重復(fù),采用靜電場(chǎng)軌道阱質(zhì)譜（Orbitrap MS）對(duì)提取的多肽和代謝物樣本分別進(jìn)行分析,引入模式識(shí)別方法從復(fù)雜的分析結(jié)果中實(shí)現(xiàn)對(duì)耐藥菌株與敏感菌株的快速,準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)。根據(jù)單變量統(tǒng)計(jì)分析找出兩類菌株在統(tǒng)計(jì)學(xué)上有顯著性差異的化合物,為研究大腸埃希菌對(duì)碳青霉烯類藥物的耐藥機(jī)制及藥物的合成提供參考。實(shí)現(xiàn)聚類分析,主成分分析（PCA）,偏最小二乘法判別分析（PLS-DA）和正交偏最小二乘法判別分析（OPLS-DA）的R語(yǔ)言程序包分別是"cluster"包,"psych"包和"ropls"包。單變量統(tǒng)計(jì)分析利用了t檢驗(yàn)計(jì)算每一個(gè)化合物的P值,進(jìn)行顯著差異化物篩選,同時(shí)利用倍數(shù)變化（FC）分析計(jì)算每一個(gè)化合物的FC值,判斷該化合物在耐藥菌株與敏感菌株中的含量變化。多肽樣本的靜電場(chǎng)軌道阱質(zhì)譜數(shù)據(jù)的模式識(shí)別分析結(jié)果表明:基于最遠(yuǎn)距離法的聚類分析結(jié)果能將兩類大腸埃希菌很好的區(qū)分開,且基于... 

【文章來源】：中國(guó)礦業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：83 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

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圖 4-13 多肽樣本 OPLS-DA 的得分圖Figure 4-13 Score of OPLS-DA for ESI positive mode spectra of peptide samples.Scores (OPLS-DA)2t-10 -5 0 5 10t1-155-5510R1-1R2-2R3-1R4-1R4-3S2-2S4-2S1-1S1-2S2-1S3-3S4-1S4-3R1-3RR21-1-2R2-3R3-3R3-3R4-2S1-3S2-3S3-1S3-2

圖 5-14 代謝物樣本 OPLS-DA 的載荷圖Figure 5-14 Loading plots of OPLS-DA for ESI positive mode spectra of metabolite samples表 5-3 代謝物樣本中 OPLS-DA 篩選出的差異化合物Table 5-3 Differential Compounds identified by OPLS-DA in metabolite samples序號(hào) m/z 序號(hào) m/z 序號(hào) m/z1 437.1 44 176.9 87 207.02 211.1 45 111.0 88 160.93 221.0 46 132.0 89 143.94 218.9 47 168.9 90 250.95 223.0 48 186.9 91 124.96 119.0 49 205.0 92 206.97 220.9 50 203.9 93 190.98 438.1 51 228.0 94 223.99 237.9 52 138.9 95 360.910 149.0 53 239.0 96 109.511 243.0 54 221.9 97 103.912 131.9 55 185.9 98 105.913 231.9 56 318.2 99 228.914 181.0 57 353.2 100 219.015 182.9 58 253.1 101 156.016 130.5 59 199.9 102 278.917 227.9 60 252.1 103 280.9

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3119671