目的利用生物信息學(xué)方法對羊布魯氏菌Omp25蛋白進行分析,預(yù)測其T細胞以及B細胞的優(yōu)勢抗原表位。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取羊布魯氏菌的Omp25蛋白的氨基酸序列。應(yīng)用ProtParam在線軟件分析Omp25蛋白的理化性質(zhì),應(yīng)用SOMPA在線軟件分析Omp25蛋白二級結(jié)構(gòu),應(yīng)用Phyre2及SWISS-MODEL在線軟件構(gòu)建并分析Omp25蛋白三級結(jié)構(gòu),應(yīng)用ABCpred和BepiPred等在線軟件預(yù)測Omp25蛋白的B細胞抗原表位,應(yīng)用SYFPEITHI和IEDB在線軟件預(yù)測Omp25蛋白的T細胞抗原表位。結(jié)果 Omp25蛋白含有23個強堿性氨基酸,含有21個強酸性氨基酸,歸類為親水性穩(wěn)定蛋白,Omp25蛋白的二級結(jié)構(gòu)中α-螺旋占24.88%,β-折疊占25.35%,β-轉(zhuǎn)角占2.82%,無規(guī)則卷曲占46.95%。聯(lián)合不同軟件的預(yù)測結(jié)果分析后,最終獲得1段CD4⁺T細胞優(yōu)勢抗原表位、3段CD8⁺T細胞優(yōu)勢抗原表位以及3段B細胞優(yōu)勢抗原表位。結(jié)論通過生物學(xué)信息的方法較為全面地預(yù)測了羊布魯氏菌Omp25蛋白的優(yōu)勢T細胞以及B細胞抗原表位,為進一步... 

【文章來源】：新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2020,43(04)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

SOPMA在線軟件分析Omp25蛋白的二級結(jié)構(gòu)

SWISS-Model模型

Phyre2模型

【參考文獻】：
期刊論文
[1]羊種布魯氏菌OMP16蛋白結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)分析[J]. 李智偉,張峰波,盧佩佩,賈斌,周延,劉小雙,岳曉媚,丁劍冰.  中國人獸共患病學(xué)報. 2019(01)
[2]布魯氏菌病關(guān)節(jié)炎干預(yù)研究現(xiàn)狀及展望[J]. 侯尚妍,張?zhí)?黃琴,彭巧君.  護理研究. 2018(17)
[3]布魯氏菌Omp10蛋白抗原表位的生物信息學(xué)分析[J]. 楊妍,朱玥潔,胡金偉,張峰波,甫拉提·熱西提,張春桃,賈斌,龐盼,丁劍冰.  新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2016(10)
[4]羊布魯氏菌omp25基因原核表達載體的構(gòu)建與鑒定[J]. 石艷春,韓堃,鄭源強,吳巖,畢力夫.  內(nèi)蒙古醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2012(02)
[5]布魯氏菌蛋白免疫原性研究進展[J]. 楊星雅,崔步云.  中國人獸共患病學(xué)報. 2012(02)
[6]布魯氏菌病檢測、防控措施與疫苗研究進展[J]. 鄭源強,吳巖,畢力夫.  內(nèi)蒙古醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2011(01)
[7]羊布魯氏菌外膜蛋白質(zhì)的組成鑒定[J]. 曲勍,王玉飛,徐杰,鐘志軍,喬鳳,杜昕穎,汪舟佳,黃留玉,于雅琴,陳澤良.  吉林大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2009(05)



本文編號：3077131