本論文選用于2018年1月至2018年4月采自徐州醫(yī)科大學附屬醫(yī)院檢驗科患者體內(nèi)的大腸埃希菌菌株作為研究樣本。提取對碳青霉烯類藥物耐藥的大腸埃希菌和對碳青霉烯類藥物敏感的大腸埃希菌中的多肽和代謝物,每組實驗設置3個生物學重復,采用靜電場軌道阱質(zhì)譜（Orbitrap MS）對提取的多肽和代謝物樣本分別進行分析,引入模式識別方法從復雜的分析結果中實現(xiàn)對耐藥菌株與敏感菌株的快速,準確的預測。根據(jù)單變量統(tǒng)計分析找出兩類菌株在統(tǒng)計學上有顯著性差異的化合物,為研究大腸埃希菌對碳青霉烯類藥物的耐藥機制及藥物的合成提供參考。實現(xiàn)聚類分析,主成分分析（PCA）,偏最小二乘法判別分析（PLS-DA）和正交偏最小二乘法判別分析（OPLS-DA）的R語言程序包分別是"cluster"包,"psych"包和"ropls"包。單變量統(tǒng)計分析利用了t檢驗計算每一個化合物的P值,進行顯著差異化物篩選,同時利用倍數(shù)變化（FC）分析計算每一個化合物的FC值,判斷該化合物在耐藥菌株與敏感菌株中的含量變化。多肽樣本的靜電場軌道阱質(zhì)譜數(shù)據(jù)的模式識別分析結果表明:基于最遠距離法的聚類分析結果能將兩類大腸埃希菌很好的區(qū)分開,且基于... 

【文章來源】：中國礦業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

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圖 4-13 多肽樣本 OPLS-DA 的得分圖Figure 4-13 Score of OPLS-DA for ESI positive mode spectra of peptide samples.Scores (OPLS-DA)2t-10 -5 0 5 10t1-155-5510R1-1R2-2R3-1R4-1R4-3S2-2S4-2S1-1S1-2S2-1S3-3S4-1S4-3R1-3RR21-1-2R2-3R3-3R3-3R4-2S1-3S2-3S3-1S3-2

圖 5-14 代謝物樣本 OPLS-DA 的載荷圖Figure 5-14 Loading plots of OPLS-DA for ESI positive mode spectra of metabolite samples表 5-3 代謝物樣本中 OPLS-DA 篩選出的差異化合物Table 5-3 Differential Compounds identified by OPLS-DA in metabolite samples序號 m/z 序號 m/z 序號 m/z1 437.1 44 176.9 87 207.02 211.1 45 111.0 88 160.93 221.0 46 132.0 89 143.94 218.9 47 168.9 90 250.95 223.0 48 186.9 91 124.96 119.0 49 205.0 92 206.97 220.9 50 203.9 93 190.98 438.1 51 228.0 94 223.99 237.9 52 138.9 95 360.910 149.0 53 239.0 96 109.511 243.0 54 221.9 97 103.912 131.9 55 185.9 98 105.913 231.9 56 318.2 99 228.914 181.0 57 353.2 100 219.015 182.9 58 253.1 101 156.016 130.5 59 199.9 102 278.917 227.9 60 252.1 103 280.9

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本文編號：3119671