云南省劍川縣鼠疫疫源地分離菌株基因組多態(tài)性
發(fā)布時(shí)間:2021-03-12 10:26
目的闡明云南劍川野鼠疫源地鼠疫菌種群的演化及其與云南省其他疫源地菌株之間的遺傳進(jìn)化關(guān)系。方法按不同時(shí)間、不同疫點(diǎn)、不同分離源,隨機(jī)選取24株劍川分離鼠疫菌進(jìn)行研究;采用差異區(qū)段(DFR)、規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù)序列(CRISPRs)及多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分析(MLVA)進(jìn)行基因組多態(tài)性分析;以DFR+CRISPRs聚類分析劃分簇,再以MLVA26對(duì)簇進(jìn)行聚類分析。結(jié)果 24株劍川菌株中,20株菌聚為一個(gè)簇(劍川野鼠鼠疫簇);2017年疫情分離3株菌位于麗江野鼠鼠疫簇,與麗江菌株(2017LZ)存在2個(gè)位點(diǎn)的差異(N2577,M23);剩余1株為一個(gè)獨(dú)立株;50年代菌株與其鄰近的80年代菌株間位點(diǎn)差異未超過(guò)3。結(jié)論劍川原野鼠疫源地的發(fā)現(xiàn)時(shí)間可往前推至上世紀(jì)50年代,同時(shí)疫情還波及過(guò)家鼠和人群;劍川縣境內(nèi)存在2種類型的野鼠疫源地,其鼠疫防控具有復(fù)雜性,應(yīng)繼續(xù)加強(qiáng)鼠間鼠疫的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)。
【文章來(lái)源】:中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2020,36(01)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【部分圖文】:
50株實(shí)驗(yàn)鼠疫菌及2株0.PE菌株基于DFR和CRISPRs位點(diǎn)生成的MST
20株劍川野鼠鼠疫簇菌株基于MLVA26的MST
劍川2017年分離菌株與麗江野鼠鼠疫簇菌株基于MLVA26個(gè)位點(diǎn)生成的MST
本文編號(hào):3078150
【文章來(lái)源】:中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2020,36(01)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:5 頁(yè)
【部分圖文】:
50株實(shí)驗(yàn)鼠疫菌及2株0.PE菌株基于DFR和CRISPRs位點(diǎn)生成的MST
20株劍川野鼠鼠疫簇菌株基于MLVA26的MST
劍川2017年分離菌株與麗江野鼠鼠疫簇菌株基于MLVA26個(gè)位點(diǎn)生成的MST
本文編號(hào):3078150
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