中國腦膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群莢膜基因簇分布特征
發(fā)布時間:2021-02-01 23:31
目的了解中國腦膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)高致病性ST-4821克隆群(CC4821)莢膜基因簇分布特征,為流行性腦脊髓膜炎的傳播擴散機制研究提供依據(jù)。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等軟件分析41株Nm全基因組序列,分析莢膜基因簇序列差異性、序列重組和基因排布等特征。結(jié)果莢膜基因簇ACE區(qū)差異較大,重組現(xiàn)象多集中在AC區(qū)。D和D′區(qū)有明顯差異序列,表明這2個區(qū)并非精準復制。莢膜基因簇存在基因反轉(zhuǎn)現(xiàn)象。結(jié)論 Nm高致病性CC4821莢膜基因簇呈現(xiàn)多態(tài)性、重組和基因反轉(zhuǎn)等多種莢膜調(diào)節(jié)機制,可能有助于該克隆群菌株的傳播擴散。
【文章來源】:疾病監(jiān)測. 2020,35(06)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
基因兩側(cè)標注斷點位置圖2腦膜炎奈瑟菌莢膜基因簇重組事件示意圖Figure2RecombinationofcapsularlocusofN.meningitidisstrainsD′區(qū)的cps
321565299.5注:a.參考菌株FAM18的2個重復區(qū)分別位于全基因組的56138~59432bp和74789~78083bp;b.重復區(qū)間序列差異分別為100.0%和62.7%;c.重復區(qū)間序列差異分別為30.8%、52.3%和31.5%注:黑色粗線表示參與重組的序列,黑色框代表參與重組的基因,基因兩側(cè)標注斷點位置圖2腦膜炎奈瑟菌莢膜基因簇重組事件示意圖Figure2RecombinationofcapsularlocusofN.meningitidisstrains注:黃色表示B區(qū)基因,藍色表示其他區(qū)基因,綠色表示cps側(cè)翼基因圖3腦膜炎奈瑟菌莢膜基因簇及附近基因排布Figure3GenearrayofthecpsandflankingsequenceofN.meningitidisstrains疾病監(jiān)測2020年6月30日第35卷第6期DISEASESURVEILLANCE,June30,2020,Vol.35,No.6511www.jbjc.orgDOI:10.3784/j.issn.1003–9961.2020.06.011
本文編號:3013627
【文章來源】:疾病監(jiān)測. 2020,35(06)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
基因兩側(cè)標注斷點位置圖2腦膜炎奈瑟菌莢膜基因簇重組事件示意圖Figure2RecombinationofcapsularlocusofN.meningitidisstrainsD′區(qū)的cps
321565299.5注:a.參考菌株FAM18的2個重復區(qū)分別位于全基因組的56138~59432bp和74789~78083bp;b.重復區(qū)間序列差異分別為100.0%和62.7%;c.重復區(qū)間序列差異分別為30.8%、52.3%和31.5%注:黑色粗線表示參與重組的序列,黑色框代表參與重組的基因,基因兩側(cè)標注斷點位置圖2腦膜炎奈瑟菌莢膜基因簇重組事件示意圖Figure2RecombinationofcapsularlocusofN.meningitidisstrains注:黃色表示B區(qū)基因,藍色表示其他區(qū)基因,綠色表示cps側(cè)翼基因圖3腦膜炎奈瑟菌莢膜基因簇及附近基因排布Figure3GenearrayofthecpsandflankingsequenceofN.meningitidisstrains疾病監(jiān)測2020年6月30日第35卷第6期DISEASESURVEILLANCE,June30,2020,Vol.35,No.6511www.jbjc.orgDOI:10.3784/j.issn.1003–9961.2020.06.011
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