甲型流感病毒不同亞型混合感染分析及N9亞型流感病毒NA基因進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-05 05:17
流感病毒可引起急性呼吸道傳染病并且該病毒每年都有不同規(guī)模的小流行,若干年一次全球范圍的大流行,給人類健康和經(jīng)濟(jì)的發(fā)展帶來負(fù)面影響。作為流感病毒表面包膜主要的兩種糖蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA),不但與病毒的致病性有關(guān),同時(shí)HA和NA還要承受著外界環(huán)境的選擇壓力,在這些選擇壓力之下往往會(huì)引起HA和NA的變異,也會(huì)增加產(chǎn)生新型病毒的可能性。本研究共分為兩個(gè)方面對(duì)流感病毒不同亞型的共同感染及流感病毒的進(jìn)化進(jìn)行描述。希望借此為闡明流感病毒流行規(guī)律提供新的依據(jù)。第一部分目的:了解一例新甲型H1N1和季節(jié)性H3N2亞型流感混合感染病例中季節(jié)性H3N2亞型流感病毒和新甲型H1N1亞型流感病毒的HA和NA基因的變異情況。方法:鼻咽拭子的核酸樣本和細(xì)胞培養(yǎng)物100倍稀釋的核酸樣本經(jīng)實(shí)時(shí)熒光PCR方法鑒定流感病毒亞型。病毒經(jīng)MDCK細(xì)胞培養(yǎng)后進(jìn)行紅細(xì)胞凝集試驗(yàn)(HA)和紅細(xì)胞凝集抑制試驗(yàn)(HI)。分離病毒毒株,提取核酸經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)方法擴(kuò)增HA和NA基因,獲得測(cè)序結(jié)果與WHO推薦的疫苗株和疫苗相似毒株同源比對(duì),使用生物信...
【文章來源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語
前言
研究現(xiàn)狀、成果
研究目的、方法
一、流感不同亞型混合感染的檢測(cè)及HA和NA片段分析
1.1 對(duì)象和方法
1.1.1 資料來源
1.1.2 方法
1.2 結(jié)果
1.2.1 鼻咽拭子實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)結(jié)果
1.2.2 細(xì)胞培養(yǎng)檢測(cè)結(jié)果
1.2.3 季節(jié)性H3N2亞型流感病毒進(jìn)化樹分析
1.2.4 氨基酸序列同源性分析
1.3 討論
1.4 小結(jié)
二、甲型N9亞型流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進(jìn)化分析
2.1 對(duì)象和方法
2.1.1 資料來源
2.1.2 方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 NA進(jìn)化構(gòu)建結(jié)果
2.2.2 NA進(jìn)化速率結(jié)果
2.2.3 進(jìn)化選擇壓力和氨基酸置換熵值結(jié)果
2.3 討論
2.4 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說明
附錄
綜述 流感病毒NA結(jié)構(gòu)功能與耐藥性研究
綜述參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新型甲型H7N9流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進(jìn)化分析[J]. 關(guān)蔚,林吉,李自雄,韓一芳,蘇彤,張宏偉,曹廣文. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(06)
[2]天津市2007—2010年流感監(jiān)測(cè)及H3亞型毒株HA1基因特性分析[J]. 孔梅,李曉燕,鄒明,蘇旭,郭麗茹,李琳,董曉春,徐文體. 環(huán)境與健康雜志. 2011(11)
[3]中國(guó)大陸季節(jié)性流感活動(dòng)的時(shí)空分布特征[J]. 高燕,方立群,張勇,錢全,李亞品,徐翠玲,張燁,閆磊,楊華,柏延臣,楊紅,曹務(wù)春,舒躍龍. 中華流行病學(xué)雜志. 2009 (11)
[4]流感病毒神經(jīng)氨酸酶不同區(qū)域的作用[J]. 李向忠,方芳,陳則. 生命科學(xué)研究. 2005(S1)
[5]基于A*算法的啟發(fā)式算法求解多序列比對(duì)問題[J]. 袁激光,金人超,李紅濤. 華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2003(09)
[6]針對(duì)基因選擇性剪接的多序列比對(duì)算法研究[J]. 計(jì)宏凱,周晴,聞芳,季梁. 清華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2001(09)
[7]甲型流感病毒抗原變異的機(jī)理[J]. 楊春,余佳. 國(guó)外醫(yī)學(xué).病毒學(xué)分冊(cè). 1999(03)
本文編號(hào):2958097
【文章來源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語
前言
研究現(xiàn)狀、成果
研究目的、方法
一、流感不同亞型混合感染的檢測(cè)及HA和NA片段分析
1.1 對(duì)象和方法
1.1.1 資料來源
1.1.2 方法
1.2 結(jié)果
1.2.1 鼻咽拭子實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)結(jié)果
1.2.2 細(xì)胞培養(yǎng)檢測(cè)結(jié)果
1.2.3 季節(jié)性H3N2亞型流感病毒進(jìn)化樹分析
1.2.4 氨基酸序列同源性分析
1.3 討論
1.4 小結(jié)
二、甲型N9亞型流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進(jìn)化分析
2.1 對(duì)象和方法
2.1.1 資料來源
2.1.2 方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 NA進(jìn)化構(gòu)建結(jié)果
2.2.2 NA進(jìn)化速率結(jié)果
2.2.3 進(jìn)化選擇壓力和氨基酸置換熵值結(jié)果
2.3 討論
2.4 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
發(fā)表論文和參加科研情況說明
附錄
綜述 流感病毒NA結(jié)構(gòu)功能與耐藥性研究
綜述參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]新型甲型H7N9流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進(jìn)化分析[J]. 關(guān)蔚,林吉,李自雄,韓一芳,蘇彤,張宏偉,曹廣文. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(06)
[2]天津市2007—2010年流感監(jiān)測(cè)及H3亞型毒株HA1基因特性分析[J]. 孔梅,李曉燕,鄒明,蘇旭,郭麗茹,李琳,董曉春,徐文體. 環(huán)境與健康雜志. 2011(11)
[3]中國(guó)大陸季節(jié)性流感活動(dòng)的時(shí)空分布特征[J]. 高燕,方立群,張勇,錢全,李亞品,徐翠玲,張燁,閆磊,楊華,柏延臣,楊紅,曹務(wù)春,舒躍龍. 中華流行病學(xué)雜志. 2009 (11)
[4]流感病毒神經(jīng)氨酸酶不同區(qū)域的作用[J]. 李向忠,方芳,陳則. 生命科學(xué)研究. 2005(S1)
[5]基于A*算法的啟發(fā)式算法求解多序列比對(duì)問題[J]. 袁激光,金人超,李紅濤. 華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2003(09)
[6]針對(duì)基因選擇性剪接的多序列比對(duì)算法研究[J]. 計(jì)宏凱,周晴,聞芳,季梁. 清華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2001(09)
[7]甲型流感病毒抗原變異的機(jī)理[J]. 楊春,余佳. 國(guó)外醫(yī)學(xué).病毒學(xué)分冊(cè). 1999(03)
本文編號(hào):2958097
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