目的通過生物信息學在線程序及軟件分析弓形蟲動力蛋白輕鏈8a（TgDLC8a）,預測其結構、免疫原性及抗原性。方法利用生物信息學在線軟件ProtParam、SOSUI、ProtScale、TMHMM Server v.2.0、SignalP-5.0、TargetP1.1、Coils、SOPMA、NetPhos 3.1Server、SWISS-MODEL、SYFPEITHI及DNAMAN軟件、DNAStar軟件等分析預測TgDLC8a蛋白的理化性質、親疏水性、跨膜結構域、信號肽、亞細胞定位、可溶性、柔韌性、表面可及性、二級結構、蛋白翻譯后修飾位點、三級結構及B細胞和T細胞抗原表位。結果 TgDLC8a蛋白含有138個氨基酸,分子式為C723H1128N192O195S11,相對分子質量為15.928 74×10³,理論等電點為8.69,半衰期為30h,不穩(wěn)定系數(shù)為37.09,脂溶性指數(shù)為88.33,總平均親水性系數(shù)為0.025,屬于疏水性蛋白;該蛋白有跨膜結構域,無信號肽切割位點,亞細胞定位預測可能是分泌蛋白;二級結構中α螺旋和β折疊分別占41.30%和23.91%,... 

【文章來源】：中國病原生物學雜志. 2020,15(04)北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

TgDLC8a蛋白的親、疏水性

經(jīng)TargetP 1.1程序分析，TgDLC8a蛋白包含線粒體靶向肽（mTP）序列，定位于線粒體的可能性為0.114，包含信號肽（SP），為分泌蛋白的可能性為0.843，以其他形式存在的可能性為0.068，即該蛋白屬分泌型蛋白的可能性大（圖4）。圖3 TgDLC8a蛋白的Coils預測結果

TgDLC8a蛋白的Coils預測結果

【參考文獻】：
期刊論文
[1]剛地弓形蟲表面抗原糖蛋白相關序列SRS47D的生物信息學分析[J]. 劉輝,米榮升,賈海燕,張曉麗,王旭,黃燕,張燁華,韓先干,陳兆國.  中國病原生物學雜志. 2019(10)
[2]剛地弓形蟲侵入相關蛋白疫苗研究進展[J]. 郭珊珊,楊瑞,岳續(xù)鵬,廖業(yè),郭錦錦.  中國病原生物學雜志. 2018(12)
[3]弓形蟲ROP31基因克隆及生物信息學分析[J]. 周劍,何深一,劉曉雨,王琳,呂剛,宋鵬霞,韓雅麗,郝珍,郭晶晶,朱曦,杜轄東,周瓊,彭倩.  中國病原生物學雜志. 2018(05)
[4]剛地弓形蟲ROP12蛋白的生物信息學分析[J]. 郭玲玲,王春苗,張進順,張曉磊,賈曉暉,姜文靜,劉楠.  中國病原生物學雜志. 2015(06)
[5]抗原表位鑒定方法的研究進展[J]. 文雪霞,陳化蘭,熊永忠,王秀榮.  中國畜牧獸醫(yī). 2012(07)



本文編號：3020193