登革病毒(DENV)基因組的5’和3’末端所蘊含的生物調(diào)控信息
發(fā)布時間:2021-01-19 20:20
登革病毒(Dengue virus,DENV)為正鏈RNA黃病毒,其基因組進入宿主細胞后經(jīng)歷了蛋白翻譯和正鏈-負(fù)鏈-正鏈的RNA復(fù)制過程,病毒基因組的5’末端區(qū)域和3’末端區(qū)域的RNA序列和結(jié)構(gòu)在上述過程中發(fā)揮不同的功能,病毒自身因此能更好地完成其生命活動。本文對DENV基因組末端區(qū)域各個序列和結(jié)構(gòu)的基本功能,帽子結(jié)構(gòu)依賴或非經(jīng)典的非帽非IRES依賴的蛋白翻譯,以環(huán)化為核心的5’–3’RNA長程相互作用的復(fù)制方式和3’UTR進化出的重復(fù)序列及串聯(lián)結(jié)構(gòu)在適應(yīng)不同宿主所發(fā)揮的功能進行綜述。
【文章來源】:病毒學(xué)報. 2020,36(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
DENV2基因組5"和3"末端區(qū)域二級結(jié)構(gòu)示意圖
DENV經(jīng)典翻譯和非經(jīng)典的非冒非IRES介導(dǎo)的翻譯轉(zhuǎn)化示意圖
雖然所有證據(jù)都表明DENV基因組的5′–3′互補序列是病毒有效復(fù)制所必需的,但堿基配對并非必須通過基因組環(huán)化實現(xiàn)。基因組多聯(lián)體理論認(rèn)為,DENV基因組可以利用5′–3′互補序列反向頭尾結(jié)合形成同源二聚體或多聚體。正鏈RNA病毒必須面對的問題是復(fù)制和翻譯過程競爭同一病毒基因組RNA,而5′–3′序列互補環(huán)化或多聯(lián)體化可以有效避免這種競爭,以利于復(fù)制和翻譯。在多聯(lián)體內(nèi)部由于5′–3′序列互補使一個病毒基因組RNA的5′UTR與另一個病毒基因組RNA的3′UTR在同一個方向結(jié)合,使結(jié)合到其中一個基因組5′非翻譯區(qū)SLA元件的NS5轉(zhuǎn)移到另一個基因組3′非翻譯區(qū)啟動負(fù)鏈RNA的合成。從多聯(lián)體5′末端開始的蛋白翻譯結(jié)束時,核糖體將使其模板RNA從多聯(lián)體解離,因而不會存在復(fù)制和翻譯競爭同一模板的問題[26](圖3b)。3.2 TL1 TL2 PK1 PK2序列在DB結(jié)構(gòu)影響DENV復(fù)制中的作用
本文編號:2987652
【文章來源】:病毒學(xué)報. 2020,36(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
DENV2基因組5"和3"末端區(qū)域二級結(jié)構(gòu)示意圖
DENV經(jīng)典翻譯和非經(jīng)典的非冒非IRES介導(dǎo)的翻譯轉(zhuǎn)化示意圖
雖然所有證據(jù)都表明DENV基因組的5′–3′互補序列是病毒有效復(fù)制所必需的,但堿基配對并非必須通過基因組環(huán)化實現(xiàn)。基因組多聯(lián)體理論認(rèn)為,DENV基因組可以利用5′–3′互補序列反向頭尾結(jié)合形成同源二聚體或多聚體。正鏈RNA病毒必須面對的問題是復(fù)制和翻譯過程競爭同一病毒基因組RNA,而5′–3′序列互補環(huán)化或多聯(lián)體化可以有效避免這種競爭,以利于復(fù)制和翻譯。在多聯(lián)體內(nèi)部由于5′–3′序列互補使一個病毒基因組RNA的5′UTR與另一個病毒基因組RNA的3′UTR在同一個方向結(jié)合,使結(jié)合到其中一個基因組5′非翻譯區(qū)SLA元件的NS5轉(zhuǎn)移到另一個基因組3′非翻譯區(qū)啟動負(fù)鏈RNA的合成。從多聯(lián)體5′末端開始的蛋白翻譯結(jié)束時,核糖體將使其模板RNA從多聯(lián)體解離,因而不會存在復(fù)制和翻譯競爭同一模板的問題[26](圖3b)。3.2 TL1 TL2 PK1 PK2序列在DB結(jié)構(gòu)影響DENV復(fù)制中的作用
本文編號:2987652
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