目的分析江蘇省25株新型冠狀病毒（2019-nCoV）全基因組序列,研究其進化特征。方法使用高通量測序技術(shù)對確診病例咽拭子樣本進行測序,使用CLC Genomics Workbench 12.0分析單核苷酸多態(tài)性（SNP）,MEGA5.1分析病毒進化特征。結(jié)果 25株病毒共檢測到52處堿基突變,進化分析顯示25株病毒分成2個進化分支,分支1含有8 782和28 144位置CT連鎖SNPs,而分支2此2位置突變?yōu)門C,即8 782 （ORF1ab: C8517T,同義突變）和28 144（ORF8: T251C, L84S）。分支2中5株病毒還含有24 034（S:C2 472T,同義突變）、26 729（M:T207C,同義突變）和28 077（ORF8:G184C,V62 L）連鎖SNPs,聚成亞組A,不同分支/亞組在人群分布及與疾病關(guān)系無顯著差異。結(jié)論 2019-nCoV出現(xiàn)了SNPs,其對病毒傳播力、致病性等影響有待進一步研究。 

【文章來源】：中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志. 2020,34(04)

【文章頁數(shù)】：5 頁


本文編號：3044794