目的通過(guò)生物信息學(xué)在線程序及軟件分析弓形蟲(chóng)動(dòng)力蛋白輕鏈8a（TgDLC8a）,預(yù)測(cè)其結(jié)構(gòu)、免疫原性及抗原性。方法利用生物信息學(xué)在線軟件ProtParam、SOSUI、ProtScale、TMHMM Server v.2.0、SignalP-5.0、TargetP1.1、Coils、SOPMA、NetPhos 3.1Server、SWISS-MODEL、SYFPEITHI及DNAMAN軟件、DNAStar軟件等分析預(yù)測(cè)TgDLC8a蛋白的理化性質(zhì)、親疏水性、跨膜結(jié)構(gòu)域、信號(hào)肽、亞細(xì)胞定位、可溶性、柔韌性、表面可及性、二級(jí)結(jié)構(gòu)、蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)、三級(jí)結(jié)構(gòu)及B細(xì)胞和T細(xì)胞抗原表位。結(jié)果 TgDLC8a蛋白含有138個(gè)氨基酸,分子式為C723H1128N192O195S11,相對(duì)分子質(zhì)量為15.928 74×10³,理論等電點(diǎn)為8.69,半衰期為30h,不穩(wěn)定系數(shù)為37.09,脂溶性指數(shù)為88.33,總平均親水性系數(shù)為0.025,屬于疏水性蛋白;該蛋白有跨膜結(jié)構(gòu)域,無(wú)信號(hào)肽切割位點(diǎn),亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)可能是分泌蛋白;二級(jí)結(jié)構(gòu)中α螺旋和β折疊分別占41.30%和23.91%,... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2020,15(04)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

TgDLC8a蛋白的親、疏水性

經(jīng)TargetP 1.1程序分析，TgDLC8a蛋白包含線粒體靶向肽（mTP）序列，定位于線粒體的可能性為0.114，包含信號(hào)肽（SP），為分泌蛋白的可能性為0.843，以其他形式存在的可能性為0.068，即該蛋白屬分泌型蛋白的可能性大（圖4）。圖3 TgDLC8a蛋白的Coils預(yù)測(cè)結(jié)果

TgDLC8a蛋白的Coils預(yù)測(cè)結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]剛地弓形蟲(chóng)表面抗原糖蛋白相關(guān)序列SRS47D的生物信息學(xué)分析[J]. 劉輝,米榮升,賈海燕,張曉麗,王旭,黃燕,張燁華,韓先干,陳兆國(guó).  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2019(10)
[2]剛地弓形蟲(chóng)侵入相關(guān)蛋白疫苗研究進(jìn)展[J]. 郭珊珊,楊瑞,岳續(xù)鵬,廖業(yè),郭錦錦.  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2018(12)
[3]弓形蟲(chóng)ROP31基因克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 周劍,何深一,劉曉雨,王琳,呂剛,宋鵬霞,韓雅麗,郝珍,郭晶晶,朱曦,杜轄東,周瓊,彭倩.  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2018(05)
[4]剛地弓形蟲(chóng)ROP12蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 郭玲玲,王春苗,張進(jìn)順,張曉磊,賈曉暉,姜文靜,劉楠.  中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2015(06)
[5]抗原表位鑒定方法的研究進(jìn)展[J]. 文雪霞,陳化蘭,熊永忠,王秀榮.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2012(07)



本文編號(hào)：3020193